| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1456995 = | 90 (0.920) | 16 (0.170) +TTAAA |
8/150 | NT | 14.9% | intergenic (‑109/‑135) | USA300HOU_RS07230/USA300HOU_RS07235 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1918582 | 105 (1.070) | intergenic (‑300/+198) | USA300HOU_RS07235/USA300HOU_RS09510 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
TAGAACCTTTTCTGAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCACTCAT > USA300TCH1516_ALE/1918492‑1918672 | tAGAACCTTTTGTGAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGctc > 1:737864/1‑91 (MQ=255) aGAACCTTTTCTGAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGctcc > 1:4061348/1‑91 (MQ=255) aGAACCTTTTCTGAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGctcc < 1:2296062/91‑1 (MQ=255) gAACCTTTTCTGAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTTTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGctcct > 1:3488030/1‑91 (MQ=255) aCCTTTTCTGAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCctct > 1:224498/1‑91 (MQ=255) ttCTGAACCATACGCATA‑GCGTATGCTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTAttt < 1:3852731/91‑1 (MQ=255) cTGAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTa > 1:1199341/1‑91 (MQ=255) cTGAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTa < 1:210405/91‑1 (MQ=255) tGAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTAt > 1:3095395/1‑91 (MQ=255) gAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTAtg < 1:3826385/91‑1 (MQ=255) gAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTAtg < 1:2366308/91‑1 (MQ=255) gAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTAtg < 1:2365666/91‑1 (MQ=255) aaaCCATACGCTAT‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTAtg > 1:3100607/2‑91 (MQ=39) aCCATACGC‑TATGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTAtgtg > 1:3719149/1‑91 (MQ=255) aCCATACGC‑TATGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTAtgtg > 1:684217/1‑91 (MQ=255) cATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCt < 1:360693/91‑1 (MQ=255) cATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCt < 1:3627905/91‑1 (MQ=255) cATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCt > 1:366186/1‑91 (MQ=255) aCGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTaaa < 1:345168/91‑1 (MQ=255) aCGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTAGAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTaaa < 1:24682/91‑1 (MQ=255) cGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTAGAATTAAAGAGCCATCCGTTGTTATAGTGTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTaaaa < 1:3851723/91‑1 (MQ=39) gCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTaaaaa > 1:1088901/1‑91 (MQ=255) gCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTaaaaa < 1:3441208/91‑1 (MQ=255) gCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTaaaaa < 1:587221/91‑1 (MQ=255) ctatgCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGCGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAAt > 1:1724260/5‑91 (MQ=255) ctatgCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAACAt > 1:1410/5‑91 (MQ=255) ctatgCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAAt > 1:280184/5‑91 (MQ=255) ctatgCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTACAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAAt > 1:4143833/5‑91 (MQ=255) tA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAAttt > 1:2795241/1‑91 (MQ=255) atgCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAAttt > 1:1441593/3‑91 (MQ=255) tgCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTta > 1:2456070/2‑91 (MQ=255) aTGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGc > 1:3842009/1‑91 (MQ=255) aTGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGc < 1:2400704/91‑1 (MQ=255) ggTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCaa > 1:943311/1‑91 (MQ=255) gTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAAt > 1:520359/1‑91 (MQ=255) tttCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAAttt < 1:869117/91‑1 (MQ=255) ttCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAAtttt > 1:1026368/1‑91 (MQ=255) cTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTttat < 1:1780759/91‑1 (MQ=255) cTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTttat < 1:2208657/91‑1 (MQ=255) ttACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTaca < 1:2103563/91‑1 (MQ=255) ttACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTaca < 1:2103794/91‑1 (MQ=255) tACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTacaa < 1:2962080/91‑1 (MQ=255) aaatAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTAcaacaa < 1:698034/88‑1 (MQ=255) aTTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAAt > 1:307221/1‑91 (MQ=255) aTTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAAt < 1:2511201/91‑1 (MQ=255) ttAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATg < 1:620384/91‑1 (MQ=255) ttAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATg < 1:621812/91‑1 (MQ=255) tAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGt < 1:2311649/91‑1 (MQ=255) tAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGt > 1:1612771/1‑91 (MQ=255) aaGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTAc > 1:652750/1‑91 (MQ=255) agCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACAtt < 1:2172049/91‑1 (MQ=255) ccAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTa > 1:1378371/1‑91 (MQ=255) cAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTaa < 1:1798525/91‑1 (MQ=255) cAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGCGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTaa > 1:3292560/1‑91 (MQ=255) aCCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAgg < 1:456606/91‑1 (MQ=255) aCCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAgg < 1:456367/91‑1 (MQ=255) ccGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgt < 1:145745‑M2/91‑62 (MQ=255) ccGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGt > 1:1825493/1‑91 (MQ=255) cGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTg > 1:530622/1‑91 (MQ=255) cGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTg > 1:3626126/1‑91 (MQ=255) cGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTg < 1:3270164/91‑1 (MQ=255) gttgttATAGTCTAACAATGGTTGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtca < 1:1882826‑M2/91‑64 (MQ=255) ttgttATAGTCTAACAATGGTTGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccgttgtcac < 1:2083914‑M2/91‑65 (MQ=255) ttgttATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGAc < 1:90029/91‑1 (MQ=255) gttATAGTCTAACAATGGTTGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaa < 1:1395590‑M2/91‑67 (MQ=255) gttATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCt < 1:1143681/91‑1 (MQ=255) ttATAGTCTAACAATGGTTGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaa < 1:2633459‑M2/91‑68 (MQ=255) ataGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCa > 1:3936362/1‑91 (MQ=255) ataGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCa < 1:1686749/91‑1 (MQ=255) taGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCAt < 1:587409/91‑1 (MQ=255) aGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATg < 1:2844245/91‑1 (MQ=255) tCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGcc < 1:1063765/91‑1 (MQ=255) tCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGcc < 1:2352015/91‑1 (MQ=255) cTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCa < 1:4128771/91‑1 (MQ=255) aaCAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCaaa > 1:1342146/1‑91 (MQ=255) aaCAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCaaa < 1:2098369/91‑1 (MQ=255) cAATGGTTGCCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAAt > 1:2080133/1‑91 (MQ=255) aTGGTTGGCTCCGCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCg > 1:3193897/1‑91 (MQ=255) tGGTTGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctac < 1:3633148‑M2/91‑82 (MQ=255) ggTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTGATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCa < 1:3402385/91‑1 (MQ=255) gTTGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgt > 1:2366357‑M2/1‑8 (MQ=255) tGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgc < 1:3624639‑M2/91‑86 (MQ=255) tGGCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgc < 1:1886735‑M2/91‑86 (MQ=255) tGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCa > 1:3360880/1‑91 (MQ=255) tGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCa < 1:3993167/91‑1 (MQ=255) tGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCa < 1:3992661/91‑1 (MQ=255) tGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCa < 1:719380/91‑1 (MQ=255) ggCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgct < 1:143220‑M2/91‑87 (MQ=255) ggCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgct > 1:1445644‑M2/1‑5 (MQ=255) ggCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCAc > 1:1987990/1‑91 (MQ=255) gCTCtttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgcta < 1:390803‑M2/91‑88 (MQ=255) gCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCACt > 1:3024354/1‑91 (MQ=255) gCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCACt < 1:1492564/91‑1 (MQ=255) ctctttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgctag < 1:2422508‑M2/91‑89 (MQ=255) ctctttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgctag < 1:862207‑M2/91‑89 (MQ=255) ctctttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgctag < 1:3022722‑M2/91‑89 (MQ=255) tcctcTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCACTCa > 1:3467952/1‑91 (MQ=255) ctttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgctagaa > 1:3519651‑M2/1‑1 (MQ=255) ctttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgctagaa < 1:2637023‑M2/91‑91 (MQ=255) ctttaattgtaaaaagaaaaccatacgctatgcgtatggttcagaaaaggttctaccattgtcacaaaaaatgcatctctacgtgctagaa > 1:3519746‑M2/1‑1 (MQ=255) | TAGAACCTTTTCTGAACCATACGCATA‑GCGTATGGTTTTCTTTTTACAATTAAAGAGCCAACCGTTGTTATAGTCTAACAATGGTTGGCTCCTCTTATTTTATGTGCTAAAAATTTATAGGCAATTTTATTACAACAATGTACATTTAAGGTGACCTTCATGCCAAAATCGCATCACTCAT > USA300TCH1516_ALE/1918492‑1918672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |