New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 940816 = | 101 (1.030) | 10 (0.110) | 6/148 | NT | 10.5% | coding (372/375 nt) | USA300HOU_RS04680 | Putative esterase |
? | USA300TCH1516_ALE | 940879 = | 77 (0.850) | coding (1151/1155 nt) | ptlE | Neopentalenolactone D synthase |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTAATT > USA300TCH1516_ALE/940790‑940969 | gTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATgcg > 1:3819158/1‑91 (MQ=255) gTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATgcg < 1:2974131/91‑1 (MQ=255) aCAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCt < 1:3263308/91‑1 (MQ=255) aCAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCt > 1:259317/1‑91 (MQ=255) aGTTGCTATTAATCCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCtat > 1:3184007/1‑91 (MQ=255) gTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCtata > 1:633088/1‑91 (MQ=255) gTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCtata > 1:1218207/1‑91 (MQ=255) gTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCtata > 1:872313/1‑91 (MQ=255) ttGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTatat > 1:4130491/1‑91 (MQ=255) ttGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTatat > 1:879528/1‑91 (MQ=255) ttGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTatat > 1:2338501/1‑91 (MQ=255) gCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttg < 1:1025468/91‑1 (MQ=255) gCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttg < 1:2640576/91‑1 (MQ=255) cTATTAATCCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttgt < 1:2073977/91‑1 (MQ=255) cTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATAttgt < 1:1468377/91‑1 (MQ=255) ttAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATtgttgt > 1:3374344/1‑91 (MQ=255) tAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAACTGTTATGAGATATTCATAACTACGGTTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTa < 1:3686413/91‑1 (MQ=255) aaaCCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAg > 1:3708185/1‑91 (MQ=255) aaaCCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAg < 1:2533411/91‑1 (MQ=255) aaaCCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATAGTTGTAg > 1:2069032/1‑91 (MQ=255) aaCCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGt < 1:2205042/91‑1 (MQ=255) ccTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGttt > 1:3652536/1‑91 (MQ=255) ttAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAg > 1:803403/1‑91 (MQ=255) ttAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAg < 1:212101/91‑1 (MQ=255) aaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGaa < 1:2813078/91‑1 (MQ=255) aaaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGaa < 1:1096198/91‑1 (MQ=255) aaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGaaa < 1:2308887/91‑1 (MQ=255) aaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGaaa < 1:2308593/91‑1 (MQ=255) aaataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGaaa < 1:3253184/91‑1 (MQ=255) aataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAAt > 1:1850386/1‑91 (MQ=255) aataaaaGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTCGTAGTTTTAGAAAt < 1:4111930/91‑1 (MQ=255) TAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGc > 1:2333437‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCt < 1:951919‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCt < 1:951781‑M1/91‑1 (MQ=255) aaaactgctagccgtagttatgaatatctcataacatttcagctagcagttcttttatGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGt > 1:3126815‑M2/59‑91 (MQ=255) aaaactgctagccgtagttatgaatatctcataacatttcagctagcagttcttttatGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGt > 1:3127688‑M2/59‑91 (MQ=255) AGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGt > 1:904671‑M1/1‑91 (MQ=255) gAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGtt > 1:1084305/1‑91 (MQ=255) gAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGtt < 1:2990992/91‑1 (MQ=255) gAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGtt < 1:190418/91‑1 (MQ=255) aaactgctagccgtagttatgaatatctcataacatttcagctagcagttcttttatGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGtt > 1:3777106‑M2/58‑91 (MQ=255) aactgctagccgtagttatgaatatctcataacatttcagctagcagttcttttatGCGCTATATCGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTc > 1:3869184‑M2/57‑91 (MQ=255) aactgctagccgtagttatgaatatctcataacatttcagctagcagttcttttatGCGCTATATAGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTc > 1:3869501‑M2/57‑91 (MQ=255) aaCTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTc > 1:560544/1‑91 (MQ=255) aaCTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTc < 1:1404688/91‑1 (MQ=255) actgctagccgtagttatgaatatctcataacatttcagctagcagttcttttatGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCa > 1:3386500‑M2/56‑91 (MQ=255) aCTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCa < 1:682641/91‑1 (MQ=255) ctgctagccgtagttatgaatatctcataacatttcagctagcagtttttttatGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCaa > 1:3569475‑M2/55‑91 (MQ=255) cTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCaa > 1:1394741/1‑91 (MQ=255) cTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCaa < 1:2183320/91‑1 (MQ=255) cTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCaa < 1:2184116/91‑1 (MQ=255) cTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGc < 1:2302199/91‑1 (MQ=255) tAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCg > 1:4131264/1‑91 (MQ=255) gAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCgg < 1:4046355/91‑1 (MQ=255) aTGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCANTGCGTTCGGCAg > 1:76198/1‑91 (MQ=255) aTGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAg > 1:1206189/1‑91 (MQ=255) tATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCttt < 1:830484/91‑1 (MQ=255) aTGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTa > 1:697759/1‑91 (MQ=255) tGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTAc > 1:3619328/1‑91 (MQ=255) agaTATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACgg < 1:944526/91‑1 (MQ=255) gaTATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGc < 1:1024553/91‑1 (MQ=255) tatTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCa > 1:518767/1‑91 (MQ=255) atTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCAc < 1:1574853/91‑1 (MQ=255) atTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCAc > 1:443245/1‑91 (MQ=255) ttCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCAcc > 1:3933602/1‑91 (MQ=255) ataacatttcagctagcagttcttttatGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCAccc > 1:2054588‑M2/29‑91 (MQ=255) aTAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCAt > 1:3012673/1‑91 (MQ=255) tAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATa < 1:2255479/91‑1 (MQ=255) tAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATa < 1:2256337/91‑1 (MQ=255) aaCTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATaa > 1:1932274/1‑91 (MQ=255) aaCTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATaa > 1:1932366/1‑91 (MQ=255) aCTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAAc > 1:1327046/1‑91 (MQ=255) aCTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAAc > 1:3075308/1‑91 (MQ=255) aCTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAAc > 1:3073712/1‑91 (MQ=255) aCTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAAc > 1:3073686/1‑91 (MQ=255) aCGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACAtt < 1:31307/91‑1 (MQ=255) ggCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTc > 1:1014579/1‑91 (MQ=255) gCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCt > 1:1193624/1‑91 (MQ=255) gCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCt < 1:2461372/91‑1 (MQ=255) gCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCt > 1:1397399/1‑91 (MQ=255) gCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCt < 1:575730/91‑1 (MQ=255) gCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCt < 1:670398/91‑1 (MQ=255) tAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTAc > 1:1596960/1‑91 (MQ=255) aGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTAcc < 1:2134536/91‑1 (MQ=255) gCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCa < 1:761119/91‑1 (MQ=255) tttttttATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATg < 1:2740375/91‑1 (MQ=255) ttttttATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATgg < 1:2258932/91‑1 (MQ=255) tttatGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTcc < 1:13824‑M2/86‑1 (MQ=255) ttatGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTACAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCt > 1:3517205‑M2/5‑91 (MQ=255) tatGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTa < 1:749057‑M2/88‑1 (MQ=255) tatGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTa > 1:4023548‑M2/4‑91 (MQ=255) tatGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTa > 1:2474814‑M2/4‑91 (MQ=255) tatGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTa < 1:3227392‑M2/88‑1 (MQ=255) atGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTaa > 1:826149‑M2/3‑91 (MQ=255) atGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTaa > 1:873800‑M2/3‑91 (MQ=255) gcgcTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTAAtt > 1:256556/1‑91 (MQ=255) gcgcTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTAAtt < 1:2625338/91‑1 (MQ=255) gcgcTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTAAtt < 1:2773427/91‑1 (MQ=255) gcgcTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTAAtt > 1:4069218/1‑91 (MQ=255) gcgcTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTAAtt > 1:236903/1‑91 (MQ=255) | GGTACAGTTGCTATTAAACCTTTAAAATAAAAGAACTGCTAGCTGAAATGTTATGAGATATTCATAACTACGGCTAGCAGTTTTTTTATGCGCTATATTGTTGTAGTTTTAGAAATGCTTGTTCAATGCGTTCGGCAGCTTTACGGCCACCCATAACATTTCTACCAAATGGTCCTAATT > USA300TCH1516_ALE/940790‑940969 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |