New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 257948 | 79 (0.800) | 6 (0.070) | 4/146 | NT | 6.9% | coding (974/1557 nt) | USA300HOU_RS01140 | putative sensor‑like histidine kinase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 257968 | 89 (0.990) | coding (954/1557 nt) | USA300HOU_RS01140 | putative sensor‑like histidine kinase |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
ATTTGCGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTG > USA300TCH1516_ALE/257858‑258038 | aTTTGCGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAAT > 1:591707‑M1/1‑91 (MQ=255) aTTTGCGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAAT > 1:2586243‑M1/1‑91 (MQ=255) tttGCGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATg < 1:1676389/91‑1 (MQ=255) ttGCGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGa < 1:764940/91‑1 (MQ=255) ttGCGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGa < 1:764953/91‑1 (MQ=255) gCGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAgg > 1:49421/1‑91 (MQ=255) gCGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAgg > 1:3915934/1‑91 (MQ=255) gCGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAgg > 1:2738908/1‑91 (MQ=255) gCGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAgg < 1:1179277/91‑1 (MQ=255) gCGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAgg > 1:503893/1‑91 (MQ=255) cGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGc < 1:553022/91‑1 (MQ=255) cGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGc > 1:112998/1‑91 (MQ=255) cGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGc > 1:1863805/1‑91 (MQ=255) tAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTgg < 1:2954376/91‑1 (MQ=255) aTTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGaa < 1:2850562/91‑1 (MQ=255) aTTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGaa > 1:2759102/1‑91 (MQ=255) ttgGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGCTAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTgg > 1:1515948/1‑91 (MQ=255) ttgGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTgg < 1:1567224/91‑1 (MQ=255) tgGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGc > 1:1184836/1‑91 (MQ=255) tgGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGc > 1:2098809/1‑91 (MQ=255) tgGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAACTAAATATTGTATTCTTTGCATCGTATTCAATAGGAAATGAGGCTGGAGtttat > 1:3859611/1‑88 (MQ=255) ggACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCg < 1:4016702/91‑1 (MQ=255) aCCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGtt > 1:1140820/1‑91 (MQ=255) cacaGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCt < 1:537034/91‑1 (MQ=255) cacaGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCt < 1:2999859/91‑1 (MQ=255) cacaGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCt < 1:1082034/91‑1 (MQ=255) acaGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATagaacgccaattccagcctca < 1:3621430‑M1/91‑22 (MQ=255) caGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTat < 1:3040334‑M2/91‑3 (MQ=255) caGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTat < 1:1365061‑M2/91‑3 (MQ=255) caGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATAAATTATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTat < 1:1836862‑M2/91‑3 (MQ=255) aGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatt > 1:3773418‑M2/1‑88 (MQ=255) gTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTattt > 1:256091‑M2/1‑87 (MQ=255) tttGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttc < 1:3410135‑M2/91‑6 (MQ=255) tttGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttc < 1:3436768‑M2/91‑6 (MQ=255) ttGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATagaacgccaattccagcctcatttcc < 1:3646920‑M1/91‑27 (MQ=255) ttGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATagaacgccaattccagcctcatttcc < 1:3647025‑M1/91‑27 (MQ=255) tgtgCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcct < 1:1192331‑M2/91‑8 (MQ=255) tgtgCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcct > 1:3695110‑M2/1‑84 (MQ=255) tAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATagaacgccaattccagcctcatttcctattca < 1:2792565‑M1/91‑33 (MQ=255) aaTTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACt < 1:2315041/91‑1 (MQ=255) aTTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTg > 1:567299/1‑91 (MQ=255) tCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAat < 1:1359004/91‑1 (MQ=255) ggAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAatat < 1:2652725/91‑1 (MQ=255) gaTAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCAc > 1:75930/1‑91 (MQ=255) gaTAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCAc > 1:76055/1‑91 (MQ=255) tAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGc > 1:493146/1‑91 (MQ=255) aCGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCaa > 1:724416/1‑91 (MQ=255) aCGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCaa > 1:4104623/1‑91 (MQ=255) cGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAg < 1:2319242/91‑1 (MQ=255) gTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGc < 1:1033761/91‑1 (MQ=255) aaaTATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGtt > 1:2234583/1‑91 (MQ=255) aaaTATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGtt < 1:4061252/91‑1 (MQ=255) aaaCATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGtt < 1:3218422/91‑1 (MQ=255) aaTATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTc < 1:1235609/91‑1 (MQ=255) atatTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTAGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCt > 1:3600981/1‑91 (MQ=255) tattgtattgTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTg < 1:3651072/91‑1 (MQ=255) tattgtattgTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTg > 1:2818534/1‑91 (MQ=255) tgtattgtTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTAt > 1:936310/1‑91 (MQ=255) tattgtTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGc < 1:43105/91‑1 (MQ=255) attgtTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCt > 1:1105412/1‑91 (MQ=255) ttgtTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGTTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTc < 1:2677699/91‑1 (MQ=255) ttGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATa < 1:3137279/91‑1 (MQ=255) ttGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATa > 1:271621/1‑91 (MQ=255) tGCATCGTATTGCATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAg > 1:3187821/1‑91 (MQ=255) tGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAg > 1:4071692/1‑91 (MQ=255) tGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAg < 1:2803579/91‑1 (MQ=255) gCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGa > 1:2881845/1‑91 (MQ=255) cATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGaa > 1:1806323/1‑91 (MQ=255) tATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGAt < 1:2542300/91‑1 (MQ=255) tATTCAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGAt > 1:3281012/1‑91 (MQ=255) tGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaatta < 1:2792565‑M2/91‑60 (MQ=255) tGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAg < 1:2179957/91‑1 (MQ=255) tGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAg < 1:2179971/91‑1 (MQ=255) tGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAg > 1:395354/1‑91 (MQ=255) gAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattag < 1:1212080‑M2/91‑61 (MQ=255) gAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGt > 1:273018/1‑91 (MQ=255) aaTAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGtt > 1:2952458/1‑91 (MQ=255) aTAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTg > 1:926050/1‑91 (MQ=255) aGGAAATagaacgccaattccagcctcatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcaca < 1:1192331‑M1/91‑85 (MQ=255) aGGAAATagaacgccaattccagcctcatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcaca > 1:3695110‑M1/1‑7 (MQ=255) ggAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaa < 1:3646920‑M2/91‑66 (MQ=255) ggAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaa < 1:3646979‑M2/91‑66 (MQ=255) gAAATagaacgccaattccagcctcatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaaa < 1:3410135‑M1/91‑87 (MQ=255) gAAATagaacgccaattccagcctcatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaaa < 1:2118173‑M1/91‑87 (MQ=255) gAAATagaacgccaattccagcctcatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaaa < 1:3436768‑M1/91‑87 (MQ=255) gAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCa < 1:2832506/91‑1 (MQ=255) gAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCa > 1:118686/1‑91 (MQ=255) aaaTagaacgccaattccagcctcatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaaac > 1:256091‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaTGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCAt < 1:2878298/91‑1 (MQ=255) aaaTGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCAt > 1:2227761/1‑91 (MQ=255) aaaTGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCAt > 1:2227935/1‑91 (MQ=255) aaaTGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCAt > 1:28707/1‑91 (MQ=255) aTagaacgccaattccagcctcatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaaactg < 1:1365061‑M1/91‑90 (MQ=255) aTagaacgccaattccagcctcatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaaactg < 1:3040334‑M1/91‑90 (MQ=255) aTagaacgccaattccagcctcatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaaactg > 1:2706922‑M1/1‑2 (MQ=255) aTagaacgccaattccagcctcatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaaactg < 1:2716240‑M1/91‑90 (MQ=255) tGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaaactgt < 1:3621430‑M2/91‑71 (MQ=255) tGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAGCTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTg > 1:1827395/1‑91 (MQ=255) tGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTg > 1:2584561/1‑91 (MQ=255) tGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTg > 1:3066317/1‑91 (MQ=255) | ATTTGCGATAATTGTTGGACCACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTG > USA300TCH1516_ALE/257858‑258038 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |