| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 146925 | 95 (0.970) | 7 (0.080) | 5/142 | NT | 7.6% | intergenic (+71/‑141) | USA300HOU_RS00660/butA | hypothetical protein/Diacetyl reductase [(S)‑acetoin forming] |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 146945 | 87 (1.000) | intergenic (+91/‑121) | USA300HOU_RS00660/butA | hypothetical protein/Diacetyl reductase [(S)‑acetoin forming] | |||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
ATGTCTCGAAAAAAGATTGATGACAAACTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAAT > USA300TCH1516_ALE/146835‑147015 | aTGTCTCGAAAAAAGATTGATGACAAACTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCA < 1:510471‑M1/91‑1 (MQ=255)aTGTCTCGAAAAAAGATTGATGACAAACTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCA > 1:2023146‑M1/1‑91 (MQ=255) tGTCTCGAAAAAAGATTGATGACAAACTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCAt < 1:848607/91‑1 (MQ=255) tGTCTCGAAAAAAGATTGATGACAAACTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATGTAAACGCAt > 1:3971324/1‑91 (MQ=255) gTCTCGAAAAAAGATTGATGACAAACTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCAtt > 1:1049293/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGATTGATGACAAACTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAAt > 1:1002336/1‑91 (MQ=255) 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aCTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCActaccattagtgattggcaatgcgtt < 1:2492440‑M1/91‑27 (MQ=255) aCTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGtgcgtt > 1:3756557‑M2/1‑85 (MQ=255) aCTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGtgcgtt > 1:2172626‑M2/1‑85 (MQ=255) aCTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGtgcgtt > 1:1385345‑M2/1‑85 (MQ=255) cTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGtgcgttt < 1:553714‑M2/91‑8 (MQ=255) tAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCActaccattagtgattggcaatgcgttta < 1:2143269‑M1/91‑29 (MQ=255) tAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGtgcgttta < 1:3064181‑M2/91‑9 (MQ=255) tAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGtgcgttta < 1:1581612‑M2/91‑9 (MQ=255) aaTCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGtgcgtttaa < 1:3412137‑M2/91‑10 (MQ=255) aTCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAAc > 1:944094/1‑91 (MQ=255) aTCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAAc > 1:4109401/1‑91 (MQ=255) agagaCTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAACtata > 1:3958652/1‑91 (MQ=255) agagaCTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAACtata > 1:3958492/1‑91 (MQ=255) gagaCTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAACTATAc > 1:389664/1‑91 (MQ=255) gagaCTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAACTATAc > 1:1979146/1‑91 (MQ=255) gagaCTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAACTATAc > 1:458890/1‑91 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |