| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1084763 | 82 (0.830) | 15 (0.170) | 10/140 | NT | 16.3% | intergenic (+135/+130) | purD/ykoC_1 | Phosphoribosylamine‑‑glycine ligase/Putative HMP/thiamine permease protein YkoC |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1084806 | 82 (0.950) | intergenic (+178/+87) | purD/ykoC_1 | Phosphoribosylamine‑‑glycine ligase/Putative HMP/thiamine permease protein YkoC | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
ATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATAAAATTTAA > USA300TCH1516_ALE/1084718‑1084896 | aTTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcc > 1:2941021‑M2/1‑89 (MQ=255) tttCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcct < 1:1024484‑M2/91‑4 (MQ=255) tttCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcct > 1:3194853‑M2/1‑88 (MQ=255) tCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctct > 1:464190‑M2/1‑86 (MQ=255) cTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctctt < 1:2579088‑M2/91‑7 (MQ=255) cTGAACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctctt > 1:1078322‑M2/1‑85 (MQ=255) gTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctctttt < 1:1519478‑M2/91‑9 (MQ=255) gTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctctttt < 1:1519274‑M2/91‑9 (MQ=255) tACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttg > 1:2389721‑M2/1‑82 (MQ=255) tACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttg < 1:2189130‑M2/91‑10 (MQ=255) tACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttg < 1:3654578‑M2/91‑10 (MQ=255) ccAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGtt > 1:243587/1‑91 (MQ=255) ccAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGtt > 1:1749562/1‑91 (MQ=255) cAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGttt < 1:4114525/91‑1 (MQ=255) aaTTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAg > 1:2708964/1‑91 (MQ=255) tttGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTa < 1:3810071/91‑1 (MQ=255) tgtgATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATg > 1:1284442/1‑91 (MQ=255) tgtgATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATg < 1:1791722/91‑1 (MQ=255) tgtgATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATg > 1:3244388/1‑91 (MQ=255) tgATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGa < 1:2419649/91‑1 (MQ=255) gATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGaa > 1:299125/1‑91 (MQ=255) tATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGATCAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATaa < 1:1249868/91‑1 (MQ=255) tATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCCCTTTTGTTTAGTATGGAATaa > 1:80981/1‑91 (MQ=255) tGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAAt > 1:1816654/1‑91 (MQ=255) gCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATg < 1:676464/91‑1 (MQ=255) atatGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGt > 1:2010488/1‑91 (MQ=255) tatGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGtt > 1:1436135/1‑91 (MQ=255) tatGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGtt < 1:3306058/91‑1 (MQ=255) tatGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGtt > 1:1436167/1‑91 (MQ=255) atGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGttt > 1:3181922/1‑91 (MQ=255) atGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGttt > 1:2008129/1‑91 (MQ=255) tGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGtttt > 1:3796838/1‑91 (MQ=255) tGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGtttt < 1:1825383/91‑1 (MQ=255) tGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGtttt > 1:2366074/1‑91 (MQ=255) tAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGttttct < 1:2361853/91‑1 (MQ=255) aTACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCGcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttg < 1:3956718‑M2/91‑37 (MQ=255) aTACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGttttcttt > 1:1962979/1‑91 (MQ=255) tACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGttttctttt < 1:3086045/91‑1 (MQ=255) aCAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGttttcttttt < 1:2112248/91‑1 (MQ=255) aCAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGttttcttttt > 1:4067820/1‑91 (MQ=255) aCAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGttttcttttt > 1:2414078/1‑91 (MQ=255) aaaGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCta > 1:2567771/1‑91 (MQ=255) aaaGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCta > 1:3154353/1‑91 (MQ=255) aaaGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCta > 1:562818/1‑91 (MQ=255) aaGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCATCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCtat < 1:3596321/91‑1 (MQ=255) aaGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCATCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCtat < 1:3596090/91‑1 (MQ=255) aaGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCtat > 1:1905694/1‑91 (MQ=255) aaGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCtat < 1:1496919/91‑1 (MQ=255) gagGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATAc < 1:1090028/91‑1 (MQ=255) agGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACa < 1:782057/91‑1 (MQ=255) ggCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACaa < 1:3790621/91‑1 (MQ=255) ggCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACaa > 1:1859753/1‑91 (MQ=255) gcgcCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatc < 1:2295661‑M2/91‑48 (MQ=255) gcgcCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatc < 1:412809‑M2/91‑48 (MQ=255) gcgcCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatc < 1:413019‑M2/91‑48 (MQ=255) gcgcCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatc < 1:1279816‑M2/91‑48 (MQ=255) gcgcCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatc < 1:412864‑M2/91‑48 (MQ=255) gcgcCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAAt > 1:3140484/1‑91 (MQ=255) gcgcCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAAt > 1:3170316/1‑91 (MQ=255) gcgcCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAAt > 1:4041768/1‑91 (MQ=255) gcCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatcaa < 1:2912064‑M2/91‑50 (MQ=255) gcCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGa > 1:208975/1‑91 (MQ=255) ccACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGaa < 1:4047723/91‑1 (MQ=255) cacaACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatcaatg < 1:1002011‑M2/91‑52 (MQ=255) cacaACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAAt > 1:2381585/1‑91 (MQ=255) acaacaTGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAAtt < 1:2064138/91‑1 (MQ=255) caacaTGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatcaatgtc < 1:2497468‑M2/91‑54 (MQ=255) aacaTGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatcaatgtcc < 1:2995318‑M2/91‑55 (MQ=255) aacaTGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatcaatgtcc < 1:2995206‑M2/91‑55 (MQ=255) aacaTGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTc < 1:127883/91‑1 (MQ=255) aacaTGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTAGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTc < 1:3301495/91‑1 (MQ=255) acaTGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatcaatgtcct < 1:2698640‑M2/91‑56 (MQ=255) gTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAAtt < 1:463527/91‑1 (MQ=255) tttGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatcaatgtcctagact < 1:2540117‑M2/91‑61 (MQ=255) tttGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAAttt > 1:43130/1‑91 (MQ=255) tttGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAAttt > 1:3828396/1‑91 (MQ=255) ttGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcctcttttgtattacatatgcataatcacaaatttggtacagaaatcaatgtcctagactc < 1:3607978‑M2/91‑62 (MQ=255) ttGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTa < 1:1293068/91‑1 (MQ=255) gAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCt > 1:3069142/1‑91 (MQ=255) aaCAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCta < 1:2027626/91‑1 (MQ=255) aaCAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCta > 1:2176136/1‑91 (MQ=255) aaCAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCta < 1:2440820/91‑1 (MQ=255) aCAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCtat < 1:938136/91‑1 (MQ=255) aCAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCtat < 1:3709703/91‑1 (MQ=255) aCAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCtat < 1:185706/91‑1 (MQ=255) cAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCtata < 1:1957483/91‑1 (MQ=255) aTAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAAt > 1:4090611/1‑91 (MQ=255) aTAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAAt < 1:270438/91‑1 (MQ=255) aaCATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTa < 1:2231767/91‑1 (MQ=255) aCATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTAt > 1:3177784/1‑91 (MQ=255) aTGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATgg < 1:100905/91‑1 (MQ=255) gTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGAt < 1:727736/91‑1 (MQ=255) tttGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATa < 1:434093/91‑1 (MQ=255) tttGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATa < 1:2011053/91‑1 (MQ=255) tttGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATa < 1:432780/91‑1 (MQ=255) tttGTGGCACCTCTTATGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGACTTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATa > 1:3539333/1‑91 (MQ=255) gtgGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATaaaa < 1:19365/91‑1 (MQ=255) ggCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATAAAAtt > 1:3983522/1‑91 (MQ=255) gCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATAAAAttt > 1:1977081/1‑91 (MQ=255) aCCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATAAAATTTaa < 1:1112203/91‑1 (MQ=255) | ATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCACAACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATAAAATTTAA > USA300TCH1516_ALE/1084718‑1084896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |