| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 587587 | 79 (0.800) | 5 (0.060) | 4/144 | NT | 5.9% | coding (1491/3552 nt) | rpoB | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 587606 | 87 (0.980) | coding (1510/3552 nt) | rpoB | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CAATTCATGGACCAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACATTGGATTGATT > USA300TCH1516_ALE/587498‑587677 | caATTCATGGACCAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTg < 1:392351/91‑1 (MQ=255) aTTCATGGACCAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCt < 1:2927881/91‑1 (MQ=255) tGGACCAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAAt > 1:2778728/1‑91 (MQ=255) ggACCAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATg > 1:2461658/1‑91 (MQ=255) ggACCAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATg > 1:2151077/1‑91 (MQ=255) ggACCAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATg < 1:3998166/91‑1 (MQ=255) gACCAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATgg > 1:1092381/1‑91 (MQ=255) gACCAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATgg < 1:1041915/91‑1 (MQ=255) aCCAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGa < 1:2939479/91‑1 (MQ=255) ccAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGaa < 1:1119598/91‑1 (MQ=255) ccAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGaa > 1:1609721/1‑91 (MQ=255) cAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACg < 1:1834602/91‑1 (MQ=255) cAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACg < 1:1463259/91‑1 (MQ=255) cAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACg < 1:148742/91‑1 (MQ=255) cAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACg < 1:2176612/91‑1 (MQ=255) aaaCCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGt < 1:752020/91‑1 (MQ=255) aaCCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTcacgtacttccatttgagc < 1:3425524‑M1/91‑20 (MQ=255) aCCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTcacgtacttccatttgagca < 1:3918741‑M1/91‑21 (MQ=255) cccATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGac < 1:66715‑M2/91‑3 (MQ=255) ccATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTcacgtacttccatttgagcacg < 1:2503441‑M1/91‑23 (MQ=255) cATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGacgt < 1:2804726‑M2/91‑5 (MQ=255) aTTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGAACTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGacgtt > 1:4139809‑M2/1‑86 (MQ=255) ttAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGacgttc > 1:1710398‑M2/1‑85 (MQ=255) ttAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGacgttc > 1:3171796‑M2/1‑85 (MQ=255) tAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTcacgtacttccatttgagcacgttca < 1:1923366‑M1/91‑27 (MQ=255) tAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGacgttca > 1:1766565‑M2/1‑84 (MQ=255) gCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCact < 1:461824/91‑1 (MQ=255) cTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGCCCTGGTGGTTTAATACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTCCacta > 1:3860986/1‑91 (MQ=255) gAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCactact > 1:261111/1‑91 (MQ=255) gAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCactact > 1:1546665/1‑91 (MQ=255) ttAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACtctc < 1:197960/91‑1 (MQ=255) ttAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACtctc < 1:3376503/91‑1 (MQ=255) tAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCa < 1:2398396/91‑1 (MQ=255) aaCGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCAc < 1:1504344/91‑1 (MQ=255) aCGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACt > 1:3170289/1‑91 (MQ=255) cGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTa < 1:2657502/91‑1 (MQ=255) cATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATg > 1:2810126/1‑91 (MQ=255) cATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTGTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATg < 1:3106740/91‑1 (MQ=255) aTAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATgg > 1:1712161/1‑91 (MQ=255) aaaCGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGcc > 1:1186593/1‑91 (MQ=255) cgtcgtCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTa > 1:609794/1‑91 (MQ=255) tcgtcTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTAtg > 1:1011067/1‑91 (MQ=255) cgtcTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTAtgt > 1:4126099/1‑91 (MQ=255) gtcTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTAtgtg > 1:53237/1‑91 (MQ=255) tcTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATgtgt < 1:18997/91‑1 (MQ=255) cTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTc < 1:979706/91‑1 (MQ=255) tATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTcc < 1:3628990/91‑1 (MQ=255) aTCAGCATTAGGCCCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCa > 1:3176142/1‑91 (MQ=255) tCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCaa < 1:1022696/91‑1 (MQ=255) tCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCaa < 1:4060998/91‑1 (MQ=255) tCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCaa < 1:245194/91‑1 (MQ=255) cAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAAt > 1:713137/1‑91 (MQ=255) cAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAAt > 1:1262874/1‑91 (MQ=255) aGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAAtt > 1:3659880/1‑91 (MQ=255) cATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGa < 1:3244788/91‑1 (MQ=255) cATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAAGGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGa < 1:3860789/91‑1 (MQ=255) aTTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGaa > 1:1275370/1‑91 (MQ=255) aTTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGaa < 1:3981601/91‑1 (MQ=255) ttAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGaaa < 1:547080/91‑1 (MQ=255) tAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAac > 1:2594124/1‑91 (MQ=255) aGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAaca > 1:409574/1‑91 (MQ=255) ggACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAacac < 1:2647506/91‑1 (MQ=255) ggACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAacac < 1:434813/91‑1 (MQ=255) ggACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAacac < 1:433648/91‑1 (MQ=255) gACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACAcc > 1:485012/1‑91 (MQ=255) gACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACAcc < 1:1945122/91‑1 (MQ=255) aCCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCt > 1:3295211/1‑91 (MQ=255) ccTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTg > 1:1767273/1‑91 (MQ=255) tggtggTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAg > 1:919951/1‑91 (MQ=255) tggtTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGa < 1:3563039/91‑1 (MQ=255) ggtTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGAc < 1:2013747/91‑1 (MQ=255) ttAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCaa > 1:3904993/1‑91 (MQ=255) tAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCaaa > 1:3802190/1‑91 (MQ=255) aaCACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAGCACCTGAGGGACCAAAc > 1:3551022/1‑91 (MQ=255) aaCACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAAc > 1:2261921/1‑91 (MQ=255) aaCACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAAc > 1:2262198/1‑91 (MQ=255) acacGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACa > 1:1174823/1‑91 (MQ=255) cacGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACAt < 1:2500775/91‑1 (MQ=255) gTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACATTgg > 1:785950/1‑91 (MQ=255) gTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACATTgg < 1:250530/91‑1 (MQ=255) tGAACGTcacgtacttccatttgagcacgttcacgtgttaaaccaccaggtcctaatgctgatagacgacgtttatgcgttaactcagcta > 1:1766565‑M1/1‑7 (MQ=255) tGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACATTGga > 1:3879512/1‑91 (MQ=255) gAACGTcacgtacttccatttgagcacgttcacgtgttaaaccaccaggtcctaatgctgatagacgacgtttatgcgttaactcagctaa > 1:1710454‑M1/1‑6 (MQ=255) gAACGTcacgtacttccatttgagcacgttcacgtgttaaaccaccaggtcctaatgctgatagacgacgtttatgcgttaactcagctaa > 1:1710398‑M1/1‑6 (MQ=255) gAACGTcacgtacttccatttgagcacgttcacgtgttaaaccaccaggtcctaatgctgatagacgacgtttatgcgttaactcagctaa > 1:3171796‑M1/1‑6 (MQ=255) aaCGTcacgtacttccatttgagcacgttcacgtgttaaaccaccagttcctaatgctgatagacgacgtttatgcgttaactcagctaat > 1:4139809‑M1/1‑5 (MQ=255) aaCGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACATTGgatt < 1:1498704/91‑1 (MQ=255) aCGTcacgtacttccatttgagcacgttcacgtgttaaaccaccaggtcctaatgctgatagacgacgtttatgcgttaactcagctaatg < 1:2804726‑M1/91‑88 (MQ=255) aCGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACATTGgattg > 1:1609269/1‑91 (MQ=255) aCGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACATTGgattg < 1:328369/91‑1 (MQ=255) cGTGCTCAAATGGAAGTACGTGacgttcacgtgttaaaccaccaggtcctaatgctgatagacgacgtttatgcgttaactcagctaatgg < 1:2503963‑M2/91‑70 (MQ=255) cGTGCTCAAATGGAAGTACGTGacgttcacgtgttaaaccaccaggtcctaatgctgatagacgacgtttatgcgttaactcagctaatgg < 1:2503441‑M2/91‑70 (MQ=255) cGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTTACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACATTGgattga > 1:702242/1‑91 (MQ=255) cGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACATTGgattga < 1:1340639/91‑1 (MQ=255) gTcacgtacttccatttgagcacgttcacgtgttaaaccaccaggtcctaatgctgatagacgacgtttatgcgttaactcagctaatggg < 1:66715‑M1/91‑90 (MQ=255) gTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGGGGGACCAAACATTGgattgat > 1:500607/1‑91 (MQ=255) tcacgtacttccatttgagcacgttcacgtgttaaaccaccaggtcctaatgctgatagacgacgtttatgcgttaactcagctaatgggt > 1:296310‑M1/1‑1 (MQ=255) tGCTCAAATGGAAGTACGTGacgttcacgtgttaaaccaccaggtcctaatgctgatagacgacgtttatgcgttaactcagctaatgggt < 1:3918741‑M2/91‑72 (MQ=255) tGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACATTGgattgatt > 1:3420459/1‑91 (MQ=255) tGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACATTGgattgatt > 1:2576593/1‑91 (MQ=255) | CAATTCATGGACCAAGCAAACCCATTAGCTGAGTTAACGCATAAACGTCGTCTATCAGCATTAGGACCTGGTGGTTTAACACGTGAACGTGCTCAAATGGAAGTACGTGACGTTCACTACTCTCACTATGGCCGTATGTGTCCAATTGAAACACCTGAGGGACCAAACATTGGATTGATT > USA300TCH1516_ALE/587498‑587677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |