| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1136225 | 104 (1.060) | 14 (0.160) | 8/142 | NT | 12.4% | intergenic (+81/+73) | rpmF/isdB | 50S ribosomal protein L32/Iron‑regulated surface determinant protein B |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1136249 | 105 (1.200) | intergenic (+105/+49) | rpmF/isdB | 50S ribosomal protein L32/Iron‑regulated surface determinant protein B | |||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
ATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACGATGCT > USA300TCH1516_ALE/1136160‑1136339 | ataAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCc < 1:2930303‑M2/91‑2 (MQ=255)ataAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCc < 1:2931571‑M2/91‑2 (MQ=255) aaaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgcc > 1:2286639‑M2/1‑87 (MQ=255) aaaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgcc > 1:2286707‑M2/1‑87 (MQ=255) aaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgcca > 1:2101‑M2/1‑86 (MQ=255) aaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgcca < 1:2629616‑M2/91‑6 (MQ=255) aaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaa > 1:1717925‑M2/1‑85 (MQ=255) aaGTCCCACTTAAAACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaa < 1:914785‑M2/91‑7 (MQ=255) aaGTCCCACTTAAAACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaa < 1:3386724‑M2/91‑7 (MQ=255) aaGTCCCACTTAAAACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaa < 1:3386649‑M2/91‑7 (MQ=255) aGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaat < 1:958780‑M2/91‑8 (MQ=255) aGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaat > 1:3704262‑M2/1‑84 (MQ=255) aGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaat < 1:246837‑M2/91‑8 (MQ=255) aGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAAGTAACTGGATACCTCATCcgccaat < 1:3861560‑M2/91‑8 (MQ=255) aGTCCCACTTAAAACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaat < 1:1504071‑M2/91‑8 (MQ=255) gTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaatt > 1:1226329‑M2/1‑83 (MQ=255) tCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaatta < 1:411654‑M2/91‑10 (MQ=255) cGCTTAAGATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaaa < 1:2725880/91‑1 (MQ=255) cGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaaa > 1:47436/1‑91 (MQ=255) cGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaaa > 1:48396/1‑91 (MQ=255) cGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaaa > 1:129972/1‑91 (MQ=255) gCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAAt > 1:4094549/1‑91 (MQ=255) gCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGACACCTCATCCGCCAATTAAAAt < 1:1333443/91‑1 (MQ=255) aaTGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGtta < 1:2467682/91‑1 (MQ=255) aaTGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGtta < 1:2467296/91‑1 (MQ=255) aTGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaa > 1:1877363/1‑91 (MQ=255) tGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaat < 1:2782274/91‑1 (MQ=255) aTTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaattt < 1:3045914/91‑1 (MQ=255) ttGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaattta < 1:745123/91‑1 (MQ=255) tGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaatttaa < 1:2880239/91‑1 (MQ=255) tGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaatttaa > 1:1709826/1‑91 (MQ=255) ttttAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTtaata > 1:76598/1‑91 (MQ=255) tAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAAtt < 1:2507691/91‑1 (MQ=255) aGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTaa > 1:513649/1‑91 (MQ=255) gTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTaaa > 1:662424/1‑91 (MQ=255) tGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAat > 1:129535/1‑91 (MQ=255) gggACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATTATTAAatt < 1:2644381/91‑2 (MQ=255) gACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAAtata < 1:589272/91‑1 (MQ=255) gACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAAtata > 1:2843879/1‑91 (MQ=255) aCTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATaa > 1:1111719/1‑91 (MQ=255) tttttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAg > 1:3144490/1‑91 (MQ=255) tttttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAg < 1:3039953/91‑1 (MQ=255) ttttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGa > 1:3305436/1‑91 (MQ=255) tttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGAc > 1:103304/1‑91 (MQ=255) tttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGAc < 1:3308118/91‑1 (MQ=255) tataTTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGTCAAGTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGa < 1:3497419/91‑1 (MQ=255) atatTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGAt > 1:3883072/1‑91 (MQ=255) atatTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGAt > 1:1742857/1‑91 (MQ=255) atatTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGAt > 1:1964255/1‑91 (MQ=255) ttGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATtta > 1:1146952/1‑91 (MQ=255) tGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttat < 1:4085636/91‑1 (MQ=255) tGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttat < 1:2364981/91‑1 (MQ=255) tGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttat > 1:885841/1‑91 (MQ=255) gCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAGATTTGTTAATTTAATAATTATATGTAAAGACGATttatt < 1:1704148/91‑1 (MQ=255) gCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttatt < 1:1540794/91‑1 (MQ=255) gCGAAAAAGAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttatt < 1:59109/91‑1 (MQ=255) aataatTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGtttt > 1:1076383/1‑91 (MQ=255) ataatTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGttttt > 1:320601/1‑91 (MQ=255) ataatTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGttttt < 1:2712524/91‑1 (MQ=255) ataatTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGttttt > 1:67162/1‑91 (MQ=255) taatTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTa < 1:904296/91‑1 (MQ=255) atTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggact < 1:1159952‑M2/91‑61 (MQ=255) atTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACg > 1:797805/1‑91 (MQ=255) atTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACg > 1:797605/1‑91 (MQ=255) atTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACg < 1:1025454/91‑1 (MQ=255) atTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACg > 1:3355349/1‑91 (MQ=255) ttGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggactt < 1:2372478‑M2/91‑62 (MQ=255) ttGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGt < 1:552228/91‑1 (MQ=255) tGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttcaaacaatcattttaagcgggacttt < 1:3853864‑M2/91‑63 (MQ=255) tGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggacttt < 1:1463470‑M2/91‑63 (MQ=255) tGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGtt > 1:1050729/1‑91 (MQ=255) tGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGtt > 1:390810/1‑91 (MQ=255) tGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCAGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGtt < 1:3319370/91‑1 (MQ=255) cGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTc < 1:4012442/91‑1 (MQ=255) gAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggactttttat < 1:3106048‑M2/91‑67 (MQ=255) gAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCt < 1:3828562/91‑1 (MQ=255) gAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGt < 1:723123/91‑1 (MQ=255) gAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGt < 1:3054466/91‑1 (MQ=255) aGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTa < 1:1980409/91‑1 (MQ=255) aGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTa < 1:1996880/91‑1 (MQ=255) gTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggactttttatattgagt < 1:1898262‑M2/91‑74 (MQ=255) gTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAAt > 1:3447551/1‑91 (MQ=255) gTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAAt > 1:4096123/1‑91 (MQ=255) gTAACTGGACACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggactttttagattgagt < 1:2086544‑M2/91‑74 (MQ=255) tAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATa < 1:318960/91‑1 (MQ=255) ggATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAAt > 1:2784585/1‑91 (MQ=255) ggATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAAt < 1:2509074/91‑1 (MQ=255) ggATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAAt < 1:1163315/91‑1 (MQ=255) tACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCa < 1:431163/91‑1 (MQ=255) aCCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCaa > 1:1370321/1‑91 (MQ=255) aCCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCaa > 1:817704/1‑91 (MQ=255) aCCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCaa > 1:3549268/1‑91 (MQ=255) aCCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATCAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCaa > 1:3505284/1‑91 (MQ=255) cTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACg > 1:580847/1‑91 (MQ=255) cTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACg < 1:4119807/91‑1 (MQ=255) cTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACg > 1:2745634/1‑91 (MQ=255) cTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACg < 1:1235238/91‑1 (MQ=255) cATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACGAt < 1:3220420/91‑1 (MQ=255) aTCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACGATg < 1:3810140/91‑1 (MQ=255) ccGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACGATGCt > 1:1001269/1‑91 (MQ=255) | ATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACGATGCT > USA300TCH1516_ALE/1136160‑1136339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |