| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2609406 | 71 (0.720) | 13 (0.160) | 8/136 | NT | 18.7% | intergenic (‑236/+325) | USA300HOU_RS13450/USA300HOU_RS13455 | hypothetical protein/putative lipoprotein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2609438 | 53 (0.630) | intergenic (‑268/+293) | USA300HOU_RS13450/USA300HOU_RS13455 | hypothetical protein/putative lipoprotein | |||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
GAAAATTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAACGCATGCTG > USA300TCH1516_ALE/2609316‑2609496 | gtttaatagcttatatgattcttggagctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCTTCTaa > 1:3392623‑M1/80‑91 (MQ=255)gtttaatagcttatatgattcttggagctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCTTCTaa > 1:1454707‑M1/80‑91 (MQ=255) aaaTTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACa > 1:2327727/1‑91 (MQ=255) ttAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGa < 1:2708058/91‑1 (MQ=255) aGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATAc < 1:1071805/91‑1 (MQ=255) aGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATAc < 1:2328157/91‑1 (MQ=255) gAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACg < 1:1825052/91‑1 (MQ=255) atatTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGaa > 1:1530923/1‑91 (MQ=255) tagttAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAat < 1:2737395/88‑1 (MQ=255) atTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAata < 1:1104336/91‑1 (MQ=255) atTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAata < 1:1104481/91‑1 (MQ=255) tAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTATCATGATACGGAATATGa < 1:2519642/91‑1 (MQ=255) aTTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAgg > 1:2036076/1‑91 (MQ=255) aTTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAgg < 1:325064/91‑1 (MQ=255) ttATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGt < 1:3121093/91‑1 (MQ=255) atataAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTc < 1:290881/91‑1 (MQ=255) tataAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTcc < 1:1566137/91‑1 (MQ=255) tataAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTcc < 1:2925351/91‑1 (MQ=255) tataAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTcc < 1:2992430/91‑1 (MQ=255) ataAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAcatgatacaggaacctcatattcc < 1:1424261‑M1/91‑25 (MQ=255) taAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTg < 1:3435923/91‑1 (MQ=255) taAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTg > 1:3667325/1‑91 (MQ=255) taAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTg < 1:924537/91‑1 (MQ=255) agctaagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCTTCTAATGTGATACGGAATATGAGGTTCCTg > 1:3374486‑M1/55‑91 (MQ=255) aaaaGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGt < 1:3488143/91‑1 (MQ=255) aaGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTAt < 1:2534109/91‑1 (MQ=255) aagacagcatgcgttcattcatgccattattaatataagcaccgcaacaaAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATc > 1:168949‑M1/51‑91 (MQ=255) gTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAcatgatacaggaacctcatattccgtatca < 1:3237034‑M1/91‑31 (MQ=255) gTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATca < 1:78544/91‑1 (MQ=255) gTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATCTGGATGTTCTTTAGGCATTAAAAGCTTTTAAcatgatacaggaacctcatattccgtatca < 1:3318051‑M1/91‑31 (MQ=255) tttAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATcac > 1:1317844/1‑91 (MQ=255) ttAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATcaca > 1:679672/1‑91 (MQ=255) ataaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAtta < 1:3437089‑M2/91‑4 (MQ=255) ataaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAtta > 1:2788885‑M2/1‑88 (MQ=255) ataaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAtta < 1:3437088‑M2/91‑4 (MQ=255) ataaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAtta > 1:4153274‑M2/1‑88 (MQ=255) ataaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAtta < 1:812329‑M2/91‑4 (MQ=255) aaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTATCATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttaga > 1:3500440‑M2/1‑86 (MQ=255) aaGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttaga > 1:3954013‑M2/1‑86 (MQ=255) aGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccggatcatgttagaa < 1:3196022‑M1/91‑39 (MQ=255) aGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttagaa < 1:111285‑M2/91‑7 (MQ=255) tCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagc < 1:1415524‑M1/91‑41 (MQ=255) aGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttagaagctt > 1:1929322‑M2/1‑81 (MQ=255) aGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttagaagctt < 1:378161‑M2/91‑11 (MQ=255) gAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttt < 1:4079451‑M1/91‑44 (MQ=255) gAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttt < 1:4079639‑M1/91‑44 (MQ=255) aaaaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttagaagctttt > 1:2801700‑M2/1‑79 (MQ=255) aaaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagctttta < 1:2120450‑M1/91‑46 (MQ=255) aaaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCttttt < 1:2725780/91‑1 (MQ=255) aaaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCttttt > 1:2329834/1‑91 (MQ=255) aaaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCttttt > 1:2818288/1‑91 (MQ=255) aaaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCttttt < 1:88535/91‑1 (MQ=255) aaTATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCtttttt > 1:2643611/1‑91 (MQ=255) atatGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttg > 1:579885/1‑91 (MQ=255) atatGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttg < 1:717070/91‑1 (MQ=255) tatGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgt < 1:3496412/91‑1 (MQ=255) tatGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgt < 1:3496229/91‑1 (MQ=255) tatGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgt < 1:1897270/91‑1 (MQ=255) tatGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgt < 1:1897381/91‑1 (MQ=255) atGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgtt > 1:880359/1‑91 (MQ=255) atGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgtt < 1:3409193/91‑1 (MQ=255) tGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTttgttg < 1:2795486/91‑1 (MQ=255) gATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGc < 1:522494/91‑1 (MQ=255) gATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGc > 1:1688439/1‑91 (MQ=255) aTAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCg > 1:1064438/1‑91 (MQ=255) gTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCATGttagaagcttttaatgtctaaagaaca < 1:112212‑M2/91‑28 (MQ=255) gTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTta > 1:818801/1‑91 (MQ=255) aGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTtata < 1:1161936/91‑1 (MQ=255) tAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACGTTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATgg < 1:1970043/91‑1 (MQ=255) tAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATgg < 1:2301353/91‑1 (MQ=255) gACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCa > 1:2012753/1‑91 (MQ=255) gACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCa < 1:1403134/91‑1 (MQ=255) gACATTAAAAGCTTCCAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCGTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCa > 1:3536929/1‑91 (MQ=255) ttAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCatgaa < 1:2821408/91‑1 (MQ=255) tAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatattt < 1:1468914‑M2/91‑47 (MQ=255) aaaGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatattttc < 1:4079639‑M2/91‑49 (MQ=255) AAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCatgaatga > 1:317481‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCatgaatga < 1:1941673‑M1/91‑1 (MQ=255) aaGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatattttct > 1:1929322‑M1/1‑10 (MQ=255) aaGCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatattttct < 1:378161‑M1/91‑82 (MQ=255) AAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCAtgaatgaa < 1:1408578‑M1/91‑1 (MQ=255) aGCTTCAAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatatttgctg > 1:3220511‑M1/1‑9 (MQ=255) AGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAAc > 1:3557210‑M1/1‑91 (MQ=255) gCTTCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatattttctga > 1:852654‑M1/1‑8 (MQ=255) CTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAACGc > 1:3945842‑M1/1‑91 (MQ=255) CTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAACGc > 1:3964956‑M1/1‑91 (MQ=255) ttCTGAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatattttctgact < 1:3448929‑M1/91‑86 (MQ=255) ttCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACAttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatattttctgact < 1:1897592‑M2/91‑54 (MQ=255) TTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAACGCa > 1:3025252‑M1/1‑91 (MQ=255) TTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAACGCa > 1:2220110‑M1/1‑91 (MQ=255) tCTAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatattttctgactt > 1:2184370‑M1/1‑5 (MQ=255) CTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAACGCATg < 1:3049314‑M1/91‑1 (MQ=255) CTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAACGCATg > 1:2408146‑M1/1‑91 (MQ=255) CTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAACGCATg > 1:2224238‑M1/1‑91 (MQ=255) CTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAACGCATg > 1:2408145‑M1/1‑91 (MQ=255) CTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTCTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAACGCATg < 1:4152686‑M1/91‑1 (MQ=255) tAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatattttctgacttat < 1:3388065‑M1/91‑89 (MQ=255) tAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatattttctgacttat < 1:247‑M1/91‑89 (MQ=255) tAAtgtgatacaggaacctcatattccgtatcatgttagaagcttttaatgtctaaagaacatctacattttatcatattttctgacttat > 1:1622618‑M1/1‑3 (MQ=255) TAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAACGCATGc < 1:2114866‑M1/91‑1 (MQ=255) | GAAAATTAAGAAATATTTAATTATATAAAAGTTTAATAAGTCAGAAAATATGATAAAATGTAGATGTTCTTTAGACATTAAAAGCTTCTAACATGATACGGAATATGAGGTTCCTGTATCACATTAGAAGCTTTTTTGTTGCGGTGCTTATATTAATAATGGCATGAATGAACGCATGCTG > USA300TCH1516_ALE/2609316‑2609496 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |