| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 646656 = | 101 (1.030) | 11 (0.130) | 7/140 | NT | 11.9% | intergenic (+10/‑577) | lipL/galK | Octanoyl‑[GcvH]:protein N‑octanoyltransferase/Galactokinase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 646692 = | 74 (0.860) | intergenic (+46/‑541) | lipL/galK | Octanoyl‑[GcvH]:protein N‑octanoyltransferase/Galactokinase | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
AGAAGAATGGCAAAGATACGATACGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAA > USA300TCH1516_ALE/646568‑646744 | catcatatcattacttttaatttaatgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTaa > 1:2565793‑M1/89‑91 (MQ=255)agaagaATGGCAAAGATACGATACGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTaa < 1:3008477/91‑1 (MQ=255) atcatatcattacttttaatttaatgatgttctatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggagactttcaaaaaTAAc > 1:3537951‑M1/88‑91 (MQ=255) atcatatcattacttttaatttaatgatgttctatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggacactttcaaaaaTAAc > 1:3537950‑M1/88‑91 (MQ=255) atcatatcattacttttaatttaatgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAAc > 1:2954077‑M1/88‑91 (MQ=255) atcatatcattacttttaatttaatgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAAc > 1:4087939‑M1/88‑91 (MQ=255) aagaaTGGCAAATATACGATACGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACa > 1:3179774/1‑91 (MQ=255) aagaaTGGCAAACATACGATACGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACa > 1:3179657/1‑91 (MQ=255) gaaTGGCAAAGATACGATACGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGc < 1:2571278/91‑1 (MQ=255) atatcattacttttaatttaatgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGc > 1:42271‑M1/85‑91 (MQ=255) atatcattacttttaatttaatgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGc > 1:1096698‑M1/85‑91 (MQ=255) tatcattacttttaatttaatgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGcc < 1:4020255‑M1/8‑1 (MQ=255) aaTGGCAAAGATACGATACGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGcc < 1:2652106/91‑1 (MQ=255) atcattacttttaatttaatgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGccc < 1:2878529‑M1/9‑1 (MQ=255) aTGGCAAAGATACGATACGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGccc < 1:7217/91‑1 (MQ=255) aTGGCAAAGATACGATACGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGccc < 1:6767/91‑1 (MQ=255) tcatgacttttaatttaatgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGcccc > 1:518281‑M1/82‑91 (MQ=255) ggCAAAGATACGATACGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCt > 1:465608/1‑91 (MQ=255) aGATACGATACGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCaa < 1:2096766/91‑1 (MQ=255) gatacgatacGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAg < 1:3085326/91‑1 (MQ=255) atacgatacgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGt < 1:2926745/91‑1 (MQ=255) tacgatacgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGtt < 1:2260521/91‑1 (MQ=255) tacgatacgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGtt > 1:1789357/1‑91 (MQ=255) tacgatacgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGtt < 1:1730613/91‑1 (MQ=255) tacgatacgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGtt < 1:773477/91‑1 (MQ=255) acgatacgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTa > 1:2379001/1‑91 (MQ=255) acgatacgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTa > 1:1032285/1‑91 (MQ=255) cgatacgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTAt < 1:3397837/91‑1 (MQ=255) cgatacgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTAt < 1:2926251/91‑1 (MQ=255) aatttaatgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTAt > 1:1174544‑M1/71‑91 (MQ=255) atacgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCg > 1:3335205/1‑91 (MQ=255) atacgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCg < 1:1585338/91‑1 (MQ=255) atacgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCg > 1:1770918/1‑91 (MQ=255) taatgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGtt > 1:2237370‑M1/67‑91 (MQ=255) taatgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGtt > 1:2237270‑M1/67‑91 (MQ=255) atgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTg > 1:285873‑M1/65‑91 (MQ=255) gatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggg > 1:2231505‑M1/63‑91 (MQ=255) aTTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggg > 1:2423764/1‑91 (MQ=255) atgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTgggg > 1:358019‑M1/62‑91 (MQ=255) tttGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGc > 1:3270881/1‑91 (MQ=255) tttGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGc < 1:2728401/91‑1 (MQ=255) tttGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGc > 1:1827073/1‑91 (MQ=255) tcaatttaaatcttaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGt > 1:3765448‑M1/58‑91 (MQ=255) tcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGt > 1:455455‑M1/58‑91 (MQ=255) taTAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGt < 1:2005575/90‑1 (MQ=255) gATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGt > 1:2861276/1‑91 (MQ=255) aTAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGtt > 1:8628/1‑91 (MQ=255) aTAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGtt > 1:8001/1‑91 (MQ=255) aTAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGtt < 1:56237/91‑1 (MQ=255) aTAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGtt > 1:7776/1‑91 (MQ=255) tAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTa > 1:1211077/1‑91 (MQ=255) tAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTa > 1:81294/1‑91 (MQ=255) tAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTa > 1:713468/1‑91 (MQ=255) tAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTa < 1:608597/91‑1 (MQ=255) tAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCATTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTa > 1:3847976/1‑91 (MQ=255) aatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTa > 1:474948‑M1/56‑91 (MQ=255) gATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTg > 1:49801/1‑91 (MQ=255) gATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTATTg > 1:3342842/1‑91 (MQ=255) ttGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGaa > 1:991176/1‑91 (MQ=255) ttGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGaa > 1:992090/1‑91 (MQ=255) aaagaaaCAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGt < 1:3985255/91‑1 (MQ=255) aagaaaCAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTa > 1:618772/1‑91 (MQ=255) agaaaCAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTAt < 1:388650/91‑1 (MQ=255) agaaaCAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTAt > 1:203873/1‑91 (MQ=255) aCAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCAt > 1:2334777/1‑91 (MQ=255) aaGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATaa > 1:4023570/1‑91 (MQ=255) gAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATaaaa < 1:4037244/91‑1 (MQ=255) gAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATaaaa < 1:1693141/91‑1 (MQ=255) gAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATaaaa < 1:3969308/91‑1 (MQ=255) aaaaTGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATaaaaa > 1:1544702/1‑91 (MQ=255) aaaTGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAg < 1:3960502/91‑1 (MQ=255) aaTGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGc < 1:2771089/91‑1 (MQ=255) aTGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCa < 1:2976230/91‑1 (MQ=255) aTAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATaa > 1:2798205/1‑91 (MQ=255) aGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAat < 1:3576278/91‑1 (MQ=255) aGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAat > 1:1281036/1‑91 (MQ=255) aGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAat < 1:820036/91‑1 (MQ=255) aTCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAatat < 1:3175605/91‑1 (MQ=255) aaaTGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGtt < 1:197068/91‑1 (MQ=255) aaTGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTa < 1:2660713/91‑1 (MQ=255) aaTGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTa < 1:1544875/91‑1 (MQ=255) aaTGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTa < 1:534740/91‑1 (MQ=255) aTGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTAt < 1:3404628/91‑1 (MQ=255) aTGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTAt > 1:1003377/1‑91 (MQ=255) aTGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTATTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTAt > 1:919760/1‑91 (MQ=255) aTGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTATTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTAt > 1:1085624/1‑91 (MQ=255) tGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTAtt > 1:1737964/1‑91 (MQ=255) cAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGa < 1:411519/91‑1 (MQ=255) aaTAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGAc > 1:2628323/1‑91 (MQ=255) tAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCt < 1:120184/91‑1 (MQ=255) tAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCt < 1:210538/91‑1 (MQ=255) tAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCt < 1:1221481/91‑1 (MQ=255) tAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAata < 1:3015301/91‑1 (MQ=255) aaaTATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAatat < 1:3672630/91‑1 (MQ=255) aaTATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATAtt < 1:32879/91‑1 (MQ=255) aaTATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATAtt < 1:4109614/91‑1 (MQ=255) aaTATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGATATTGACCTAATAtt < 1:3534145/91‑1 (MQ=255) atatTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATAttt > 1:1359332/1‑91 (MQ=255) atatTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATAttt > 1:2136082/1‑91 (MQ=255) tttAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTaaa < 1:2227893/91‑1 (MQ=255) | AGAAGAATGGCAAAGATACGATACGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAA > USA300TCH1516_ALE/646568‑646744 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |