| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1265511 | 93 (0.950) | 17 (0.210) | 10/130 | NT | 17.1% | intergenic (+19/‑154) | femA_1/dprA | Aminoacyltransferase FemA/DNA processing protein DprA |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1265527 | 89 (1.110) | intergenic (+35/‑138) | femA_1/dprA | Aminoacyltransferase FemA/DNA processing protein DprA | |||||
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
TCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAA > USA300TCH1516_ALE/1265437‑1265616 | tcaAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTc < 1:2741687/91‑1 (MQ=255)acaaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTc > 1:3145474‑M1/61‑91 (MQ=255)acaaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTc > 1:3145447‑M1/61‑91 (MQ=255) cAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCt > 1:297125‑M2/1‑90 (MQ=255) aaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtt > 1:745272‑M1/59‑91 (MQ=255) aaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtt > 1:484614‑M1/59‑91 (MQ=255) aaCCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCttt < 1:1875906‑M2/91‑4 (MQ=255) aaCCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCttt < 1:382080‑M2/91‑4 (MQ=255) aaCCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCttt > 1:2638072‑M2/1‑88 (MQ=255) aaCCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCttt > 1:64890‑M2/1‑88 (MQ=255) aaCCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCttt < 1:3718687‑M2/91‑4 (MQ=255) aCCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttc < 1:3937493‑M2/91‑5 (MQ=255) ccAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttcc > 1:1860362‑M2/1‑86 (MQ=255) aGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaa < 1:38224‑M2/91‑8 (MQ=255) attgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAAc > 1:1276840‑M1/53‑91 (MQ=255) ttgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACa > 1:533946‑M1/52‑91 (MQ=255) aGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacata < 1:1293472‑M2/91‑12 (MQ=255) aGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTCATAAGGTTTAATCATAAAGTATGTTAGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacata < 1:3307659‑M2/91‑12 (MQ=255) gACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatac < 1:2261587‑M2/91‑13 (MQ=255) aCCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatact < 1:1231197‑M2/91‑14 (MQ=255) ccAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactt > 1:753694‑M2/1‑77 (MQ=255) cAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatacttt > 1:3212572‑M2/1‑76 (MQ=255) cAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatacttt < 1:3436223‑M2/91‑16 (MQ=255) cAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatacttt > 1:17523‑M2/1‑76 (MQ=255) cAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatacttt > 1:3998629‑M2/1‑76 (MQ=255) cAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatacttt > 1:3026625‑M2/1‑76 (MQ=255) aaTTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACtttt > 1:285399/1‑91 (MQ=255) aaTTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACtttt > 1:3227603/1‑91 (MQ=255) aTTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTc > 1:3157501/1‑91 (MQ=255) aTTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTc > 1:1402270/1‑91 (MQ=255) tCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCAc < 1:3653605/91‑1 (MQ=255) tataAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACtttt < 1:775592/91‑1 (MQ=255) taAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAGTTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTa < 1:3598691/91‑1 (MQ=255) aaaTTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTaa > 1:2042007/1‑91 (MQ=255) aTTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTatta < 1:2262354/91‑4 (MQ=255) aTTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGt < 1:158816/91‑1 (MQ=255) cAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTa > 1:552608/1‑91 (MQ=255) aaCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATCCTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAttt > 1:3860390/1‑91 (MQ=255) aCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAtttt > 1:3193908/1‑91 (MQ=255) aCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAtttt > 1:3165297/1‑91 (MQ=255) cTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAttttt < 1:2138681/91‑1 (MQ=255) ttatttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTa > 1:138660/1‑91 (MQ=255) tttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTc > 1:1844948/1‑91 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTcc > 1:235090/1‑91 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTcc > 1:3839403/1‑91 (MQ=255) tataAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCt > 1:3901575/1‑91 (MQ=255) ataAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCtt > 1:1190464/1‑91 (MQ=255) taAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTa > 1:2347921/1‑91 (MQ=255) aaGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaa < 1:1698824/91‑1 (MQ=255) ggTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaaaa > 1:2575165/1‑91 (MQ=255) gTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAAt > 1:1067658/1‑91 (MQ=255) gTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAAt > 1:3122792/1‑91 (MQ=255) ttAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATaa > 1:432840/1‑91 (MQ=255) ttAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATaa > 1:1352859/1‑91 (MQ=255) ttAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATaa > 1:33644/1‑91 (MQ=255) tAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATATTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAAc < 1:4061507/91‑1 (MQ=255) aaTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACa < 1:1010883/91‑1 (MQ=255) aaTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACa > 1:1945437/1‑91 (MQ=255) aaTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACa > 1:1947341/1‑91 (MQ=255) aaTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACa > 1:2509306/1‑91 (MQ=255) aTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACAt < 1:110818/91‑1 (MQ=255) aTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACAt > 1:3783675/1‑91 (MQ=255) aTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACAt > 1:3388121/1‑91 (MQ=255) ataAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTAc > 1:447167/1‑91 (MQ=255) taAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACa > 1:3641696/1‑91 (MQ=255) aaGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttctatagaattgg < 1:3759864‑M2/91‑62 (MQ=255) AGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAATATTACATCg < 1:3964715‑M1/91‑1 (MQ=255) GTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGa < 1:2673459‑M1/91‑1 (MQ=255) tATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtct < 1:2134046‑M2/91‑65 (MQ=255) TATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGAc > 1:715580‑M1/1‑91 (MQ=255) TATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGAc > 1:1533773‑M1/1‑91 (MQ=255) aTGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtctt < 1:3098858‑M2/91‑66 (MQ=255) ATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACa > 1:2810468‑M1/1‑91 (MQ=255) TGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACaa < 1:2173720‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACaa < 1:2427741‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACaa > 1:259415‑M1/1‑91 (MQ=255) TGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACaa > 1:1572319‑M1/1‑91 (MQ=255) gTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttac < 1:685040‑M2/91‑68 (MQ=255) GTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTATGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAAt < 1:1496170‑M1/91‑1 (MQ=255) TTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATg > 1:4093285‑M1/1‑91 (MQ=255) TTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATg > 1:85669‑M1/1‑91 (MQ=255) TTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATg < 1:3006561‑M1/91‑1 (MQ=255) TGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGt < 1:3635053‑M1/91‑1 (MQ=255) ggAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactgg < 1:2545083‑M2/91‑71 (MQ=255) ggAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactgg < 1:2543835‑M2/91‑71 (MQ=255) GGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGtt > 1:3248361‑M1/1‑91 (MQ=255) AAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTGAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGtttt > 1:4139154‑M1/1‑91 (MQ=255) attgaaattTTAAATCCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttg < 1:1147856‑M2/91‑75 (MQ=255) gaaattTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatg < 1:2922958‑M2/91‑78 (MQ=255) gaaattTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatg < 1:2026642‑M2/91‑78 (MQ=255) gaaattTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTAt > 1:3677240/1‑91 (MQ=255) gaaattTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTAt > 1:2310402/1‑91 (MQ=255) aaattTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatga < 1:1257216‑M2/91‑79 (MQ=255) ttttAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGa < 1:3580269/91‑1 (MQ=255) ttttAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGa < 1:1446198/91‑1 (MQ=255) tttAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGaa < 1:1610873/91‑1 (MQ=255) ttAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGaaa > 1:587825/1‑91 (MQ=255) aaaTTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATg > 1:2833529/1‑91 (MQ=255) aaaTTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATg > 1:3990006/1‑91 (MQ=255) tCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGCATTCTTACTCCTCAAAATAACATTAGATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTaaa > 1:3316307/1‑91 (MQ=255) | TCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAA > USA300TCH1516_ALE/1265437‑1265616 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |