| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1131322 = | 82 (0.830) | 4 (0.040) | 5/148 | NT | 5.1% | coding (704/927 nt) | glpQ1 | putative glycerophosphodiester phosphodiesterase 1 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1131337 = | 74 (0.810) | coding (689/927 nt) | glpQ1 | putative glycerophosphodiester phosphodiesterase 1 | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TTTGATAAAACGAGATGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTAAAACGAA > USA300TCH1516_ALE/1131249‑1131427 | tttGATAAAACGAGATGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCt > 1:1188004/1‑91 (MQ=255)tttGATAAAACGAGATGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCt > 1:2178231/1‑91 (MQ=255)gcacaaggatccgtcgcaattggtgctagccaacaggaagttacagaagcatttttaaaatatcatttattaggtggtagtacctaccacc < 1:3602411‑M2/2‑1 (MQ=255) ttGATAAAACGAGATGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCta > 1:1958917/1‑91 (MQ=255) gATAAAACGAGATGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCtaat < 1:2207176/91‑1 (MQ=255) aTAAAACGAGATGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCtaata > 1:2876341/1‑91 (MQ=255) aaaaCGAGATGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATaaa > 1:2944907/1‑91 (MQ=255) cGAGATGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGat < 1:2272404/91‑1 (MQ=255) agaTGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGatat > 1:2701011/1‑91 (MQ=255) tcgcaattggtgctagccaacaggaagttacagaagcatttttaaaatatcatttattaggtggtagtacctaccaCCTAATAAATGatat < 1:2489410‑M2/15‑1 (MQ=255) gaTGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATAtt < 1:3722122/91‑1 (MQ=255) gaTGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATAtt < 1:2209484/91‑1 (MQ=255) aTGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATAttt > 1:3375133/1‑91 (MQ=255) tGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATAtttt > 1:3160014/1‑91 (MQ=255) tGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATAtttt < 1:2477610/91‑1 (MQ=255) gcaattggtgctagccaacaggaagttacagaagcatttttaaaatatcatttattaggtggtagtacctaccaCCTAATAAATGATAttt < 1:2350304‑M2/17‑1 (MQ=255) gAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTa < 1:15158/91‑1 (MQ=255) aaGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTaa > 1:382527/1‑91 (MQ=255) aaGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTaa > 1:2315522/1‑91 (MQ=255) aGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTaaa > 1:2488152/1‑91 (MQ=255) aGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTaaa < 1:1741126/91‑1 (MQ=255) tCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTaaaaa < 1:2654940/91‑1 (MQ=255) tCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTaaaaa < 1:1865640/91‑1 (MQ=255) aTGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTg < 1:488352/91‑1 (MQ=255) tGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGt > 1:1056270/1‑91 (MQ=255) ccaacaggaagttacagaagcatttttaaaatatcatttattaggtggtagtacctaccaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTg < 1:2724859‑M2/31‑1 (MQ=255) gCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTa < 1:2452016/91‑1 (MQ=255) ccTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTaa < 1:1214963/91‑1 (MQ=255) cTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAAc < 1:1982116/91‑1 (MQ=255) cTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAAc < 1:487316/91‑1 (MQ=255) ttAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACtt < 1:1891088/91‑1 (MQ=255) ttAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACtt < 1:1193154/91‑1 (MQ=255) ttAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGATGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACtt < 1:1959872/91‑1 (MQ=255) aggaagttacagaagcatttttaaaatatcatttattaggtggtagtacctaccaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACt < 1:75166‑M2/36‑1 (MQ=255) aaaaTGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTcc < 1:2130593/91‑1 (MQ=255) agttacagaagcatttttaaaatatcatttattaggTGGTAGGTAC‑TACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCt < 1:75166‑M1/55‑1 (MQ=255) aaaTGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCt > 1:582362/1‑91 (MQ=255) aTGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGt < 1:3511953/91‑1 (MQ=255) tGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATCTTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGtt > 1:1521026/1‑91 (MQ=255) tGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGtt < 1:743971/91‑1 (MQ=255) tGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGtt > 1:1520903/1‑91 (MQ=255) tGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGtt < 1:529489/91‑1 (MQ=255) cagaagcatttttaaaatatcatttattaggTGGTAGGTAC‑TACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTgg < 1:2724859‑M1/60‑1 (MQ=255) aGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTgg > 1:166910/1‑91 (MQ=255) aGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTgg > 1:166823/1‑91 (MQ=255) aGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTgg > 1:166928/1‑91 (MQ=255) aGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTgg > 1:2604417/1‑91 (MQ=255) tAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCt > 1:3800605/1‑91 (MQ=255) tAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCt > 1:3800456/1‑91 (MQ=255) tAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCCTCTGTAACTTCCTGTTGGCt > 1:3583250/1‑91 (MQ=255) aGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTa > 1:868909/1‑91 (MQ=255) ggCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAg < 1:3384523/91‑1 (MQ=255) ggCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAg < 1:3384657/91‑1 (MQ=255) ggCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAg < 1:1880416/91‑1 (MQ=255) ggCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAg < 1:940503/91‑1 (MQ=255) ggCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAg < 1:940556/91‑1 (MQ=255) ggAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAAt > 1:1688171/1‑91 (MQ=255) ggAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAAt > 1:644201/1‑91 (MQ=255) aaatatcatttattaggTGGTAG‑GTACTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGc < 1:2350304‑M1/74‑1 (MQ=255) aCGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGc > 1:2640760/1‑91 (MQ=255) aCGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGc > 1:2640568/1‑91 (MQ=255) gTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGa < 1:3311939/91‑1 (MQ=255) ttGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCATCAATTGCGACg > 1:3759339/1‑91 (MQ=255) ttGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACg < 1:148624/91‑1 (MQ=255) ttGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACg < 1:1941707/91‑1 (MQ=255) tgtgCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACgg < 1:3516218/91‑1 (MQ=255) aaTGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCtt > 1:140116/1‑91 (MQ=255) aaTGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCtt > 1:2473608/1‑91 (MQ=255) aaTGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCtt > 1:1805457/1‑91 (MQ=255) tggttggtAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTtgt < 1:1121044/91‑1 (MQ=255) tggttggtAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTtgt < 1:2345602/91‑1 (MQ=255) tggttggtAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTtgt > 1:2412199/1‑91 (MQ=255) ggttggtAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTtgtg > 1:1719281/1‑91 (MQ=255) ggTGGTAGGTAC‑TACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGc < 1:3602411‑M1/89‑1 (MQ=255) ttggtAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGTACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCa > 1:3864124/1‑91 (MQ=255) ttggtAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCa > 1:623567/1‑91 (MQ=255) TGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCaa < 1:1676776‑M1/91‑1 (MQ=255) TGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCaa < 1:3512395‑M1/91‑1 (MQ=255) GGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAAt < 1:2715240‑M1/91‑1 (MQ=255) GGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAAt < 1:2715192‑M1/91‑1 (MQ=255) GTAG‑TACCTACCCCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAAtt < 1:3194942‑M1/91‑1 (MQ=255) GTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAAtt < 1:1131318‑M1/91‑1 (MQ=255) TAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAAttt < 1:1153547‑M1/91‑1 (MQ=255) TAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAAttt < 1:1465293‑M1/91‑1 (MQ=255) ggtactaccaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTtta > 1:2903673‑M2/11‑91 (MQ=255) tacctaccACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTttat < 1:2575556/91‑1 (MQ=255) tactaccaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTttatt > 1:1865445‑M2/9‑91 (MQ=255) acctaccACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTttatt > 1:3153575/1‑91 (MQ=255) ctaccaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTaa > 1:1711385‑M2/7‑91 (MQ=255) ctaccaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTaa > 1:2512905‑M2/7‑91 (MQ=255) ctaccaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTaa > 1:2512906‑M2/7‑91 (MQ=255) taccaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTaaa < 1:2874921‑M2/86‑1 (MQ=255) accaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTaaaa < 1:2026467‑M2/87‑1 (MQ=255) accaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTaaaa < 1:280719‑M2/87‑1 (MQ=255) ccaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTAAAAc > 1:536708‑M2/4‑91 (MQ=255) ccaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTAAAAc < 1:2818359‑M2/88‑1 (MQ=255) ccaCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTAAAAc < 1:2818892‑M2/88‑1 (MQ=255) caCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTAAAACg > 1:3710300‑M2/3‑91 (MQ=255) aCCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTAGAACGa > 1:1438004‑M2/2‑91 (MQ=255) ccTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTAAaacgaa < 1:2202681/91‑1 (MQ=255) | TTTGATAAAACGAGATGAAGTCAAATCAATGCCTTTAAAATGAGTAGGCATTTGGAACGTTTGTGCTAATGGTTGGTAG‑TACCTACCACCTAATAAATGATATTTTAAAAATGCTTCTGTAACTTCCTGTTGGCTAGCACCAATTGCGACGGATCCTTGTGCAATTTTATTAAAACGAA > USA300TCH1516_ALE/1131249‑1131427 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |