| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 425019 | 103 (1.050) | 17 (0.190) | 9/146 | NT | 15.1% | intergenic (+34/‑392) | USA300HOU_RS01985/gpmA_1 | hypothetical protein/2,3‑bisphosphoglycerate‑dependent phosphoglycerate mutase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 425031 | 97 (1.080) | intergenic (+46/‑380) | USA300HOU_RS01985/gpmA_1 | hypothetical protein/2,3‑bisphosphoglycerate‑dependent phosphoglycerate mutase | |||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
GTTCAATTATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGATTAAAAAGTA > USA300TCH1516_ALE/424930‑425109 | ttCAATTATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGc < 1:560606/91‑1 (MQ=255) cAATTATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCAt < 1:504429/91‑1 (MQ=255) aTTATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTc < 1:4122244/91‑1 (MQ=255) tCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGtt > 1:2355498/1‑91 (MQ=255) cTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTg > 1:459532/1‑91 (MQ=255) cTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGAGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTg > 1:3500253/1‑91 (MQ=255) cTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGAGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTg > 1:3500225/1‑91 (MQ=255) ttAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGt < 1:1045541/91‑1 (MQ=255) tAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTc > 1:772375‑M2/1‑90 (MQ=255) tAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTc > 1:772947‑M2/1‑90 (MQ=255) tAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTc < 1:2965091‑M2/91‑2 (MQ=255) aaTTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgcca < 1:393683‑M1/91‑15 (MQ=255) aTTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccat < 1:1372833‑M1/91‑16 (MQ=255) aTTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccat < 1:1372929‑M1/91‑16 (MQ=255) aTTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTcat < 1:2943388‑M2/91‑4 (MQ=255) gCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGGTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatctt < 1:3851349‑M1/91‑19 (MQ=255) gCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatctt < 1:2911951‑M1/91‑19 (MQ=255) gCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaacagaatgccatctt < 1:3172069‑M1/91‑19 (MQ=255) gCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTcatctt > 1:2423846‑M2/1‑85 (MQ=255) gCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTcatctt < 1:4118615‑M2/91‑7 (MQ=255) aaTCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCtttt > 1:3718711/1‑91 (MQ=255) aTCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatctttat < 1:23432‑M1/91‑22 (MQ=255) aTCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCttttt > 1:814532/1‑91 (MQ=255) aTCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCttttt > 1:1875040/1‑91 (MQ=255) aTCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCttttt < 1:1395438/91‑1 (MQ=255) tCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCtttttt < 1:3001868/91‑1 (MQ=255) tCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCtttttt > 1:1265304/1‑91 (MQ=255) gTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatctttatttc < 1:3105887‑M1/91‑25 (MQ=255) gTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatctttatttc < 1:2696488‑M1/91‑25 (MQ=255) gTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatctttatttc < 1:3829560‑M1/91‑25 (MQ=255) gTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatctttatttc < 1:1178014‑M1/91‑25 (MQ=255) gTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTAt > 1:3791010/1‑91 (MQ=255) tAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTAtt < 1:1886109/91‑1 (MQ=255) aaCGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatctttatttcaa < 1:76838‑M1/91‑27 (MQ=255) aCGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTg < 1:3788700/91‑1 (MQ=255) cGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGc < 1:1509189/91‑1 (MQ=255) ttAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGt < 1:2520092/91‑1 (MQ=255) tAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTg > 1:2843239/1‑91 (MQ=255) ttttAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGaaa < 1:1000153/91‑1 (MQ=255) aaGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATgg > 1:3629160/1‑91 (MQ=255) agagCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGt < 1:3832707/91‑1 (MQ=255) cTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAat > 1:1768872/1‑91 (MQ=255) tATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAata < 1:1465926/91‑1 (MQ=255) tATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAata < 1:1465782/91‑1 (MQ=255) gCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGt < 1:2543677/91‑1 (MQ=255) gCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGt < 1:1233237/91‑1 (MQ=255) cGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGta > 1:399227/1‑91 (MQ=255) cGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGta < 1:1009276/91‑1 (MQ=255) gTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGtat < 1:2455158/91‑1 (MQ=255) gTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGtat < 1:624820/91‑1 (MQ=255) tAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCGTTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGtatt < 1:4139669/91‑1 (MQ=255) tAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGtatt > 1:1100411/1‑91 (MQ=255) tAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGtatt > 1:1100348/1‑91 (MQ=255) aataatAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGtattat < 1:2294015/91‑1 (MQ=255) taataaAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTataa > 1:1230540/1‑91 (MQ=255) ataaAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTataata < 1:115840/91‑1 (MQ=255) taaAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAatat > 1:1578735/1‑91 (MQ=255) aaaaaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATAtt < 1:784227/91‑1 (MQ=255) aaaaaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATAtt < 1:2128674/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATAttt < 1:1528704/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATAttt < 1:173012/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATAttt > 1:959573/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTCTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATACTAttt > 1:3857106/1‑91 (MQ=255) aaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGa < 1:3722132/91‑1 (MQ=255) aaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATC‑TTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGaa > 1:439820/1‑91 (MQ=255) aaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGaa > 1:2795665/1‑91 (MQ=255) aaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGaa > 1:2796349/1‑91 (MQ=255) aTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGaaaa > 1:3380127/1‑91 (MQ=255) tCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAGATg > 1:3213378/1‑91 (MQ=255) tCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATg > 1:1113511/1‑91 (MQ=255) cAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAACTGt > 1:3336427/1‑91 (MQ=255) cAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGt < 1:3784243/91‑1 (MQ=255) aTTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTcatcttttttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctctta < 1:1961423‑M2/91‑58 (MQ=255) aTTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTag < 1:2871995/91‑1 (MQ=255) ttGGAAATTGAATTAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTaga > 1:3182957/1‑91 (MQ=255) tGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTagat > 1:1507680/1‑91 (MQ=255) tGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATATGCGTGAAAATGGTCAATATGTTTTATAATATTTGAAAATGTagat < 1:3287744/91‑1 (MQ=255) aaaTTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTagataag > 1:3350193/1‑91 (MQ=255) aaTTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTagataaga > 1:814203/1‑91 (MQ=255) ttGAAATAAAGATGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgtt > 1:3431392‑M1/1‑14 (MQ=255) ttGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTcatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgtt < 1:76838‑M2/91‑66 (MQ=255) ttGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTagataagata > 1:1314707/1‑91 (MQ=255) gAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTcatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttac < 1:2696488‑M2/91‑68 (MQ=255) gAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAgg > 1:1365054/1‑91 (MQ=255) aaaTAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGa > 1:1517734/1‑91 (MQ=255) aTAAAGATGGCATTCAGTTGTcatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgat < 1:23217‑M2/91‑71 (MQ=255) aTAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGAtt > 1:2900113/1‑91 (MQ=255) tAAAGATGGCATTCAGTTGTcatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgatt < 1:1938947‑M2/91‑72 (MQ=255) aaGATGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgc < 1:4118615‑M1/91‑86 (MQ=255) aaGATGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgc > 1:2423846‑M1/1‑6 (MQ=255) aaGATGGCATTCTGTTGTcatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgc < 1:3172069‑M2/91‑74 (MQ=255) aaGATGGCATTCAGTTGTcatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgc < 1:2911951‑M2/91‑74 (MQ=255) aaGATGGCATTCAGTTGTcatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatacctcttaaaattaacgttacgattgc < 1:3851260‑M2/91‑74 (MQ=255) gATGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgcaa < 1:3406320‑M1/91‑88 (MQ=255) aTGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgcaat < 1:49211‑M1/91‑89 (MQ=255) aTGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgcaat < 1:2235636‑M1/91‑89 (MQ=255) tGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgcaatt < 1:939997‑M1/91‑90 (MQ=255) tGGCATTCAGTTGTcatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgcaatt < 1:393683‑M2/91‑78 (MQ=255) tGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGATTAAAAAGt > 1:2547017/1‑91 (MQ=255) ggCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGATTAAAAAGta > 1:78724/1‑91 (MQ=255) | GTTCAATTATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGATTAAAAAGTA > USA300TCH1516_ALE/424930‑425109 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |