| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | = 1195 | 4796 (0.480) | 475 (0.050) | 37/144 | NT | 9.4% | intergenic (‑1/‑384) | USA300HOU_RS15665/USA300HOU_RS14895 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | = 1199 | 4795 (0.530) | intergenic (‑5/‑380) | USA300HOU_RS15665/USA300HOU_RS14895 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 14337 total aligned reads displayed.
GTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAG > NC_012417/1105‑1285 | cacaaaaataagacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAtttt > 1:411438‑M2/20‑91 (MQ=255) aaaaaTAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTcaaaa < 1:3144157‑M1/91‑6 (MQ=255) aaaaTAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGaa > 1:2310634‑M2/1‑89 (MQ=255) gcagggcgttttttatcaaaaatcgagaatttttaatttttctctaaaaactccgtaagagcataaggagaatttgCTATCATTTTTGAAt > 1:1000110‑M1/77‑91 (MQ=255) aaTAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTcaaaaatg < 1:3732119‑M1/91‑9 (MQ=255) aaGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGaatgata > 1:275789‑M2/1‑84 (MQ=255) aGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGaatgatag > 1:2383219‑M2/1‑83 (MQ=255) aGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGaatgatag > 1:1896292‑M2/1‑83 (MQ=255) aGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGaatgatag < 1:3464058‑M2/91‑9 (MQ=255) aGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGaatgatag < 1:3621429‑M2/91‑9 (MQ=255) aGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTCTTGaatgatag < 1:3768410‑M2/91‑9 (MQ=255) gacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGc > 1:3918021‑M2/9‑91 (MQ=255) gacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGCCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGc > 1:3541723‑M2/9‑91 (MQ=255) acagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCa > 1:1277844‑M2/8‑91 (MQ=255) cagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCaa > 1:1078388‑M2/7‑91 (MQ=255) agtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCaaa > 1:2535617‑M2/6‑91 (MQ=255) gtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAAt > 1:2158251‑M2/5‑91 (MQ=255) gtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAAt < 1:811374‑M2/87‑1 (MQ=255) cAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATtct > 1:2571531‑M2/2‑91 (MQ=255) gCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTcc > 1:622331/1‑91 (MQ=255) gCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTcc > 1:2642588/1‑91 (MQ=255) cTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCt < 1:1319597/91‑1 (MQ=255) tttGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCtt < 1:2717738/91‑1 (MQ=255) gTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATg > 1:853369/1‑91 (MQ=255) gTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATg > 1:963513/1‑91 (MQ=255) gTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATg < 1:3806284/91‑1 (MQ=255) gTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATg > 1:1197885/1‑91 (MQ=255) tATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGc < 1:520997/91‑1 (MQ=255) tATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGc < 1:4017200/91‑1 (MQ=255) tATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGACAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGc < 1:3588265/91‑1 (MQ=255) tATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAACTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGc > 1:3501109/1‑91 (MQ=255) aTGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGct > 1:2010850/1‑91 (MQ=255) gATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGctct < 1:2605478/91‑1 (MQ=255) atatCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCtt > 1:2678003/1‑91 (MQ=255) atatCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCtt > 1:223256/1‑91 (MQ=255) tatCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTa < 1:2908818/91‑1 (MQ=255) tatCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTa > 1:1822236/1‑91 (MQ=255) tCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACg < 1:77673/91‑1 (MQ=255) tCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACg > 1:1432558/1‑91 (MQ=255) tCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACg < 1:2992246/91‑1 (MQ=255) aCTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGa > 1:1584822/1‑91 (MQ=255) aaaaTACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGtttt > 1:3106807/1‑91 (MQ=255) aTACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATCGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTCTag > 1:1745560/1‑91 (MQ=255) aTACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTag > 1:657680/1‑91 (MQ=255) aTACATTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTag > 1:3423274/1‑91 (MQ=255) tACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTaga < 1:2830514/91‑1 (MQ=255) aCCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGtttttctct < 1:582544/91‑5 (MQ=255) aCCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTagag > 1:4076277/1‑91 (MQ=255) aCCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTagag < 1:3983699/91‑1 (MQ=255) aCCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTagag < 1:3952441/91‑1 (MQ=255) aCCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTagag < 1:1782007/91‑1 (MQ=255) ccTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCGTTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAgaga > 1:3313128/1‑91 (MQ=255) ccTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAgaga > 1:1933199/1‑91 (MQ=255) ttAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGaaa > 1:3214575/1‑91 (MQ=255) aaaaCCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGaaaaa > 1:1461923/1‑91 (MQ=255) aaCCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGaaaaatt < 1:2116729/91‑1 (MQ=255) cccTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTNTTACGGAGNTTTTAGAGAAAAATTAAA < 1:3389081‑M1/91‑1 (MQ=255) cccTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAA < 1:2340092‑M1/91‑1 (MQ=255) gAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATtc < 1:2083792/91‑1 (MQ=255) aaTTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATtct > 1:2272260/1‑91 (MQ=255) ggtctggcaaagccagaCCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCg > 1:1544313‑M2/18‑91 (MQ=255) ggtctggcaaagccagaCCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCg > 1:551785‑M2/18‑91 (MQ=255) ttCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGa < 1:2418066‑M2/91‑2 (MQ=255) ttCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGa < 1:3842619‑M2/91‑2 (MQ=255) ttCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGa > 1:736907‑M2/1‑90 (MQ=255) ttCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGCTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGa < 1:3277699‑M2/91‑2 (MQ=255) gtctggcaaagccagaCCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGa > 1:1398090‑M2/17‑91 (MQ=255) TCTGGCTTTGTCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGAt < 1:2950158‑M1/91‑1 (MQ=255) CTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGAtt > 1:1159895‑M1/1‑91 (MQ=255) CTGGCTTTGCCAAACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGAtt < 1:3182558‑M1/91‑1 (MQ=255) TGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGAttt > 1:1116335‑M1/1‑91 (MQ=255) TGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGAttt < 1:701892‑M1/91‑1 (MQ=255) ggCTGTGCCAGACGTGTCGTTcaaaaatgataggtctggcaaagccagaaattccaggggttttaaggtattttaaagtgatatcatacaa < 1:286763‑M1/91‑71 (MQ=255) GGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGAtttt < 1:3031161‑M1/91‑1 (MQ=255) tGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATa < 1:2450048/91‑1 (MQ=255) agccagaCCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATa > 1:3655692‑M2/8‑91 (MQ=255) agccagaCCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATa > 1:388187‑M2/8‑91 (MQ=255) agccagaCCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATa > 1:2486299‑M2/8‑91 (MQ=255) gccagaCCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTtatca < 1:2193589‑M2/85‑3 (MQ=255) gccagaCCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATaa > 1:1703340‑M2/7‑91 (MQ=255) gccagaCCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATaa > 1:1622165‑M2/7‑91 (MQ=255) gccagaCCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATaa < 1:3070568‑M2/85‑1 (MQ=255) agaCCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATaaaaa < 1:3691885‑M2/88‑1 (MQ=255) gaCCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATaaaaaa < 1:1972249‑M2/89‑1 (MQ=255) ccTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAAcg < 1:888455‑M2/91‑3 (MQ=255) ccTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAAcg < 1:2796459‑M2/91‑3 (MQ=255) cTATCATTcaaaaatgataggtctggcaaagccagaaattccaggggttttaaggtattttaaagtgatatcatacaaagctgtactgtct < 1:1663403‑M1/91‑84 (MQ=255) cTATCATTcaaaaatgataggtctggcaaagccagaaattccaggggttttaaggtattttaaagtgatatcatacaaagctgtactgtct > 1:484490‑M1/1‑8 (MQ=255) cTATCATTcaaaaatgataggtctggcaaagccagaaattccaggggttttaaggtattttaaagtgatatcatacaaagctgtactgtct > 1:3354799‑M1/1‑8 (MQ=255) CTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGc > 1:1036641‑M1/1‑91 (MQ=255) TCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCt > 1:13578‑M1/1‑91 (MQ=255) TCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCt < 1:4047231‑M1/91‑1 (MQ=255) cATTTTTGaatgataggtctggcaaagccagaaattccaggggttttaaggtattttaaagtgatatcatacaaagctgtactgtcttatt < 1:1234910‑M2/91‑84 (MQ=255) cATTTTTGaatgataggtctggcaaagccagaaattccaggggttttaaggtattttaaagtgatatcatacaaagctgtactgtcttatt < 1:2039246‑M2/91‑84 (MQ=255) cATTTTTGaatgataggtctggcaaagccagaaattccaggggttttaaggtattttaaagtgatatcatacaaagctgtactgtcttatt < 1:924087‑M2/91‑84 (MQ=255) aTTTTTGaatgataggtctggcaaagccagaaattccaggggttttaaggtattttaaagtgatatcatacaaagctgtactgtcttattt < 1:443685‑M2/91‑85 (MQ=255) aTTTTTGaatgataggtctggcaaagccagaaattccaggggttttaaggtattttaaagtgatatcatacaaagctgtactgtcttattt < 1:1862929‑M2/91‑85 (MQ=255) ATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGc > 1:414531‑M1/1‑91 (MQ=255) TTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCa > 1:3243233‑M1/1‑91 (MQ=255) tcaaaaatgataggtctggcaaagccagaaattccaggggttttaaggtattttaaagtgatatcatacaaagctgtactgtcttattttt < 1:1503470‑M1/91‑91 (MQ=255) | GTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAG > NC_012417/1105‑1285 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |