New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 691792 | 107 (1.090) | 8 (0.100) | 5/132 | NT | 7.4% | coding (30/1056 nt) | USA300HOU_RS03335 | hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 691823 | 113 (1.390) | intergenic (‑2/+59) | USA300HOU_RS03335/USA300HOU_RS03340 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
TACAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTT > USA300TCH1516_ALE/691702‑691882 | tACAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGT > 1:534329‑M1/1‑91 (MQ=255) tACAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGT < 1:2890673‑M1/91‑1 (MQ=255) tACAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGT > 1:674276‑M1/1‑91 (MQ=255) aCAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCgtg > 1:3613729/1‑91 (MQ=255) aCAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCgtg > 1:587639/1‑91 (MQ=255) aaTCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGtt > 1:3886154/1‑91 (MQ=255) atcatcTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTa > 1:944991/1‑91 (MQ=255) catcTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTaaa < 1:4010553/91‑1 (MQ=255) tcTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAAt < 1:1061265/91‑1 (MQ=255) cTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATg > 1:946081/1‑91 (MQ=255) tACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTa > 1:3679444/1‑91 (MQ=255) acgacgATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTAc > 1:2102333/1‑91 (MQ=255) acgacgATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTAc > 1:835181/1‑91 (MQ=255) cgaTTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGc < 1:4128256/91‑1 (MQ=255) gaTTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCt < 1:1198580/91‑1 (MQ=255) gaTTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCt < 1:1210726/91‑1 (MQ=255) aTTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCtt < 1:301943/91‑1 (MQ=255) aTTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCtt < 1:3252225/91‑1 (MQ=255) tttttAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCtta < 1:2992877/91‑1 (MQ=255) ttttAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCttat < 1:2928579/91‑1 (MQ=255) ttttAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCttat < 1:2430098/91‑1 (MQ=255) ttttAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCttat < 1:2160121/91‑1 (MQ=255) tAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTtattat < 1:2225057/91‑1 (MQ=255) tAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTtattat > 1:901174/1‑91 (MQ=255) ttGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCAt < 1:1349928/91‑1 (MQ=255) tGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATa < 1:1067092/91‑1 (MQ=255) ggAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTttatgaaaataataagcaagtacattttaac < 1:2802684‑M1/91‑32 (MQ=255) ggAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTCCTTGCTTATTATTTTCATaa > 1:3829884/1‑91 (MQ=255) ggAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATaa < 1:2619360/91‑1 (MQ=255) gAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAa > 1:3626000‑M2/1‑90 (MQ=255) aaTTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAac > 1:2128834‑M2/1‑89 (MQ=255) aTTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATCATTTTCATAAacg < 1:139274‑M2/91‑4 (MQ=255) tACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAacgat > 1:1232057‑M2/1‑86 (MQ=255) aCTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAacgatt > 1:3660891‑M2/1‑85 (MQ=255) aCTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAacgatt > 1:451530‑M2/1‑85 (MQ=255) aCTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAacgatt < 1:1121284‑M2/91‑7 (MQ=255) gCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTttatgaaaataataagcaagtacattttaacacgattttcta < 1:1335479‑M1/91‑43 (MQ=255) gCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTttatgaaaataataagcaagtacattttaacacgattttcta < 1:1335940‑M1/91‑43 (MQ=255) gCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAacgattttcta < 1:3377820‑M2/91‑12 (MQ=255) gttCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATc > 1:2499203/1‑91 (MQ=255) gttCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATc > 1:2500945/1‑91 (MQ=255) gttCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATc > 1:2616084/1‑91 (MQ=255) ttCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATcc < 1:1881367/91‑1 (MQ=255) tttAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCttt < 1:695800/91‑1 (MQ=255) tttAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCttt < 1:1123793/91‑1 (MQ=255) ttAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTa < 1:3971922/91‑1 (MQ=255) ttAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTa < 1:3300066/91‑1 (MQ=255) tAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTAc < 1:3725903/91‑1 (MQ=255) tAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTAc < 1:200557/91‑1 (MQ=255) tAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTAc > 1:3124318/1‑91 (MQ=255) tAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTAc > 1:3122872/1‑91 (MQ=255) gAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGaa < 1:1881759/91‑1 (MQ=255) aaTATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGaaa > 1:1709612/1‑91 (MQ=255) atatCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAAt < 1:3450444/91‑1 (MQ=255) atCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAAttt > 1:1554118/1‑91 (MQ=255) atCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAAttt > 1:1851006/1‑91 (MQ=255) aaaTGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTtaa < 1:2352827/91‑1 (MQ=255) aaTGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTtaat > 1:3746351/1‑91 (MQ=255) aaTGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTtaat < 1:3920463/91‑1 (MQ=255) aaTGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTtaat < 1:3921444/91‑1 (MQ=255) aTGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTtaata > 1:1310723/1‑91 (MQ=255) tGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTACTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTtaataa > 1:3284495/1‑91 (MQ=255) cTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATaaaa < 1:3520622/91‑1 (MQ=255) cTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATaaaa < 1:3520433/91‑1 (MQ=255) tttCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATaaaaa > 1:1293970/1‑91 (MQ=255) tttCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATaaaaa > 1:2275935/1‑91 (MQ=255) ttCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAAt > 1:1104470/1‑91 (MQ=255) tCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCACAgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaa > 1:954217‑M2/1‑50 (MQ=255) tCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCACAgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaa > 1:954227‑M2/1‑50 (MQ=255) ccGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATca > 1:3309213/1‑91 (MQ=255) cGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATcac > 1:2753792/1‑91 (MQ=255) ttttAGAAAATCGTttatgaaaataataagcaagtacattttaacacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaa > 1:3926147‑M1/1‑14 (MQ=255) ttttAGAAAATCGTttatgaaaataataagcaagtacattttaacacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaa > 1:2248987‑M1/1‑14 (MQ=255) ttttAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATc < 1:3245764/91‑1 (MQ=255) ttAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATccc > 1:259088/1‑91 (MQ=255) tAGAAAATCGTttatgaaaataataagcaagtacattttaacacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaacgc < 1:3377820‑M1/91‑81 (MQ=255) tAGAAAATCGTttatgaaaataataagcaagtacattttaacacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaacgc < 1:3374578‑M1/91‑81 (MQ=255) tAGAAAATCGTttatgaaaataataagcaagtacattttaacacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaacgc > 1:1799043‑M1/1‑11 (MQ=255) tAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaacgc < 1:1335940‑M2/91‑50 (MQ=255) tAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCa > 1:2968495/1‑91 (MQ=255) aGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAg > 1:1251690/1‑91 (MQ=255) aGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAg < 1:14595/91‑1 (MQ=255) aGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAg < 1:2208998/91‑1 (MQ=255) gAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGt < 1:2657480/91‑1 (MQ=255) gAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGt < 1:1430930/91‑1 (MQ=255) gAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGt < 1:4009032/91‑1 (MQ=255) gAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGt < 1:916894/91‑1 (MQ=255) gAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGt < 1:3310776/91‑1 (MQ=255) aaaaTCGTttatgaaaataataagcaagtacattttaacacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaacgccga > 1:1318848‑M1/1‑8 (MQ=255) aaaTCGTttatgaaaataataagcaagtacattttaacacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaacgccgag > 1:357921‑M1/1‑7 (MQ=255) aaaTCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTa < 1:705343/91‑1 (MQ=255) aaaTCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTa < 1:2283864/91‑1 (MQ=255) aaTCGTttatgaaaataataagcaagtacattttaacacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaacgccgagt > 1:451530‑M1/1‑6 (MQ=255) aaTCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaacgccgagt < 1:1159739‑M2/91‑55 (MQ=255) aaTCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaacgccgagt < 1:1155798‑M2/91‑55 (MQ=255) tCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaacgccgagtaa < 1:3567745‑M2/91‑57 (MQ=255) cGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTAtttt < 1:3499322/91‑1 (MQ=255) gtgtTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTAttttt > 1:3063934/1‑91 (MQ=255) tttatgaaaataataagcaagtacattttaacacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaacgccgagtaattc > 1:2273489‑M1/1‑1 (MQ=255) tttatgaaaataataagcaagtacattttaacacgattttctaaaaacggaaagcattttgatattcctaaagaacaacgccgagtaattc < 1:1191404‑M1/91‑91 (MQ=255) | TACAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTT > USA300TCH1516_ALE/691702‑691882 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |