| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | = 1692 | 388 (1.110) | 21 (0.070) | 7/144 | NT | 5.4% | intergenic (+477/‑379) | repA/USA300HOU_pUSA300HOUMR0003 | replication protein A/hypothetical protein |
| ? | CP000731 | = 1696 | 387 (1.230) | intergenic (+481/‑375) | repA/USA300HOU_pUSA300HOUMR0003 | replication protein A/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 632 total aligned reads displayed.
GTCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAAAAGCCCTGCAG > CP000731/1602‑1782 | acaAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCAttttt > 1:1648400/1‑91 (MQ=255) acaAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTcaa < 1:2524346‑M1/91‑4 (MQ=255) aaaaGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTcaaaa < 1:730133‑M1/91‑6 (MQ=255) aaaGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTcaaaaa < 1:4116842‑M1/91‑7 (MQ=255) aaaGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCACTTTTGaa < 1:2082796‑M2/91‑3 (MQ=255) ttttgtgacaCTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGaat < 1:2902100‑M2/88‑4 (MQ=255) aaGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTcaaaaat < 1:147134‑M1/91‑8 (MQ=255) aaGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTcaaaaat < 1:697035‑M1/91‑8 (MQ=255) aGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGaatg < 1:1113601‑M2/91‑5 (MQ=255) gtgtGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTcaaaaatga < 1:4055307‑M1/91‑10 (MQ=255) tgtgACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGaatgat < 1:1744087‑M2/91‑7 (MQ=255) tgtgACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGaatgat > 1:2008329‑M2/1‑85 (MQ=255) gtgACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTcaaaaatgata < 1:3880508‑M1/91‑12 (MQ=255) tgACACTACAGCTTTGTATGATGTCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGaatgatag < 1:665602‑M2/91‑9 (MQ=255) tgACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGaatgatag < 1:3212655‑M2/91‑9 (MQ=255) tgACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGaatgatag < 1:1442083‑M2/91‑9 (MQ=255) tgACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGaatgatag > 1:2704446‑M2/1‑83 (MQ=255) tgACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGaatgatag < 1:640449‑M2/91‑9 (MQ=255) tgACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACACTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGaatgatag < 1:215848‑M2/91‑9 (MQ=255) gACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGc > 1:3823157/1‑91 (MQ=255) acacTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGTATGATAGCa < 1:2091128/91‑1 (MQ=255) acacTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCa > 1:3060350/1‑91 (MQ=255) acacTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCa > 1:3554308/1‑91 (MQ=255) acTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCAATCATTTTTGAATGATAGCaaa > 1:1968567/1‑91 (MQ=255) cTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAAt < 1:231202/91‑1 (MQ=255) cTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAAt < 1:292105/91‑1 (MQ=255) tACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAAtt > 1:452727/1‑91 (MQ=255) tACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAAtt < 1:1137909/91‑1 (MQ=255) aGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTcc > 1:1820107/1‑91 (MQ=255) aGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTcc > 1:4153938/1‑91 (MQ=255) gCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTccc < 1:2738842/91‑1 (MQ=255) ttGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTa > 1:3737508/1‑91 (MQ=255) ttGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTa > 1:2252431/1‑91 (MQ=255) tGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTAt > 1:1180097/1‑91 (MQ=255) gTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATg > 1:3110397/1‑91 (MQ=255) gTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATg > 1:3778738/1‑91 (MQ=255) gTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATg > 1:883321/1‑91 (MQ=255) aTGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGAGCTATCATTCAAAaatgatagatctggcaaggccagac > 1:3258025‑M2/1‑66 (MQ=255) tatCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTa < 1:3946639/91‑1 (MQ=255) tatCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTa > 1:1422490/1‑91 (MQ=255) tCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACg < 1:1924259/91‑1 (MQ=255) tCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACg < 1:2489382/91‑1 (MQ=255) cACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACgg > 1:3371912/1‑91 (MQ=255) cACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACgg > 1:4000331/1‑91 (MQ=255) cACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACgg < 1:1215784/91‑1 (MQ=255) tAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGAtt > 1:3677267/1‑91 (MQ=255) aaaTAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGAtttt < 1:3350946/91‑1 (MQ=255) aaTAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTa > 1:1069088/1‑91 (MQ=255) aCTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGt > 1:2797356/1‑91 (MQ=255) aCTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGt < 1:115843/91‑1 (MQ=255) aCTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGt < 1:1892994/91‑1 (MQ=255) cTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGtt > 1:624851/1‑91 (MQ=255) ttAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGtta > 1:1589652/1‑91 (MQ=255) aaaaCCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGttaaa < 1:831706/91‑1 (MQ=255) aaaCCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGttaaat > 1:2637403/1‑91 (MQ=255) aaaCCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGttaaat > 1:3161213/1‑91 (MQ=255) aaaCCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGttaaat > 1:2033086/1‑91 (MQ=255) aaCCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGttaaatt < 1:2679923/91‑1 (MQ=255) cTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTaaaa > 1:2284320/1‑91 (MQ=255) ttGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAAt > 1:1281530/1‑91 (MQ=255) tGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAAtt > 1:1912816/1‑91 (MQ=255) ggAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAAttt > 1:2995760/1‑91 (MQ=255) ggAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAAttt > 1:752417/1‑91 (MQ=255) ggAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAAttt < 1:1766668/91‑1 (MQ=255) gAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTc > 1:2414620/1‑91 (MQ=255) gAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTc < 1:3913353/91‑1 (MQ=255) gAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATAATTTTTGAATGATGGCAAATTTCCCTTGTGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTc < 1:3859363/91‑1 (MQ=255) aaTGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCt < 1:504080/91‑1 (MQ=255) aaTGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCt < 1:858224/91‑1 (MQ=255) tCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGt < 1:587786/91‑1 (MQ=255) ctggcaaggccagatCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGtt > 1:1707550‑M2/16‑91 (MQ=255) tggcaaggccagatCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGttt > 1:261508‑M2/15‑91 (MQ=255) tGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGttt < 1:2355854/91‑1 (MQ=255) tGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGttt > 1:3246591/1‑91 (MQ=255) gCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGttttt > 1:2119909/1‑91 (MQ=255) ccTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTg < 1:2393745/91‑1 (MQ=255) aaggCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGa > 1:951068/4‑91 (MQ=255) ttGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGAt < 1:2875555/91‑1 (MQ=255) tGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATa < 1:2944550/91‑1 (MQ=255) ggCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATa > 1:1359896/2‑91 (MQ=255) aGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGaa > 1:1504132/1‑91 (MQ=255) gATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGaaa > 1:3086583/1‑91 (MQ=255) gATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGaaa < 1:1521322/91‑1 (MQ=255) gATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGCTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGaaa > 1:3531057/1‑91 (MQ=255) tCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAAAAg > 1:2425846/1‑91 (MQ=255) cTATGATTcaaaaatgatagatctggcaaggccagacattccaagggttttaagttattttaaagtgatatcatacaaagctgtagtgtca < 1:3454678‑M1/91‑84 (MQ=255) cTATCATTcaaaaatgatagatctggcaaggccagacattccaagggttttaagttattttaaagtgatatcatacaaagctgtagtgtca > 1:1612439‑M1/1‑8 (MQ=255) cTATCATTcaaaaatgatagatctggcaaggccagacattccaagggttttaagttattttaaagtgatatcatacaaagctgtagtgtca < 1:3072608‑M1/91‑84 (MQ=255) cTATCATTcaaaaatgatagatctggcaaggccagacattccaagggttttaagttattttaaagtgatatcatacaaagctgtagtgtca > 1:1248869‑M1/1‑8 (MQ=255) tATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAAAAGcc < 1:3031912/91‑1 (MQ=255) aTCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAAAAGccc < 1:544811/91‑1 (MQ=255) aTCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAAAAGccc > 1:3961277/1‑91 (MQ=255) tCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAAAAGCCCt > 1:100163/1‑91 (MQ=255) aTTcaaaaatgatagatctggcaaggccagacattccaagggttttaagttattttaaagtgatatcatacaaagctgtagtgtcacaaaa < 1:1544351‑M1/91‑89 (MQ=255) aTTTTTGAATGGTAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAAAAGCCCTGc < 1:3760326/91‑1 (MQ=255) aTTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAAAAGCCCTGc < 1:330797/91‑1 (MQ=255) aTTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAAAAGCCCTGc > 1:4077984/1‑91 (MQ=255) aTTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAAAAGCCCTGc < 1:2226589/91‑1 (MQ=255) ttcaaaaatgatagatctggcaaggccagacattccaagggttttaagttattttaaagtgatatcatacaaagctgtagtgtcacacttt < 1:3493802‑M1/91‑90 (MQ=255) tcaaaaatgatagatctggcaaggccagacattccaagggttttaagttattttaaagtgatatcatacaaagctgtagtgtcacactttt < 1:3636612‑M1/91‑91 (MQ=255) | GTCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAAAAGCCCTGCAG > CP000731/1602‑1782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |