BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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 ttATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTAttt                                                                                         <  1:773717/91‑1 (MQ=255)

  tATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTAtttt                                                                                        <  1:3222379/91‑1 (MQ=255)

   aTCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTAttttt                                                                                       <  1:3452130/91‑1 (MQ=255)

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     cATTAATATGTTCATAGCAA‑‑‑AAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACtt                                                                                  >  1:2898439/1‑91 (MQ=255)

       ttAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACt                                                                                   <  1:413809/91‑1 (MQ=255)

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                                                                   aaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaataataat                       >  1:1757794/1‑91 (MQ=255)

                                                                    accaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAataataata                      <  1:426103/91‑1 (MQ=255)

                                                                        acattttaatggttttATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAgtg                  <  1:1553286‑M2/75‑1 (MQ=255)

                                                                        acattttaatggttttATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAgtg                  <  1:2297468‑M2/75‑1 (MQ=255)

                                                                           ttttaatggttttATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTcc               <  1:1772006‑M2/78‑1 (MQ=255)

                                                                            tttaatggttttATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCa              >  1:1832671‑M2/13‑91 (MQ=255)

                                                                            tttaatggttttATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCa              >  1:2577073‑M2/13‑91 (MQ=255)

                                                                            tttaatggttttATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCa              >  1:2576725‑M2/13‑91 (MQ=255)

                                                                                atggttttATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGaa          <  1:3639195‑M2/83‑1 (MQ=255)

                                                                                   gttttATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATg       >  1:238695‑M2/6‑91 (MQ=255)

                                                                                     tttATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGat     >  1:1613225‑M2/4‑91 (MQ=255)

                                                                                       tATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGatat   >  1:300885‑M2/2‑91 (MQ=255)

                                                                                       tATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGatat   <  1:1291760‑M2/90‑1 (MQ=255)

                                                                                       tATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGatat   <  1:1291578‑M2/90‑1 (MQ=255)

                                                                                        aTTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATAtt  >  1:2372476/1‑91 (MQ=255)

TTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATT  >  USA300TCH1516_ALE/1114061‑1114239

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.