| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 173490 = | 94 (0.960) | 6 (0.070) | 5/146 | NT | 7.1% | coding (2390/2610 nt) | adhE | Aldehyde‑alcohol dehydrogenase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 173521 = | 72 (0.800) | coding (2421/2610 nt) | adhE | Aldehyde‑alcohol dehydrogenase | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TATTCCCTAAATATGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAA > USA300TCH1516_ALE/173400‑173578 | tattCCCTAAATATGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACt < 1:841970/91‑1 (MQ=255)tattCCCTAAATATGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACt > 1:2404210/1‑91 (MQ=255) ttCCCTAAATATGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCg < 1:3610488/91‑1 (MQ=255) tgccattctatcaattgactcatttaattcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCg > 1:2985068‑M1/89‑91 (MQ=255) tgccattctatcaattgactcatttaattcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCg > 1:3100435‑M1/89‑91 (MQ=255) tgccattctatcaattgactcatttaattcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCg < 1:2376865‑M1/3‑1 (MQ=255) tCCCTAAATATGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGt < 1:1876063/91‑1 (MQ=255) tCCCTAAATATGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGt < 1:217910/91‑1 (MQ=255) gccattctatcaattgactcatttaattcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCGt < 1:2651357‑M1/4‑1 (MQ=255) gccattctatcaattgactcatttaattcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCGt > 1:3479694‑M1/88‑91 (MQ=255) cccTAAATATGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTa < 1:509133/91‑1 (MQ=255) ccattctatcaattgactcatttaattcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCGTa < 1:871802‑M1/5‑1 (MQ=255) ccattctatcaattgactcatttaattcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCGTa < 1:1725887‑M1/5‑1 (MQ=255) ccTAAATATGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAg < 1:1376228/91‑1 (MQ=255) ccTAAATATGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAg < 1:2954174/91‑1 (MQ=255) ccTAAATATGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAg > 1:558579/1‑91 (MQ=255) ccTAAATATGAGGTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAg > 1:3194977/1‑91 (MQ=255) cattctatcaattgactcatttaattcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCGTAg < 1:948324‑M1/6‑1 (MQ=255) cTAAATATGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGa > 1:2280029/1‑91 (MQ=255) attctatcaattgactcatttaattcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCGTAGa > 1:1016519‑M1/85‑91 (MQ=255) atatGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCa < 1:1014406/91‑1 (MQ=255) atatGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCa < 1:1014405/91‑1 (MQ=255) tatGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCAt < 1:618521/91‑1 (MQ=255) atGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCATATTCTTCGGATCAATAGGTAATCCTACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCAtt > 1:3559184/1‑91 (MQ=255) atGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCAtt < 1:1419098/91‑1 (MQ=255) atGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCAtt > 1:3945665/1‑91 (MQ=255) atGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCAtt > 1:3945897/1‑91 (MQ=255) aGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGc < 1:3412910/91‑1 (MQ=255) aGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGc < 1:4027643/91‑1 (MQ=255) aGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGc < 1:2968556/91‑1 (MQ=255) tcttcAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTaa < 1:2558975/91‑1 (MQ=255) cttcAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTaaa < 1:3809391/91‑1 (MQ=255) ttcAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAg < 1:3465513/91‑1 (MQ=255) ttcAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAg > 1:3205953/1‑91 (MQ=255) tcAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGc < 1:543093/91‑1 (MQ=255) cAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCt > 1:370659/1‑91 (MQ=255) agagCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTg < 1:1918755/91‑1 (MQ=255) agagCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAACACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTg > 1:47946/1‑91 (MQ=255) ttaattcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTc > 1:2102160‑M1/66‑91 (MQ=255) ttaattcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTc > 1:3879346‑M1/66‑91 (MQ=255) gCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCt < 1:128195/91‑1 (MQ=255) gCAGAGACAGATTATGCAGATATTGACAAATTCTTAGGAGTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCt < 1:3862678/91‑1 (MQ=255) aattcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTa > 1:3779829‑M1/64‑91 (MQ=255) aGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTAc < 1:3988510/91‑1 (MQ=255) ttcttcttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaatTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACg > 1:1085142‑M1/62‑91 (MQ=255) gATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACg > 1:850300/1‑91 (MQ=255) aTACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGa < 1:4007250/91‑1 (MQ=255) aTACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGa > 1:1131073/1‑91 (MQ=255) aTACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGa > 1:30910/1‑91 (MQ=255) aTACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGa < 1:4129838/91‑1 (MQ=255) aCAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAAt < 1:1045755/91‑1 (MQ=255) aTGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCa < 1:1464571/91‑1 (MQ=255) aTGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCa > 1:1356453/1‑91 (MQ=255) gCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAAt > 1:3518900/1‑91 (MQ=255) gCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAAt > 1:2710815/1‑91 (MQ=255) gCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAAt > 1:2710701/1‑91 (MQ=255) atatTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGt > 1:973828/1‑91 (MQ=255) atatTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGt > 1:1522949/1‑91 (MQ=255) tatTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTc < 1:3127777/91‑1 (MQ=255) tatTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTc < 1:535136/91‑1 (MQ=255) atTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCg < 1:254500/91‑1 (MQ=255) atTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCg < 1:254677/91‑1 (MQ=255) atTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGGAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCg < 1:254877/91‑1 (MQ=255) ttGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCgg < 1:1821565/91‑1 (MQ=255) gCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGaa > 1:1961904/1‑91 (MQ=255) ccAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAAt > 1:2034503/1‑91 (MQ=255) ccAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAAt > 1:2742614/1‑91 (MQ=255) ccAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAAt > 1:345123/1‑91 (MQ=255) aaaTTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTg < 1:1131271/91‑1 (MQ=255) aaTTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGa > 1:1197268/1‑91 (MQ=255) aTTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGaa < 1:319393/91‑1 (MQ=255) tCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAAt > 1:3011837/1‑91 (MQ=255) tCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAAt < 1:2578038/91‑1 (MQ=255) tCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAAt < 1:702155/91‑1 (MQ=255) tCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAAt < 1:2577609/91‑1 (MQ=255) cTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATg < 1:3881888/91‑1 (MQ=255) cTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATg < 1:167335/91‑1 (MQ=255) aGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAAt > 1:133481/1‑91 (MQ=255) aGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAAt > 1:779196/1‑91 (MQ=255) gATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAAttt < 1:1068918/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGa < 1:1788649/91‑1 (MQ=255) tAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGaa < 1:420793/91‑1 (MQ=255) aaaaGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGaaa > 1:2964856/1‑91 (MQ=255) aGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATca > 1:2212959/1‑91 (MQ=255) tAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACaa < 1:2653298/91‑1 (MQ=255) aCGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAACCACAAGgtg > 1:3977320/1‑91 (MQ=255) cGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGgtgt > 1:3129834/1‑91 (MQ=255) gACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGgtgtg < 1:245615/91‑1 (MQ=255) gACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGgtgtg < 1:1480546/91‑1 (MQ=255) gACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGgtgtg < 1:245388/91‑1 (MQ=255) aCAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGgtgtgt < 1:4108944/91‑1 (MQ=255) gAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTg < 1:2915402/91‑1 (MQ=255) cctaatTCGTAGACAGCTTTAGCTAATGAT‑TCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTga < 1:3095295‑M1/85‑1 (MQ=255) taatTCGTAGACAGCTTTAGCTAATGAT‑TCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaag < 1:3171533‑M1/87‑1 (MQ=255) cACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaaga < 1:2571123/91‑1 (MQ=255) cACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaaga > 1:354024/1‑91 (MQ=255) cACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaaga > 1:353986/1‑91 (MQ=255) aCTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaagaa > 1:2961660/1‑91 (MQ=255) aCTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaagaa < 1:3130824/91‑1 (MQ=255) aCTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaagaa > 1:155288/1‑91 (MQ=255) | TATTCCCTAAATATGAGTTCTTCAGAGCAGATACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAA > USA300TCH1516_ALE/173400‑173578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |