BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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acaTAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATAcaacc                                                                                          <  1:3959636/91‑1 (MQ=255)

 cATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCa                                                                                         >  1:2428126‑M2/1‑90 (MQ=255)

 cATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCa                                                                                         >  1:1642079‑M2/1‑90 (MQ=255)

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      ggACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacatt                                                                                    <  1:3163938‑M2/91‑7 (MQ=255)

       atttaatcgttcaaacattccaagaactacaaagttaaaaatAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACAttt                                                                                   >  1:940982‑M1/43‑91 (MQ=255)

        tttaatcgttcaaacattccaagaactacaaagttaaaaatAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACAtttt                                                                                  >  1:293900‑M1/42‑91 (MQ=255)

        aCGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacatttt                                                                                  >  1:3301466‑M2/1‑83 (MQ=255)

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                tataTTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggttt                                                                          >  1:2209045‑M2/1‑75 (MQ=255)

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ACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATA  >  USA300TCH1516_ALE/1114041‑1114219

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.