| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2609395 = | 79 (0.800) | 6 (0.070) | 5/136 | NT | 9.1% | intergenic (‑225/+336) | USA300HOU_RS13450/USA300HOU_RS13455 | hypothetical protein/putative lipoprotein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2609451 = | 53 (0.630) | intergenic (‑281/+280) | USA300HOU_RS13450/USA300HOU_RS13455 | hypothetical protein/putative lipoprotein | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TCACTATTTTGGAAAATTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATG > USA300TCH1516_ALE/2609305‑2609485 | tCACTATTTTGGAAAATTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTA > 1:442067‑M1/1‑91 (MQ=255)tCACTATTTTGGAAAATTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTA > 1:1790368‑M1/1‑91 (MQ=255)tCACTATTTTGGAAAATTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTA > 1:1789843‑M1/1‑91 (MQ=255)aaagaacggaagtttaatagcttatatgattcttggagctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaa < 1:733037‑M1/1‑1 (MQ=255)aaagaacggaagtttaatagcttatatgattcttggagctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaa < 1:808317‑M1/1‑1 (MQ=255) aCTATTTTGGAAAATTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAA < 1:1263393‑M1/91‑1 (MQ=255) tATTTTGGAAAATTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAG > 1:1625080‑M1/1‑91 (MQ=255) aacggaagtttaatagcttatatgattcttggagctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAg > 1:3060717‑M1/87‑91 (MQ=255) acggaagtttaatagcttatatgattcttggagctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGc > 1:1464135‑M1/86‑91 (MQ=255) aTTTTGGAAAATTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGC < 1:945583‑M1/91‑1 (MQ=255) ttttGGAAAATTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCT < 1:558335‑M1/91‑1 (MQ=255) ttttGGAAAATTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCT > 1:2145185‑M1/1‑91 (MQ=255) cggaagtttaatagcttatatgattcttggagctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCt < 1:1026944‑M1/7‑1 (MQ=255) aagtttaatagcttatatgattcttggagctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAA‑GCTTCTa > 1:2731380‑M1/82‑91 (MQ=255) agtttaatagcttatatgattcttggagctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCTTCTa < 1:285213‑M1/11‑1 (MQ=255) agtttaatagcttatatgattcttggagctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCTTCTa < 1:482926‑M1/11‑1 (MQ=255) gtttaatagcttatatgattcttggagctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCTTCTaa > 1:3392623‑M1/80‑91 (MQ=255) gtttaatagcttatatgattcttggagctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCTTCTaa > 1:2454831‑M1/80‑91 (MQ=255) aaaaTTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAc > 1:29879/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACa > 1:3327499/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACa > 1:566965/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACa > 1:2327727/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACa > 1:3523695/1‑91 (MQ=255) aaTTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACAt < 1:2380606/91‑1 (MQ=255) aGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATAc < 1:2328224/91‑1 (MQ=255) aGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATAc < 1:2328157/91‑1 (MQ=255) aGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATAc < 1:1071805/91‑1 (MQ=255) aaaTATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACgg > 1:2285461/1‑91 (MQ=255) atatTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGaa > 1:1530923/1‑91 (MQ=255) tagttAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAat < 1:2737395/88‑1 (MQ=255) atTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAata < 1:1104336/91‑1 (MQ=255) atTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAata < 1:1104481/91‑1 (MQ=255) tttAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAatat < 1:2812168/91‑1 (MQ=255) tAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTATCATGATACGGAATATGa < 1:2519642/91‑1 (MQ=255) aTTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAgg < 1:325064/91‑1 (MQ=255) aTTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAgg > 1:2036102/1‑91 (MQ=255) ttATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGt < 1:3121093/91‑1 (MQ=255) tatataAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGtt < 1:1164688/91‑1 (MQ=255) atataAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTc < 1:3942598/91‑1 (MQ=255) tataAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTcc < 1:2925351/91‑1 (MQ=255) ataAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAcatgatacaggaacctcatattcc < 1:1424261‑M1/91‑25 (MQ=255) taAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTg < 1:2994943/91‑1 (MQ=255) taAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTg < 1:2661565/91‑1 (MQ=255) taAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTg < 1:924537/91‑1 (MQ=255) taAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTg > 1:3667325/1‑91 (MQ=255) taAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTg < 1:3435923/91‑1 (MQ=255) aaGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTAt < 1:2534109/91‑1 (MQ=255) aagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATc > 1:168949‑M1/51‑91 (MQ=255) gTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatca < 1:3122950‑M1/91‑31 (MQ=255) gTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAcatgatacaggaacctcatattccgtatca < 1:3237034‑M1/91‑31 (MQ=255) gTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATca < 1:78544/91‑1 (MQ=255) gTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATCTGGATGTTCTTTAGGCATTAAAAGCTTTTAAcatgatacaggaacctcatattccgtatca < 1:3318051‑M1/91‑31 (MQ=255) gcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTa > 1:850854‑M1/45‑91 (MQ=255) ataaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAtta > 1:2788885‑M2/1‑88 (MQ=255) ataaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAtta < 1:3437089‑M2/91‑4 (MQ=255) ataaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAtta > 1:1622618‑M2/1‑88 (MQ=255) ataaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAtta > 1:4153274‑M2/1‑88 (MQ=255) ataaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAtta < 1:3388065‑M2/91‑4 (MQ=255) atgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGa > 1:1375852‑M1/43‑91 (MQ=255) aaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTATCATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttaga > 1:3500440‑M2/1‑86 (MQ=255) aaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttaga > 1:2184370‑M2/1‑86 (MQ=255) aaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttaga > 1:3954013‑M2/1‑86 (MQ=255) tgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGaa > 1:2024497‑M1/42‑91 (MQ=255) aGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaa < 1:1897592‑M1/91‑39 (MQ=255) aGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAtcagaa < 1:3448929‑M2/91‑7 (MQ=255) tCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagc < 1:1415524‑M1/91‑41 (MQ=255) cAGCAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAtttgaagct > 1:3220511‑M2/1‑82 (MQ=255) aGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttagaagctt > 1:1929322‑M2/1‑81 (MQ=255) gAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttt < 1:4079639‑M1/91‑44 (MQ=255) gAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttt < 1:4079451‑M1/91‑44 (MQ=255) aaaaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttagaagctttt > 1:2801700‑M2/1‑79 (MQ=255) aaaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagctttta < 1:1468914‑M1/91‑46 (MQ=255) aaaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagctttta < 1:2120450‑M1/91‑46 (MQ=255) aaaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCttttt < 1:2725780/91‑1 (MQ=255) aaaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCttttt < 1:88535/91‑1 (MQ=255) aaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCtttttt > 1:2643611/1‑91 (MQ=255) atatGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttg > 1:579885/1‑91 (MQ=255) atatGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttg < 1:717070/91‑1 (MQ=255) tatGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgt < 1:1897381/91‑1 (MQ=255) tatGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgt < 1:1897270/91‑1 (MQ=255) tatGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgt < 1:3496229/91‑1 (MQ=255) atGATAAAATGTAGCTGTTCGGTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAAGATGAGGGTCCTGTATCACATGAGAATCTTTTttgtg < 1:3743455/91‑2 (MQ=255) atGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgtt > 1:880359/1‑91 (MQ=255) atGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgtt < 1:3409193/91‑1 (MQ=255) tGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgttg > 1:1791477/1‑91 (MQ=255) aTAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCg > 1:1064438/1‑91 (MQ=255) tAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCgg < 1:147721/91‑1 (MQ=255) gTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCATGttagaagcttttaatgtctaaagaaca < 1:112212‑M2/91‑28 (MQ=255) gTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTta > 1:818801/1‑91 (MQ=255) gATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTTTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTatat < 1:3496033/91‑1 (MQ=255) tGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAcatgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttttaatgtctaaagaacatctac < 1:112212‑M1/91‑65 (MQ=255) tAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATgg < 1:2301353/91‑1 (MQ=255) tAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATgg < 1:1969579/91‑1 (MQ=255) tAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATgg > 1:1412976/1‑91 (MQ=255) gACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCa > 1:2012753/1‑91 (MQ=255) gACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCa < 1:1403134/91‑1 (MQ=255) gACATTAAAAGCTTCCAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCGTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCa > 1:3536929/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCatga < 1:4121162/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCatgaa < 1:2821408/91‑1 (MQ=255) aaaaGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatatttt > 1:2801700‑M1/1‑12 (MQ=255) | TCACTATTTTGGAAAATTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATG > USA300TCH1516_ALE/2609305‑2609485 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |