New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 22769 | 94 (0.960) | 6 (0.060) | 5/152 | NT | 6.6% | coding (305/1284 nt) | purA | Adenylosuccinate synthetase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 22794 | 81 (0.870) | coding (330/1284 nt) | purA | Adenylosuccinate synthetase |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TCGTTGTTGATCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATGAAGAACGTTTACGTGGTGACAATAAGATTGGTACAACTAAAAAAGGTAT > USA300TCH1516_ALE/22679‑22859 | tCGTTGTTGATCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGC > 1:2534473‑M1/1‑91 (MQ=255) cGTTGTTGATCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTgcg > 1:1200530/1‑91 (MQ=255) tgttgATCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCaa < 1:3161645/91‑1 (MQ=255) tgttgATCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCaa < 1:1108559/91‑1 (MQ=255) tgttgATCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCaa > 1:1427839/1‑91 (MQ=255) tgttgATCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGCGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCaa > 1:1427934/1‑91 (MQ=255) tgttgATCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGAATAAATGAACGTGGCATTCCTTCAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCaa > 1:3527585/1‑91 (MQ=255) gttgATCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAg < 1:1687408/91‑1 (MQ=255) ttgATCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGt < 1:3976839/91‑1 (MQ=255) ttgATCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGt < 1:3894644/91‑1 (MQ=255) tgATCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTg < 1:745340/91‑1 (MQ=255) aTCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGAt < 1:95513/91‑1 (MQ=255) tCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGAtt < 1:2844209/91‑1 (MQ=255) tCCAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGAtt < 1:2000964/91‑1 (MQ=255) ccAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGAttt > 1:3495592/1‑91 (MQ=255) ccAGTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGAttt > 1:2677555/1‑91 (MQ=255) gTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTAc < 1:2218633/91‑1 (MQ=255) gTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTAc > 1:3364682/1‑91 (MQ=255) gTTGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTAc < 1:196618/91‑1 (MQ=255) ttGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTAcc > 1:976282/1‑91 (MQ=255) ttGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTAcc > 1:920822/1‑91 (MQ=255) tGCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCa < 1:1142958/91‑1 (MQ=255) gCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCat < 1:1090095/91‑1 (MQ=255) gCACTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCat < 1:2013821/91‑1 (MQ=255) aCTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCatat > 1:463303/1‑91 (MQ=255) cTATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGNACGTNGCATTCCTACANGTAATTTACGTATANCTAATCGTGCgcaagtgatatggtaaaatc < 1:1324777‑M1/91‑21 (MQ=255) tATTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCtaagtgatatggtaaaatcac < 1:1848544‑M1/91‑22 (MQ=255) aTTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATccc > 1:2059394/1‑89 (MQ=255) aTTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCAc < 1:377843/91‑1 (MQ=255) aTTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCAc > 1:400711/1‑91 (MQ=255) aTTGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCAc < 1:1112949/91‑1 (MQ=255) ttGAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCtaagtgatatggtaaaatcactt < 1:1394187‑M1/91‑24 (MQ=255) gAAAGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTa < 1:1948590/91‑1 (MQ=255) aGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCtaagtgatatggtaaaatcacttgcgca < 1:3122013‑M1/91‑29 (MQ=255) aGAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATATACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAgca > 1:1979167‑M2/1‑88 (MQ=255) gAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAgcac > 1:285418‑M2/1‑87 (MQ=255) gAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAgcac > 1:434598‑M2/1‑87 (MQ=255) gAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAgcac > 1:3710469‑M2/1‑87 (MQ=255) gAATTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAgcac > 1:3710008‑M2/1‑87 (MQ=255) aaTTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGcaca > 1:1699296/1‑91 (MQ=255) aTTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACaa > 1:3086335/1‑91 (MQ=255) aTTAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACaa < 1:559815/91‑1 (MQ=255) ttAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAg > 1:1315640/1‑91 (MQ=255) ttAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAg > 1:106889/1‑91 (MQ=255) ttAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAg < 1:1743815/91‑1 (MQ=255) tAGACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGa < 1:559775/91‑1 (MQ=255) gACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATg < 1:2220281/91‑1 (MQ=255) gACGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCCAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATg > 1:4140279/1‑91 (MQ=255) aCGGATTAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGa > 1:663176/1‑91 (MQ=255) ttAAATGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATg < 1:105965/91‑1 (MQ=255) aaaTGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATgaa > 1:401940/1‑91 (MQ=255) aaaTGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATgaa > 1:1508945/1‑91 (MQ=255) aaaTGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATgaa > 1:2581651/1‑91 (MQ=255) aaaTGAACGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATgaa > 1:2581026/1‑91 (MQ=255) aaCGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATGAAGAACg > 1:516097/1‑91 (MQ=255) aCGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATGAAGATCGt > 1:3336988/1‑91 (MQ=255) aCGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATGAAGAACGt > 1:562401/1‑91 (MQ=255) aCGTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATGAAGAACGt < 1:1626717/91‑1 (MQ=255) gTGGCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATGAAGAACGttt < 1:3456679/91‑1 (MQ=255) tggtaTTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATGAAGAACGTTTa < 1:658619/87‑1 (MQ=255) ggCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATGAAGAACGTGTAc > 1:3217674/1‑91 (MQ=255) gCATTCCTACAAGTAATTTACGTATATCTAATCGTGCGCAAGTGATTTTACCATATCACTTAGCACAAGATGAATATGAAGAACGTTTACg < 1:3700709/91‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |