New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 257948 | 79 (0.800) | 6 (0.070) | 4/146 | NT | 6.9% | coding (974/1557 nt) | USA300HOU_RS01140 | putative sensor‑like histidine kinase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 257968 | 89 (0.990) | coding (954/1557 nt) | USA300HOU_RS01140 | putative sensor‑like histidine kinase |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCAAATAAATCGTAAATA > USA300TCH1516_ALE/257878‑258058 | cacaGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCt < 1:1082034/91‑1 (MQ=255) cacaGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCt < 1:2999859/91‑1 (MQ=255) cacaGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCt < 1:535147/91‑1 (MQ=255) cacaGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCt < 1:537034/91‑1 (MQ=255) caGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTat < 1:3040334‑M2/91‑3 (MQ=255) caGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTat < 1:1365061‑M2/91‑3 (MQ=255) caGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTat < 1:2716240‑M2/91‑3 (MQ=255) caGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTat > 1:2706922‑M2/1‑89 (MQ=255) caGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATAAATTATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTat < 1:1836862‑M2/91‑3 (MQ=255) aGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatt > 1:3773418‑M2/1‑88 (MQ=255) gTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTattt > 1:256091‑M2/1‑87 (MQ=255) tttGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttc < 1:3436768‑M2/91‑6 (MQ=255) tttGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttc < 1:2118173‑M2/91‑6 (MQ=255) tttGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttc < 1:3410135‑M2/91‑6 (MQ=255) tgtgCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcct > 1:3695110‑M2/1‑84 (MQ=255) tgtgCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcct < 1:1192331‑M2/91‑8 (MQ=255) aaTTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACt < 1:2315041/91‑1 (MQ=255) aTTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTg > 1:567085/1‑91 (MQ=255) aTTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTg > 1:567299/1‑91 (MQ=255) tCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAat < 1:1359004/91‑1 (MQ=255) ggAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAatat < 1:2652725/91‑1 (MQ=255) ggAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAatat < 1:2755849/91‑1 (MQ=255) gagaTAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATc > 1:315015/1‑91 (MQ=255) gagaTAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATc > 1:764665/1‑91 (MQ=255) gaTAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCAc > 1:75930/1‑91 (MQ=255) gaTAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCAc > 1:76055/1‑91 (MQ=255) tAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGc > 1:493146/1‑91 (MQ=255) tAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGc > 1:298902/1‑91 (MQ=255) aCGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCaa > 1:4104623/1‑91 (MQ=255) cGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAg < 1:3442393/91‑1 (MQ=255) cGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAg < 1:2319242/91‑1 (MQ=255) cGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAg < 1:257132/91‑1 (MQ=255) gTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGc < 1:1033761/91‑1 (MQ=255) tAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCg < 1:2390716/91‑1 (MQ=255) aaaTATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGtt > 1:2234583/1‑91 (MQ=255) aaaTATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGtt > 1:2235035/1‑91 (MQ=255) aaaTATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGtt < 1:4061252/91‑1 (MQ=255) aaaCATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGtt < 1:3218422/91‑1 (MQ=255) aaTATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTc < 1:1235609/91‑1 (MQ=255) atatTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTAGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCt > 1:3600981/1‑91 (MQ=255) tattgtattgTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTg > 1:2818534/1‑91 (MQ=255) tgtattgtTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTAt > 1:936310/1‑91 (MQ=255) gtattgtTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATg > 1:2912859/1‑91 (MQ=255) tattgtTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGc < 1:43105/91‑1 (MQ=255) attgtTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCt > 1:187540/1‑91 (MQ=255) attgtTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCt > 1:1105412/1‑91 (MQ=255) gtTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGa > 1:4081519/1‑91 (MQ=255) tttGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGAt < 1:3867137/91‑1 (MQ=255) tttGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGAt < 1:791811/91‑1 (MQ=255) ttGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATa > 1:271621/1‑91 (MQ=255) ttGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATa < 1:3137279/91‑1 (MQ=255) tGCATCGTATTGCATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAg > 1:3187821/1‑91 (MQ=255) tGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAg > 1:4071692/1‑91 (MQ=255) tGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAg < 1:2803579/91‑1 (MQ=255) gCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGa > 1:2881845/1‑91 (MQ=255) cATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGaa > 1:1806323/1‑91 (MQ=255) aTCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAAt < 1:2831833/91‑1 (MQ=255) tATTCAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGAt > 1:3281012/1‑91 (MQ=255) tGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaatta < 1:2792565‑M2/91‑60 (MQ=255) tGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAg < 1:2179971/91‑1 (MQ=255) tGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAg < 1:2179957/91‑1 (MQ=255) tGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAg > 1:395354/1‑91 (MQ=255) tGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAg < 1:3625797/91‑1 (MQ=255) gAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGt > 1:273018/1‑91 (MQ=255) gAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGt < 1:3434367/91‑1 (MQ=255) aaTAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGtt > 1:2952458/1‑91 (MQ=255) aTAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTg > 1:926050/1‑91 (MQ=255) aGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCt < 1:1412687/91‑1 (MQ=255) ggAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaa < 1:3646920‑M2/91‑66 (MQ=255) ggAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaa < 1:3646979‑M2/91‑66 (MQ=255) ggAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaa < 1:3647025‑M2/91‑66 (MQ=255) gAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCa > 1:119160/1‑91 (MQ=255) gAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCa > 1:118686/1‑91 (MQ=255) gAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCa < 1:2832506/91‑1 (MQ=255) aaaTGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCAt < 1:633822/91‑1 (MQ=255) aaaTGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCAt > 1:2227799/1‑91 (MQ=255) aaaTGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCAt > 1:2227935/1‑91 (MQ=255) aaaTGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCAt > 1:28707/1‑91 (MQ=255) aTGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCAttt < 1:2603410/91‑1 (MQ=255) tGAGGCTGGAATTGGCGTTCTatttcctattcaatacgatgcaaacaatacaatatttaattacgttatctccgaaattagcacaaactgt < 1:3621430‑M2/91‑71 (MQ=255) tGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAGCTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTg > 1:1827395/1‑91 (MQ=255) tGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTg > 1:2584561/1‑91 (MQ=255) tGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTg > 1:3066317/1‑91 (MQ=255) gAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGa > 1:3016022/1‑91 (MQ=255) ggCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGAtt > 1:393899/1‑91 (MQ=255) cTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCa < 1:1033898/91‑1 (MQ=255) tGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCaa < 1:3977487/91‑1 (MQ=255) tGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCaa < 1:1652921/91‑1 (MQ=255) tGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCaa > 1:2660382/1‑91 (MQ=255) gAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCaaat < 1:365848/91‑1 (MQ=255) gAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCaaat < 1:2902917/91‑1 (MQ=255) aaTTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCaaata < 1:1436550/91‑1 (MQ=255) ggCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCAAATAAATc > 1:2178985/1‑91 (MQ=255) ggCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCAAATAAATc > 1:2178711/1‑91 (MQ=255) ggCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCAAATAAATc > 1:1542485/1‑91 (MQ=255) cGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCAAATAAATCGt > 1:1590398/1‑91 (MQ=255) ttCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCAAATAAATCGTaa > 1:3886802/1‑91 (MQ=255) ttCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCAAATAAATCGTaa > 1:2870827/1‑91 (MQ=255) tATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCAAATAAATCGTAAata > 1:3541371/1‑91 (MQ=255) tATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCAAATAAATCGTAAata < 1:1373318/91‑1 (MQ=255) | CACAGTTTGTGCTAATTTCGGAGATAACGTAATTAAATATTGTATTGTTTGCATCGTATTGAATAGGAAATGAGGCTGGAATTGGCGTTCTATTTCCTTTAACTGAATATCACGCAAGCGACGTTCTGTATGCTCGATAGAATGGATCAGTTGCTCATTTGATTCAAATAAATCGTAAATA > USA300TCH1516_ALE/257878‑258058 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |