| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1005791 | 120 (1.220) | 15 (0.180) | 8/138 | NT | 12.4% | intergenic (+427/+33) | pepF1_1/USA300HOU_RS04965 | Oligoendopeptidase F, plasmid/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1005805 | 109 (1.290) | intergenic (+441/+19) | pepF1_1/USA300HOU_RS04965 | Oligoendopeptidase F, plasmid/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
TATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATATTTAAGTTTTTCAATTT > USA300TCH1516_ALE/1005715‑1005894 | tatatTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGgtgt < 1:2456217/91‑1 (MQ=255)tatatTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGgtgt < 1:3438262/91‑1 (MQ=255) taaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTa > 1:3285500‑M1/66‑91 (MQ=255) atatTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTa > 1:930817‑M2/1‑90 (MQ=255) aaatatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTAc > 1:2196287‑M1/65‑91 (MQ=255) tttAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTacga > 1:1444053‑M2/1‑87 (MQ=255) atatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGa > 1:585992‑M1/63‑91 (MQ=255) tatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAg > 1:1831095‑M1/62‑91 (MQ=255) tatccagatggcgatttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAg > 1:863940‑M1/62‑91 (MQ=255) gATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTACAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTacgaggtc < 1:3401227‑M2/91‑9 (MQ=255) aTCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTacgaggtct > 1:3146326‑M2/1‑82 (MQ=255) aTCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTacgaggtct > 1:2627710‑M2/1‑82 (MQ=255) aTCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTacgaggtct > 1:2628825‑M2/1‑82 (MQ=255) aTGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTaa > 1:1045793/1‑91 (MQ=255) tgtgTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAat > 1:1167767/1‑91 (MQ=255) gtgtAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAatt > 1:1779474/1‑91 (MQ=255) gtgtAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAatt < 1:2700916/91‑1 (MQ=255) tgtAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAattt > 1:166942/1‑91 (MQ=255) atttctggaaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAatttat > 1:1796075‑M1/49‑91 (MQ=255) aaCATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAatttatt < 1:3406518/91‑1 (MQ=255) cATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGCCCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAatttattta > 1:942572/1‑91 (MQ=255) cATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAatttattta < 1:3467939/91‑1 (MQ=255) ttACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAatttatttatt < 1:519054/91‑1 (MQ=255) tACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAatttatttattt < 1:1095905/91‑1 (MQ=255) aCGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTAtttt > 1:2161988/1‑91 (MQ=255) aCGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTAtttt > 1:175393/1‑91 (MQ=255) aCGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTAtttt > 1:2730663/1‑91 (MQ=255) aCGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTAtttt > 1:3262727/1‑91 (MQ=255) cGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttg > 1:205127/1‑91 (MQ=255) aaatctaaaatgcctaaaatcaaatcaaaataaataaattAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttg > 1:1534021‑M1/41‑91 (MQ=255) gTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttga > 1:951355/1‑91 (MQ=255) ttCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttgat > 1:2953035/1‑91 (MQ=255) tCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttgatt > 1:3546926/1‑91 (MQ=255) tCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttgatt > 1:1690569/1‑91 (MQ=255) taataaTTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATtttgatttg > 1:2403490/1‑91 (MQ=255) aataatTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATttggatttga > 1:2077997/1‑91 (MQ=255) aataatTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATttcgatttga > 1:2078377/1‑91 (MQ=255) aataatTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATttagatttga > 1:2078235/1‑91 (MQ=255) aatTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTGAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTgatttgattt < 1:2038384/91‑1 (MQ=255) tAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAgg < 1:3994255/91‑1 (MQ=255) tAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAgg < 1:1802150/91‑1 (MQ=255) aTGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCa < 1:1398763/91‑1 (MQ=255) gTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCAtt < 1:3889741/91‑1 (MQ=255) gTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCAtt < 1:4067986/91‑1 (MQ=255) ttGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCAttt < 1:3670158/91‑1 (MQ=255) ttGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCAttt < 1:2254645/91‑1 (MQ=255) tGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCAtttt < 1:1338895/91‑1 (MQ=255) gCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTa > 1:3132609/1‑91 (MQ=255) aaTTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGAtt < 1:1802434/91‑1 (MQ=255) aTTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGAttt < 1:552537/91‑1 (MQ=255) aTTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGAttt < 1:3078245/91‑1 (MQ=255) ttAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTc > 1:1618168/1‑91 (MQ=255) tAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTcc > 1:1675761/1‑91 (MQ=255) gagTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGa > 1:1460202/1‑91 (MQ=255) gagTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGa > 1:3045712/1‑91 (MQ=255) gTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGaaa < 1:2835355/91‑1 (MQ=255) gTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGaaa < 1:702201/91‑1 (MQ=255) tCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAAt < 1:74364/91‑1 (MQ=255) cAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATc > 1:3815815/1‑91 (MQ=255) aGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTCATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCg > 1:3590547/1‑91 (MQ=255) gTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGc < 1:3651783/91‑1 (MQ=255) gTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGc < 1:3651953/91‑1 (MQ=255) gTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGc < 1:1022899/91‑1 (MQ=255) gTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGc < 1:1022836/91‑1 (MQ=255) gTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGc > 1:2952384/1‑91 (MQ=255) gTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGc < 1:2683776/91‑1 (MQ=255) aaaaGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCAt > 1:1880780/1‑91 (MQ=255) AAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATc > 1:3077122‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCt < 1:3238127‑M1/91‑1 (MQ=255) aGACCTCGTTACATTTATGGTGTacgaggtctttttactgactcttaattttgcaacattaaattattagaacgtaatgttacacatcgat < 1:2541312‑M2/91‑69 (MQ=255) AGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTg > 1:2950771‑M1/1‑91 (MQ=255) AGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTg < 1:2471476‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGa < 1:965777‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGa < 1:1904440‑M1/91‑1 (MQ=255) CCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGat > 1:1421836‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGat < 1:704643‑M1/91‑1 (MQ=255) CTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGata > 1:3166225‑M1/1‑91 (MQ=255) CTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGata > 1:1913044‑M1/1‑91 (MQ=255) CTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGata > 1:3165661‑M1/1‑91 (MQ=255) TCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGatat > 1:2599349‑M1/1‑91 (MQ=255) cGTTACATTTATGGTGTacgaggtctttttactgactcttaattttgcaacattaaattattagaacgtaatgttacacatcgatctaaat < 1:3366492‑M2/91‑75 (MQ=255) CGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATAtt < 1:2143373‑M1/91‑1 (MQ=255) CGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATAtt < 1:84617‑M1/91‑1 (MQ=255) gTTACATTTATGGTGTacgaggtctttttactgactcttaattttgcaacattaaattattagaacgtaatgttacacatcgatctaaata < 1:1303853‑M2/91‑76 (MQ=255) cATTTATGGTGTacgaggtctttttactgactcttaattttgcaacattaaattattagaacgtaatgttacacatcgatctaaatatatt < 1:2205210‑M2/91‑80 (MQ=255) cATTTATGGTGTacgaggtctttttactgactcttaattttgcaacattaaattattagaacgtaatgttacacatcgatctaaatatatt < 1:902848‑M2/91‑80 (MQ=255) aTTTATGGTGTacgaggtctttttactgactcttaattttgcaacattaaattattagaacgtaatgttacacatcgatctaaatatatta < 1:3878574‑M2/91‑81 (MQ=255) aTTTATGGTGTacgaggtctttttactgactcttaattttgcaacattaaattattagaacgtaatgttacacatcgatctaaatatatta < 1:3998082‑M2/91‑81 (MQ=255) ttATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATATTTAAGtttt < 1:2732137/91‑1 (MQ=255) ttATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATATTTAAGtttt < 1:573694/91‑1 (MQ=255) tATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATATTTAAGttttt < 1:3100765/91‑1 (MQ=255) tATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATATTTAAGttttt < 1:81304/91‑1 (MQ=255) tATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATATTTAAGttttt < 1:1236299/91‑1 (MQ=255) aTGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATATTTAAGTTTTTc < 1:1501495/91‑1 (MQ=255) tGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATATTTAAGTTTTTCa > 1:58027/1‑91 (MQ=255) tGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATATTTAAGTTTTTCa > 1:853948/1‑91 (MQ=255) tGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATATTTAAGTTTTTCa < 1:1215893/91‑1 (MQ=255) tGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCACTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATCTTTAAGTTTTTCa > 1:4150793/1‑91 (MQ=255) ggTGTacgaggtctttttactgactcttaattttgcaacattaaattattagaacgtaatgttacacatcgatctaaatatattagtgata < 1:2283231‑M2/91‑87 (MQ=255) gtACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATATTTAAGTTTTTCAAttt < 1:3568502/91‑1 (MQ=255) | TATATTTAGATCGATGTGTAACATTACGTTCTAATAATTTAATGTTGCAAAATTAAGAGTCAGTAAAAAGACCTCGTTACATTTATGGTGTACGAGGTCTTTAATTTATTTATTTTGATTTGATTTTAGGCATTTTAGATTTCCAGAAATCGCCATCTGGATATTTAAGTTTTTCAATTT > USA300TCH1516_ALE/1005715‑1005894 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |