New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 173490 = | 94 (0.960) | 6 (0.070) | 5/146 | NT | 7.1% | coding (2390/2610 nt) | adhE | Aldehyde‑alcohol dehydrogenase |
? | USA300TCH1516_ALE | 173521 = | 72 (0.800) | coding (2421/2610 nt) | adhE | Aldehyde‑alcohol dehydrogenase |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
ACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGATAGAATGGCA > USA300TCH1516_ALE/173432‑173608 | aCAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAAt < 1:1045755/91‑1 (MQ=255) cttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattggcctaatTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTa > 1:3171576‑M1/57‑91 (MQ=255) aGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTa < 1:1913091/91‑1 (MQ=255) cttcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaattcgtagaatcattagctaaagctgtctacgaATTa < 1:3171533‑M2/4‑1 (MQ=255) tcagacacaccttgtgatttcaaattcatttcaattccgactgattgacctaattcgtagaatcattagctaaagctgtctacgaATTAgg < 1:3095295‑M2/6‑1 (MQ=255) aTGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCa > 1:1356453/1‑91 (MQ=255) aTGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCa < 1:1464571/91‑1 (MQ=255) gCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAAt > 1:2710815/1‑91 (MQ=255) gCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAAt > 1:2710701/1‑91 (MQ=255) gCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAAt > 1:3518900/1‑91 (MQ=255) atatTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGt > 1:1522949/1‑91 (MQ=255) tatTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTc < 1:535136/91‑1 (MQ=255) tatTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTc < 1:3127777/91‑1 (MQ=255) atTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCg < 1:254500/91‑1 (MQ=255) atTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCg < 1:254677/91‑1 (MQ=255) atTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGGAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCg < 1:254877/91‑1 (MQ=255) ttGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCgg < 1:1821565/91‑1 (MQ=255) tGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGa < 1:511844/91‑1 (MQ=255) gCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGaa > 1:1961904/1‑91 (MQ=255) ccAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAAt > 1:3003597/1‑91 (MQ=255) ccAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAAt > 1:2034503/1‑91 (MQ=255) ccAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAAt > 1:345123/1‑91 (MQ=255) ccAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAAt > 1:2742614/1‑91 (MQ=255) aaaTTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTg < 1:1131271/91‑1 (MQ=255) aaTTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGa > 1:1197268/1‑91 (MQ=255) aaTTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGa < 1:3905302/91‑1 (MQ=255) aTTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGaa < 1:319393/91‑1 (MQ=255) tCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAAt < 1:2577609/91‑1 (MQ=255) tCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAAt < 1:702155/91‑1 (MQ=255) tCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAAt > 1:3011837/1‑91 (MQ=255) tCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAAt < 1:2578038/91‑1 (MQ=255) tCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAAt > 1:3516676/1‑91 (MQ=255) cTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATg < 1:167335/91‑1 (MQ=255) cTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATg < 1:3881888/91‑1 (MQ=255) ttAGGATTAAATGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGa < 1:852734/91‑1 (MQ=255) aGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAAt > 1:779196/1‑91 (MQ=255) aGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAAt > 1:133481/1‑91 (MQ=255) gATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAAttt < 1:1068918/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGa < 1:1788649/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGa > 1:1363538/1‑91 (MQ=255) tAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGaa < 1:420793/91‑1 (MQ=255) aaaaGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGaaa > 1:2963386/1‑91 (MQ=255) aaaaGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGaaa > 1:2964856/1‑91 (MQ=255) aaaGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAAt > 1:3811037/1‑91 (MQ=255) aaaGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAAt < 1:1694255/91‑1 (MQ=255) aGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATca > 1:2212959/1‑91 (MQ=255) ggTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATcac < 1:2284931/91‑1 (MQ=255) ggTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATcac < 1:116214/91‑1 (MQ=255) tAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACaa < 1:2653298/91‑1 (MQ=255) tAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACaa < 1:3586014/91‑1 (MQ=255) aCGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAACCACAAGgtg > 1:3977320/1‑91 (MQ=255) cGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGgtgt > 1:3129834/1‑91 (MQ=255) gACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGgtgtg < 1:245615/91‑1 (MQ=255) gACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGgtgtg < 1:1480546/91‑1 (MQ=255) aCAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGgtgtgt < 1:4108944/91‑1 (MQ=255) gAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTg < 1:2915402/91‑1 (MQ=255) cctaatTCGTAGACAGCTTTAGCTAATGAT‑TCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTga < 1:3095295‑M1/85‑1 (MQ=255) taatTCGTAGACAGCTTTAGCTAATGAT‑TCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaag < 1:3171533‑M1/87‑1 (MQ=255) gCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaag > 1:1475619/1‑91 (MQ=255) taattcgtagacagctttagctaatgattctacgaATTAGGCCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaag > 1:3171576‑M2/36‑91 (MQ=255) cACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaaga > 1:353986/1‑91 (MQ=255) cACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaaga > 1:354024/1‑91 (MQ=255) cACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaaga < 1:2571123/91‑1 (MQ=255) cACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaaga < 1:2571114/91‑1 (MQ=255) aCTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaagaa < 1:3130824/91‑1 (MQ=255) aCTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaagaa > 1:2961660/1‑91 (MQ=255) aCTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaagaa > 1:155288/1‑91 (MQ=255) CGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaagaagaa < 1:20695‑M1/91‑1 (MQ=255) cgtagacagctttagctaatgattctacgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTgaagaagaa > 1:1085142‑M2/31‑91 (MQ=255) GTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAAt > 1:3704806‑M1/1‑91 (MQ=255) GTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAAt > 1:2014982‑M1/1‑91 (MQ=255) TAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAAtt < 1:694250‑M1/91‑1 (MQ=255) tagacagctttagctaatgattctacgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAAtt > 1:3779829‑M2/29‑91 (MQ=255) GA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTaa < 1:4140966‑M1/91‑1 (MQ=255) GA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTaa < 1:4141181‑M1/91‑1 (MQ=255) GA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTaa < 1:1026454‑M1/91‑1 (MQ=255) gacagctttagctaatgattctacgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTaa > 1:3879346‑M2/27‑91 (MQ=255) gacagctttagctaatgattctacgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTaa > 1:2102160‑M2/27‑91 (MQ=255) A‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTaaa < 1:1995187‑M1/91‑1 (MQ=255) tCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATg > 1:3387061/1‑91 (MQ=255) cATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGa > 1:3560663/1‑91 (MQ=255) aTTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAg > 1:3987574/1‑91 (MQ=255) tAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGGCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTc < 1:3401478/91‑1 (MQ=255) aGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCa > 1:169110/1‑91 (MQ=255) gCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCaa > 1:181635/1‑91 (MQ=255) tAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAAtt > 1:3345967/1‑91 (MQ=255) tAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAAtt > 1:2740057/1‑91 (MQ=255) aaaGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTg > 1:3062916/1‑91 (MQ=255) aaGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAAGTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGa < 1:4139076/91‑1 (MQ=255) aGCAGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGAt < 1:3343805/91‑1 (MQ=255) gCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGATa > 1:1904273/1‑91 (MQ=255) tctacgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGATAGAAt > 1:1016519‑M2/8‑91 (MQ=255) ctacgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGATAGAATg < 1:948324‑M2/85‑1 (MQ=255) tacgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGATAGAATgg < 1:1725887‑M2/86‑1 (MQ=255) tacgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGATAGAATgg < 1:871802‑M2/86‑1 (MQ=255) acgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGATAGAATGGc < 1:2651357‑M2/87‑1 (MQ=255) acgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGATAGAATGGc > 1:3479694‑M2/5‑91 (MQ=255) cgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGATAGAATGGCa < 1:2376865‑M2/88‑1 (MQ=255) cgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGATAGAATGGCa > 1:2985068‑M2/4‑91 (MQ=255) cgaATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGATAGAATGGCa > 1:3100435‑M2/4‑91 (MQ=255) | ACAGATTATGCAGATATTGCCAAATTCTTAGGATTAAAAGGTAATACGACAGAAGCACTCGTAGA‑ATCATTAGCTAAAGCTGTCTACGAATTAGGTCAATCAGTCGGAATTGAAATGAATTTGAAATCACAAGGTGTGTCTGAAGAAGAATTAAATGAGTCAATTGATAGAATGGCA > USA300TCH1516_ALE/173432‑173608 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |