New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1368741 = | 111 (1.130) | 7 (0.080) | 4/150 | NT | 6.3% | intergenic (+145/+235) | USA300TCH1516_01277/lexA_1 | hypothetical protein/LexA repressor |
? | USA300TCH1516_ALE | 1368771 = | 103 (1.120) | intergenic (+175/+205) | USA300TCH1516_01277/lexA_1 | hypothetical protein/LexA repressor |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
ATATACTTGAACGCGTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGCAATTTCTGTTTG > USA300TCH1516_ALE/1368682‑1368859 | atatACTTGAACGCGTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGtt < 1:348966/91‑1 (MQ=255) atatACTTGAACGCGTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGtt < 1:1186631/91‑1 (MQ=255) ttGAACGCGTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAAtt > 1:627531/1‑91 (MQ=255) tGAACGCGTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAAttt > 1:1544378/1‑91 (MQ=255) tGAACGCGTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGACTTTTAAttt > 1:3972441/1‑91 (MQ=255) tGAACGCGTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGACTTTTAAttt > 1:3972296/1‑91 (MQ=255) aaCGCGTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTtgt > 1:2544538/1‑91 (MQ=255) tataaattttgaattacagatttctgcaaaatgttacacaaattaaaaCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTgtgt > 1:1911297‑M1/49‑91 (MQ=255) cgcgTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTgtgt < 1:2712540/91‑1 (MQ=255) cgcgTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTgtgt < 1:1483668/91‑1 (MQ=255) cgcgTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTgtgt < 1:582175/91‑1 (MQ=255) cgcgTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTgtgt < 1:2490995/91‑1 (MQ=255) cgTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTaa > 1:1312586/1‑91 (MQ=255) cgTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTaa < 1:2382600/91‑1 (MQ=255) cgTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTaa < 1:2382614/91‑1 (MQ=255) cgTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTaa > 1:2358605/1‑91 (MQ=255) cgTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTaa > 1:2358307/1‑91 (MQ=255) tCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACa > 1:201884/1‑91 (MQ=255) tCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACa > 1:198765/1‑91 (MQ=255) cAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACAt > 1:3836900/1‑91 (MQ=255) gATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAGTGATAATGGCTCGCACCTGTAAAGTATGACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTg < 1:3317553/91‑1 (MQ=255) gATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTg < 1:2503893/91‑1 (MQ=255) gATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTg < 1:1050955/91‑1 (MQ=255) gATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTg < 1:63366/91‑1 (MQ=255) gATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTg < 1:1063751/91‑1 (MQ=255) taCTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGa < 1:716057/91‑1 (MQ=255) taCTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGa < 1:4084693/91‑1 (MQ=255) aCTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGaa > 1:2845954/1‑91 (MQ=255) aCTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGaa > 1:238194/1‑91 (MQ=255) taataaAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATc < 1:2788535/91‑1 (MQ=255) ataaAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTg < 1:3212178/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTa > 1:2234896/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTa > 1:1240937/1‑91 (MQ=255) aaaaGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAAt > 1:5510/1‑91 (MQ=255) aaaaGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAAt < 1:767624/91‑1 (MQ=255) aaagaaagAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAAtt > 1:2295787/1‑91 (MQ=255) aaagaaagAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAAtt < 1:4072743/91‑1 (MQ=255) aaagaaagAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAAtt > 1:1950937/1‑91 (MQ=255) aagaaagaAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTc < 1:2785695/91‑1 (MQ=255) aagaaagaAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTc < 1:1208524/91‑1 (MQ=255) aagaaagaAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTc < 1:1317040/91‑1 (MQ=255) aagaaaAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCaaaa < 1:1779156/91‑1 (MQ=255) gaaaAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAAtt > 1:1307991/1‑91 (MQ=255) gaaaAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAAtt < 1:3220283/91‑1 (MQ=255) gaaaAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAAtt > 1:1469315/1‑91 (MQ=255) aaaaTAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTtata > 1:4029992/1‑91 (MQ=255) aataataatGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATAtt < 1:2631205/91‑1 (MQ=255) ataataatGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTa < 1:262680/91‑1 (MQ=255) ataataatGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTa > 1:2919930/1‑91 (MQ=255) ataatGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAg > 1:3779213/1‑91 (MQ=255) ataatGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAg > 1:1791402/1‑91 (MQ=255) ataatGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAg > 1:3014852/1‑91 (MQ=255) taatGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGa > 1:2903625/1‑91 (MQ=255) aatGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGaa > 1:570607/1‑91 (MQ=255) aatGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGaa > 1:3373601/1‑91 (MQ=255) atGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAAt > 1:468219/1‑91 (MQ=255) ggCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATga < 1:768672/91‑1 (MQ=255) gctcgctcCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATgag < 1:1127062/91‑1 (MQ=255) gctcgctcCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATgag < 1:1415359/91‑1 (MQ=255) gctcgctcCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATgag < 1:1607392/91‑1 (MQ=255) gctcgctcCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATgag < 1:1607532/91‑1 (MQ=255) gctcgctcCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATgag < 1:1184785/91‑1 (MQ=255) TCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAAGATTTTGCAGAAATCTGTAATTCCAAATTTATATTAAAGAATGAGAt > 1:3288202‑M1/1‑91 (MQ=255) cgcccccgtaataatttacaggagcgagTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGAtt > 1:2058484‑M2/29‑91 (MQ=255) CTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTAt < 1:1249105‑M1/91‑1 (MQ=255) CTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTAt < 1:761279‑M1/91‑1 (MQ=255) CTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTAt < 1:761358‑M1/91‑1 (MQ=255) tcCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATc < 1:124168/91‑1 (MQ=255) tcCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATc < 1:474980/91‑1 (MQ=255) tcCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATc < 1:2692236/91‑1 (MQ=255) cccgtaataatttacaggagcgagTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCt > 1:3764794‑M2/25‑91 (MQ=255) cccgtaataatttacaggagcgagTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCt > 1:3764930‑M2/25‑91 (MQ=255) cccgtaataatttacaggagcgagTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATCATCt > 1:2765367‑M2/25‑91 (MQ=255) ccTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCt < 1:20204/91‑1 (MQ=255) ccTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCt < 1:1010031/91‑1 (MQ=255) ccTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCt < 1:3908625/91‑1 (MQ=255) tGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTaa > 1:3800896/1‑91 (MQ=255) gTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAAAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAAc < 1:583932/91‑1 (MQ=255) aaaTTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACaa < 1:300749/91‑1 (MQ=255) aaaTTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACaa > 1:3761600/1‑91 (MQ=255) aaTTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAAt > 1:259681/1‑91 (MQ=255) aaTTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAAt < 1:3579035/91‑1 (MQ=255) attattACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAAtt > 1:3604629/1‑91 (MQ=255) ttattaCGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTc < 1:622673/91‑1 (MQ=255) ttattaCGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTc < 1:2957912/91‑1 (MQ=255) ttattaCGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTc < 1:1649576/91‑1 (MQ=255) ttattaCGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTc < 1:2562812/91‑1 (MQ=255) ttattaCGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTc > 1:3756784/1‑91 (MQ=255) attaCGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAGTTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTTGc > 1:361193/1‑91 (MQ=255) attaCGGGGGCGAGTTTTAAGTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGc < 1:2606671/91‑1 (MQ=255) ttaCGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTCGCACAAATCTGTCATTCAAAATTTACATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGCa > 1:3312315/1‑91 (MQ=255) taCGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAGCATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGCaa > 1:3264012/1‑91 (MQ=255) taCGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGCaa > 1:3264011/1‑91 (MQ=255) gggggCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGCAAttt < 1:3443145/91‑1 (MQ=255) gggggCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGCAAttt < 1:922992/91‑1 (MQ=255) ggCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGCAATTTCTg < 1:1937535/91‑1 (MQ=255) agTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGCAATTTCTGTTTg < 1:421870‑M2/89‑1 (MQ=255) agTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGCAATTTCTGTTTg > 1:3383401‑M2/3‑91 (MQ=255) agTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGCAATTTCTGTTTg > 1:3383295‑M2/3‑91 (MQ=255) agTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGCAATTTCTGTTTg > 1:3383202‑M2/3‑91 (MQ=255) | ATATACTTGAACGCGTCAAAGATATACTTAATAAAAAAGAAAGAAAAAAATAATAATGGCTCGCTCCTGTAAATTATTACGGGGGCGAGTTTTAATTTGTGTAACATTTTGCAGAAATCTGTAATTCAAAATTTATATTAAAGAATGAGATTATCTAACAATTCGCAATTTCTGTTTG > USA300TCH1516_ALE/1368682‑1368859 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |