| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 595612 | 71 (0.720) | 6 (0.070) | 4/150 | NT | 8.1% | coding (644/2082 nt) | fusA | Elongation factor G |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 595639 | 69 (0.750) | coding (671/2082 nt) | fusA | Elongation factor G | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TACAAATGATTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAATTAAAAGAAGCTATCCG > USA300TCH1516_ALE/595526‑595702 | taCAAATGATTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGaa < 1:2678811/91‑1 (MQ=255) cAAATGATTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGc > 1:515922/1‑91 (MQ=255) aaaTGATTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCa < 1:271067/91‑1 (MQ=255) aaaTGATTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCa < 1:271041/91‑1 (MQ=255) aaTGATTTAGGTCCTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAg > 1:3177776/1‑91 (MQ=255) aaTGATTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAg > 1:3792901/1‑91 (MQ=255) aaTGATTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAg > 1:2184271/1‑91 (MQ=255) aaTGATTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAg > 1:3792944/1‑91 (MQ=255) aaTGATTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAg > 1:3792556/1‑91 (MQ=255) aaTGATTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAg > 1:888467/1‑91 (MQ=255) tGATTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGtt > 1:931455/1‑91 (MQ=255) aTTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATACCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGc < 1:1910084/91‑1 (MQ=255) ttAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCTGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAg < 1:850680/91‑1 (MQ=255) aGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGaa < 1:371933/91‑1 (MQ=255) ggTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGaaa > 1:1889988/1‑91 (MQ=255) cTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATtcgtcgctagtttctgcaact < 1:1308680‑M1/91‑22 (MQ=255) cTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATtcgtcgctagtttctgcaact < 1:1308679‑M1/91‑22 (MQ=255) cTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAg < 1:1821909/91‑1 (MQ=255) gaaattgaagaaattgaaATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGcg > 1:679889/1‑91 (MQ=255) gaaattgaagaaattgaaATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCACGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGcg < 1:3510931/91‑1 (MQ=255) gaaagtgaagaaagtgaaATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGcg > 1:3298083/1‑91 (MQ=255) aaattgaagaaattgaaATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGcga < 1:2916057/91‑1 (MQ=255) aattgaagaaattgaaATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGcgac < 1:1816623/91‑1 (MQ=255) aattgaagaaattgaaATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGcgac < 1:1562068/91‑1 (MQ=255) attgaagaaattgaaATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGcgacg > 1:2568595/1‑91 (MQ=255) ttgaagaaattgaaATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcg < 1:737424‑M1/91‑28 (MQ=255) gaagaaattgaaATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcgat < 1:540014‑M1/91‑30 (MQ=255) agaaATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAatta < 1:4026596‑M2/91‑5 (MQ=255) agaaATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAatta < 1:1336311‑M2/91‑5 (MQ=255) gaaattgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAattaa > 1:1723947‑M2/1‑86 (MQ=255) gaaattgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAattaa < 1:871729‑M2/91‑6 (MQ=255) gaaattgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAattaa < 1:1722398‑M2/91‑6 (MQ=255) gaaattgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAattaa < 1:871748‑M2/91‑6 (MQ=255) gaaattgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAattaa < 1:1722315‑M2/91‑6 (MQ=255) gaaattgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAattaa > 1:3095060‑M2/1‑86 (MQ=255) gaaattgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAattaa < 1:1722314‑M2/91‑6 (MQ=255) gaaattgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAattaa < 1:90224‑M2/91‑6 (MQ=255) gaaactgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcgattaa < 1:3451012‑M1/91‑33 (MQ=255) aaattgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAAt > 1:2768399/1‑91 (MQ=255) aattgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATg > 1:932132/1‑91 (MQ=255) aaatgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATg < 1:923461/88‑1 (MQ=255) attgaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATgg < 1:459011/91‑1 (MQ=255) gaaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGTAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGaaa > 1:3432238/1‑91 (MQ=255) aaattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGaaaa > 1:3681538/1‑91 (MQ=255) aattCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGaaaaa > 1:2797376/1‑91 (MQ=255) ccGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCt > 1:729263/1‑91 (MQ=255) ccGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCt > 1:728790/1‑91 (MQ=255) aaGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTgg > 1:875975/1‑91 (MQ=255) aGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGt > 1:579357/1‑91 (MQ=255) cACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACg < 1:827912/91‑1 (MQ=255) cACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACg < 1:909598/91‑1 (MQ=255) cACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACg < 1:1308806/91‑1 (MQ=255) cACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACg < 1:1262911/91‑1 (MQ=255) cTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACgaa < 1:3561468/91‑1 (MQ=255) agatagaGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACgaagaa > 1:3689526/1‑91 (MQ=255) gatagaGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGaaa < 1:3382507/91‑1 (MQ=255) atagaGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAAt < 1:2055324/91‑1 (MQ=255) atagaGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAAt < 1:2055203/91‑1 (MQ=255) tagaGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAAtt > 1:1231599/1‑91 (MQ=255) agagCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAAttt > 1:3230282/1‑91 (MQ=255) agCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCa < 1:252727/91‑1 (MQ=255) agCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCa > 1:2583245/1‑91 (MQ=255) cTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGt < 1:2690293/91‑1 (MQ=255) tGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGtt > 1:3409895/1‑91 (MQ=255) agaagCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCt < 1:1129862/91‑1 (MQ=255) agaagCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCt < 1:491559/91‑1 (MQ=255) agaagCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCt < 1:488218/91‑1 (MQ=255) agaagCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCt < 1:2647986/91‑1 (MQ=255) agaagCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCt < 1:3034558/91‑1 (MQ=255) gaagCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTg < 1:1377025/91‑1 (MQ=255) gaagCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTg < 1:1377154/91‑1 (MQ=255) gaagCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTg < 1:1867084/91‑1 (MQ=255) gaagCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTg < 1:1867293/91‑1 (MQ=255) gaagCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTg > 1:2156182/1‑91 (MQ=255) aagCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGa < 1:2866839/91‑1 (MQ=255) aagCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGa < 1:2867023/91‑1 (MQ=255) agCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGCATCAATGGAAAAATCTCTTGGTGACGAAGAAATTTCCGTTTCTGaa > 1:2697390/1‑91 (MQ=255) gCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAAt < 1:2117123/91‑1 (MQ=255) cTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCCGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAAtt > 1:735004/1‑91 (MQ=255) cTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAAtt > 1:2839504/1‑91 (MQ=255) cTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAAtt > 1:2380923/1‑91 (MQ=255) cTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAAtt > 1:2267608/1‑91 (MQ=255) tCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAATTa > 1:1342331/1‑91 (MQ=255) cGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAATTaa > 1:2826392/1‑91 (MQ=255) gTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAATTaaa > 1:2411054/1‑91 (MQ=255) gCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAATTAAaag < 1:3891494/91‑1 (MQ=255) aGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAATTAAaagaag < 1:2077769/91‑1 (MQ=255) ttAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcgattaagctagcacgagcttcttcagctctatctaagtggtcttcgggaatttcaatttc < 1:871729‑M1/91‑87 (MQ=255) ttAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcgattaagctagcacgagcttcttcagctctatctaagtggtcttcgggaatttcaatttc > 1:1723947‑M1/1‑5 (MQ=255) ttAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcgattaagctagcacgagcttcttcagctctatctaagtggtcttcgggaatttcaatttc < 1:871748‑M1/91‑87 (MQ=255) ttAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcgattaagctagcacgagcttcttcagctctatctaagtggtcttcgggaatttcaatttc < 1:1722398‑M1/91‑87 (MQ=255) ttAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcgattaagctagcacgagcttcttcagctctatctaagtggtcttcgggaatttcaatttc < 1:1722315‑M1/91‑87 (MQ=255) ttAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcgattaagctagcacgagcttcttcagctctatctaagtggtcttcgggaatttcaatttc < 1:1722314‑M1/91‑87 (MQ=255) ttAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcgattaagctagcacgagcttcttcagctctatctaagtggtcttcgggaatttcaatttc < 1:90224‑M1/91‑87 (MQ=255) ttAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcgattaagctagcacgagcttcttcagctctatctaagtggtcttcgggaatttcaatttc > 1:3095060‑M1/1‑5 (MQ=255) ttAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAattaagctagcacgagcttcttcagctctatctaagtggtcttcgggaatttcagtttc < 1:3451012‑M2/91‑60 (MQ=255) tAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcgattaagctagcacgagcttcttcagctctatctaagtggtcttcgggaatttcaatttct < 1:4026596‑M1/91‑88 (MQ=255) tAATtcgtcgctagtttctgcaactgcttcgattaagctagcacgagcttcttcagctctatctaagtggtcttcgggaatttcaatttct < 1:1336311‑M1/91‑88 (MQ=255) aTCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAattaagctagcacgagcttcttcagctctatctaagtggtcttcgggaatttcaatttcttc < 1:540014‑M2/91‑63 (MQ=255) tCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAATTAAAAGAAGCTATCCg > 1:2656086/1‑91 (MQ=255) | TACAAATGATTTAGGTACTGAAATTGAAGAAATTGAAATTCCCGAAGACCACTTAGATAGAGCTGAAGAAGCTCGTGCTAGCTTAATCGAAGCAGTTGCAGAAACTAGCGACGAATTAATGGAAAAATATCTTGGTGACGAAGAAATTTCAGTTTCTGAATTAAAAGAAGCTATCCG > USA300TCH1516_ALE/595526‑595702 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |