BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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                agaCTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAACTATAcc                                                                            <  1:976473/91‑1 (MQ=255)

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                          aaaTAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCt                                                                  <  1:390901/91‑1 (MQ=255)

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                                                                      aTTGCCAATCACTAATGGTAGtgcgtttaaatgtcgttttaaaagttcttatgttgaatattatttttttaagtctctcgattagtttgtc                      <  1:449915‑M2/91‑71 (MQ=255)

                                                                          ccAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAag                  <  1:3931765/91‑1 (MQ=255)

                                                                          ccAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAAGATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAag                  <  1:3931764/91‑1 (MQ=255)

                                                                            aaTCACTAATGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAagag                <  1:929204/91‑1 (MQ=255)

                                                                                aCTAATGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCAGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTCGTACTATTCAAATGAAGAGGAGt            >  1:816832/1‑91 (MQ=255)

                                                                                 cTAATGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAAGAGGAGTa           <  1:925997/91‑1 (MQ=255)

                                                                                 cTAATGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAAGAGGAGTa           <  1:1095080/91‑1 (MQ=255)

                                                                                 cTAATGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAAGAGGAGTa           <  1:1094792/91‑1 (MQ=255)

                                                                                    aTGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAAGAGGAGTaaaa        >  1:4017173/1‑91 (MQ=255)

                                                                                     tGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAAGAGGAGTAAAAt       >  1:1544394/1‑91 (MQ=255)

                                                                                     tGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAAGAGGAGTAAAAt       <  1:2585218/91‑1 (MQ=255)

                                                                                         aGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAAGAGGAGTAAAATGTaa   >  1:117295/1‑91 (MQ=255)

                                                                                         aGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAAGAGGAGTAAAATGTaa   <  1:2659299/91‑1 (MQ=255)

                                                                                         aGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAAGAGGAGTAAAATGTaa   >  1:3244547/1‑91 (MQ=255)

                                                                                          gTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAAGAGGAGTAAAATGTAAt  <  1:2188358/91‑1 (MQ=255)

TGACAAACTAATCGAGAGACTTAAAAAAATAATATTCAACATAAGAACTTTTAAAACGACATTTAAACGCATTGCCAATCACTAATGGTAGTGCGTTTAACTATACCTTAAATATCTGAATATTTTGTTAAATGGAGCTACCTTTGTTGTACTATTCAAATGAAGAGGAGTAAAATGTAAT  >  USA300TCH1516_ALE/146855‑147035

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.