New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1199293 | 92 (0.940) | 9 (0.100) | 8/144 | NT | 8.7% | intergenic (+20/‑63) | USA300HOU_RS05980/USA300HOU_RS05985 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1199312 | 106 (1.200) | intergenic (+39/‑44) | USA300HOU_RS05980/USA300HOU_RS05985 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
CCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATATTTA > USA300TCH1516_ALE/1199222‑1199402 | ccAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTa < 1:2931257/91‑1 (MQ=255) aaaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcc < 1:2514659‑M2/91‑4 (MQ=255) aaaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcc > 1:2939348‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcc > 1:2286900‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcc > 1:3818323‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcc > 1:2939305‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaaGGGTTACGCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcc > 1:3763200‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcct < 1:1274263‑M2/91‑5 (MQ=255) aaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcct > 1:2201443‑M2/1‑87 (MQ=255) aaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcct > 1:3870420‑M2/1‑87 (MQ=255) gggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgt < 1:1188743‑M2/91‑8 (MQ=255) gggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgt < 1:1188819‑M2/91‑8 (MQ=255) ggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgtt < 1:3454112‑M2/91‑9 (MQ=255) tACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGttttt > 1:1665609/1‑91 (MQ=255) ccAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGata < 1:1662438/91‑1 (MQ=255) aaaTCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATg < 1:3714671/91‑1 (MQ=255) aaTCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGc > 1:1526729/1‑91 (MQ=255) aTCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCa < 1:2766555/91‑1 (MQ=255) tCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAt < 1:3949253/91‑1 (MQ=255) tCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAt < 1:520246/91‑1 (MQ=255) tCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAt < 1:520437/91‑1 (MQ=255) cTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAtt > 1:2468768/1‑91 (MQ=255) cTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAtt < 1:2840114/91‑1 (MQ=255) cTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAtt > 1:2470042/1‑91 (MQ=255) cTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAtt < 1:3604270/91‑1 (MQ=255) tttAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAttt < 1:1677595/91‑1 (MQ=255) tgtAATTGAATTAAAATCCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAttt > 1:2737099/3‑91 (MQ=38) ttAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAtttt > 1:3657828/1‑91 (MQ=255) ttAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAtttt > 1:1776990/1‑91 (MQ=255) ttAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAtttt > 1:1331131/1‑91 (MQ=255) tAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAttttt > 1:1517678/1‑91 (MQ=255) tAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAttttt < 1:1388096/91‑1 (MQ=255) tAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAttttt > 1:2642619/1‑91 (MQ=255) aaTTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTc > 1:2250672/1‑91 (MQ=255) aaTTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTc > 1:1053743/1‑91 (MQ=255) ttGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTg < 1:3716975/91‑1 (MQ=255) ttGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTg < 1:745268/91‑1 (MQ=255) tGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGa < 1:1134392/91‑1 (MQ=255) ttttAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAatat > 1:3785817/1‑91 (MQ=255) aaTTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAgg < 1:1964653/91‑1 (MQ=255) aTTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAggg < 1:4027353/91‑1 (MQ=255) tCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCa > 1:3879648/1‑91 (MQ=255) cAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCaa > 1:2066744/1‑91 (MQ=255) aTTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATa < 1:445900/91‑1 (MQ=255) aaTAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATgg > 1:1557816/1‑91 (MQ=255) aaTAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATgg > 1:3225003/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAt > 1:4047908/1‑91 (MQ=255) ttAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAtttt < 1:2690967/91‑1 (MQ=255) ttAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAtttt < 1:1943684/91‑1 (MQ=255) ttAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAtttt < 1:1295970/91‑1 (MQ=255) ttAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAtttt < 1:2743209/91‑1 (MQ=255) ttAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAtttt < 1:710836/91‑1 (MQ=255) tAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatt < 1:1895069‑M2/91‑55 (MQ=255) aGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTtata < 1:502613/91‑1 (MQ=255) aGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTtata < 1:4085966/91‑1 (MQ=255) gCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATaa < 1:2429774/91‑1 (MQ=255) gCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATaa < 1:1940804/91‑1 (MQ=255) cGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAAt > 1:2571211/1‑91 (MQ=255) cATATCGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAAtttt < 1:3450447/91‑1 (MQ=255) aTAACGAGGCAACGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAAttttt > 1:3195852/1‑91 (MQ=255) aCGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTa > 1:2794000/1‑91 (MQ=255) cGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccct < 1:3837499‑M2/91‑67 (MQ=255) cGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTaa > 1:2136258/1‑91 (MQ=255) cGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTaa > 1:2213353/1‑91 (MQ=255) gAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAg > 1:2564231/1‑91 (MQ=255) ggCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctttt < 1:2145408‑M2/91‑70 (MQ=255) cAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctttttg < 1:845703‑M2/91‑72 (MQ=255) cAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAg < 1:457719/91‑1 (MQ=255) aaGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctttttgg < 1:3385250‑M2/91‑73 (MQ=255) aaGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGt > 1:1158542/1‑91 (MQ=255) aaGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGt > 1:3311952/1‑91 (MQ=255) aaGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGt < 1:2512235/91‑1 (MQ=255) aaGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGt > 1:933020/1‑91 (MQ=255) aGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTg > 1:4075962/1‑91 (MQ=255) aGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTg < 1:940335/91‑1 (MQ=255) gggTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGa > 1:3013076/1‑91 (MQ=255) gggTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGa > 1:3013292/1‑91 (MQ=255) ggTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGTAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGAt > 1:1810639/1‑91 (MQ=255) gTACGTGATGCTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGAtt < 1:3972155/91‑1 (MQ=255) gTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctttttggaata > 1:1588136‑M2/1‑15 (MQ=255) gTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctttttggaata < 1:3367947‑M2/91‑77 (MQ=255) tACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTa > 1:627898/1‑91 (MQ=255) aCATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTaa < 1:3884990/91‑1 (MQ=255) cATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGAGATTAAc > 1:2080311/1‑91 (MQ=255) aTGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACa < 1:420705/91‑1 (MQ=255) aTGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACa > 1:3435199/1‑91 (MQ=255) tGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACAt > 1:472454/1‑91 (MQ=255) tGATACTTTAGCCTCGCTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTATCAt > 1:2376963/1‑91 (MQ=255) gATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATa < 1:4104048/91‑1 (MQ=255) gATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATa < 1:1396950/91‑1 (MQ=255) aTACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAg < 1:3081783/91‑1 (MQ=255) aTACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAg < 1:3081296/91‑1 (MQ=255) aTACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAg < 1:2370905/91‑1 (MQ=255) tACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGACTAACATAGa > 1:3722203/1‑91 (MQ=255) aCTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGat < 1:2471158/91‑1 (MQ=255) tttAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGatat > 1:3553955/1‑91 (MQ=255) tAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATAttt > 1:1753077/1‑91 (MQ=255) tAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATAttt > 1:355889/1‑91 (MQ=255) tAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATAttt > 1:2438528/1‑91 (MQ=255) aGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATATTTa < 1:2275725/91‑1 (MQ=255) | CCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGTGATTAACATAGATATTTA > USA300TCH1516_ALE/1199222‑1199402 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |