New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1555332 = | 91 (0.930) | 7 (0.080) | 5/140 | NT | 8.6% | intergenic (+28/+78) | USA300HOU_RS07605/ribU | Ferredoxin/Riboflavin transporter RibU |
? | USA300TCH1516_ALE | 1555376 = | 70 (0.810) | intergenic (+72/+34) | USA300HOU_RS07605/ribU | Ferredoxin/Riboflavin transporter RibU |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
CGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGA > USA300TCH1516_ALE/1555286‑1555466 | cGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTtta < 1:1830190/91‑1 (MQ=255) cGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTtta > 1:534882/1‑91 (MQ=255) gCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTttat < 1:1870375/91‑1 (MQ=255) cTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTttatt < 1:2109033/91‑1 (MQ=255) cTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTttatt > 1:1961479/1‑91 (MQ=255) cTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTttatt > 1:2914415/1‑91 (MQ=255) aaaaTTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTttattatta > 1:1206092/1‑91 (MQ=255) aaaaTTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTttattatta > 1:1504012/1‑91 (MQ=255) aaaTTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTtattattat > 1:306629/1‑91 (MQ=255) tttGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTAtgtg < 1:1876375/91‑1 (MQ=255) tttGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTAtgtg < 1:25032/91‑1 (MQ=255) tttGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTAtgtg < 1:1876271/91‑1 (MQ=255) tttGAATAATTGATTTTCTAGACAAATGTGCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTCATAGTCACCTGCTTTTTATTATTAtgtg < 1:24865/91‑1 (MQ=255) ttGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATgtgt > 1:2432479/1‑91 (MQ=255) ttGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATgtgt > 1:794474/1‑91 (MQ=255) ttGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATgtgt > 1:2431954/1‑91 (MQ=255) gAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGtat > 1:2659861/1‑91 (MQ=255) aataatTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGtata > 1:160866/1‑91 (MQ=255) atTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTAGTATTATGTGTAtattat > 1:3556068/1‑91 (MQ=255) ttttttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGc > 1:3034925/1‑91 (MQ=255) ttttttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGc < 1:2237731/91‑1 (MQ=255) ttttttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGc < 1:1763231/91‑1 (MQ=255) ttttttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGc > 1:3034809/1‑91 (MQ=255) ttttttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGc < 1:2585278/91‑1 (MQ=255) tttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCttt < 1:414886/91‑1 (MQ=255) ttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTa < 1:2659527/91‑1 (MQ=255) tAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTaa > 1:795905/1‑91 (MQ=255) aGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAAt > 1:292319/1‑91 (MQ=255) aGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAAt > 1:292337/1‑91 (MQ=255) aGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAAt < 1:1751769/91‑1 (MQ=255) cAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTg > 1:1175965/1‑91 (MQ=255) aaaTGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGa > 1:2631366/1‑91 (MQ=255) gTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTaa < 1:370975/91‑1 (MQ=255) gTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTaa < 1:2742475/91‑1 (MQ=255) gTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTaa < 1:1207473/91‑1 (MQ=255) ttCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTaaa > 1:2562068/1‑91 (MQ=255) cTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAAtt > 1:3076835/1‑91 (MQ=255) cTAGAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAAtt < 1:3734281/91‑1 (MQ=255) ataGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCt > 1:427141/1‑91 (MQ=255) taGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCtt < 1:3622188/91‑1 (MQ=255) aGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCttt < 1:2682563/91‑1 (MQ=255) aGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCttt < 1:343721/91‑1 (MQ=255) AAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTc < 1:544953‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTc < 1:544963‑M1/91‑1 (MQ=255) aaaagcaggtgactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCa > 1:2778334‑M2/44‑91 (MQ=255) AAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCa < 1:3748534‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCa > 1:1379751‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCa > 1:1379839‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCa > 1:3219011‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCa > 1:1910998‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAg < 1:2695986‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAg < 1:2695987‑M1/91‑1 (MQ=255) agcaggtgactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGa > 1:3029296‑M2/41‑91 (MQ=255) GCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGaa < 1:2910714‑M1/91‑1 (MQ=255) AGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAAt < 1:1127076‑M1/91‑1 (MQ=255) GGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAAtt > 1:2242113‑M1/1‑91 (MQ=255) GCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTc > 1:397492‑M1/1‑91 (MQ=255) GCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTc < 1:3407834‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTc > 1:3453875‑M1/1‑91 (MQ=255) tgactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCg > 1:1078483‑M2/35‑91 (MQ=255) tgactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCg > 1:1078326‑M2/35‑91 (MQ=255) tgactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCg > 1:1078625‑M2/35‑91 (MQ=255) gactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGATTTAATTTGATTCACTTCTTTTCAAGAAATTCGc > 1:2697453‑M2/34‑91 (MQ=255) aaGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGc < 1:3194407/91‑1 (MQ=255) aGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCa > 1:310029/1‑91 (MQ=255) aGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCa > 1:310057/1‑91 (MQ=255) gCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCaa < 1:3291767/91‑1 (MQ=255) cTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAg < 1:629565/91‑1 (MQ=255) tCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCTCAAGCCt < 1:1530483/91‑1 (MQ=255) tCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCt > 1:269274/1‑91 (MQ=255) cGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCtt > 1:311084/1‑91 (MQ=255) gTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCACGCCTTc < 1:3225190/91‑1 (MQ=255) gTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTc > 1:2475473/1‑91 (MQ=255) tttATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCt < 1:542052/91‑1 (MQ=255) aTTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCtata < 1:3569907/91‑1 (MQ=255) aTTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCtata > 1:36832/1‑91 (MQ=255) ttGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCtatat > 1:1122647/1‑91 (MQ=255) ttGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCtatat > 1:1123059/1‑91 (MQ=255) ttGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCtatat < 1:2419655/91‑1 (MQ=255) tGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCtatata < 1:883054/91‑1 (MQ=255) gATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAg > 1:1261905/1‑91 (MQ=255) gATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAg > 1:2086901/1‑91 (MQ=255) gATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAg < 1:313745/91‑1 (MQ=255) aTAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGt < 1:3717930/91‑1 (MQ=255) aGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTaa > 1:1453556/1‑91 (MQ=255) aGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTACTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTaa > 1:2334884/1‑91 (MQ=255) cACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAaaat > 1:2087299/1‑91 (MQ=255) cACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAaaat > 1:322375/1‑91 (MQ=255) cctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAaaataa < 1:3536098‑M2/81‑1 (MQ=255) cctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAaaataa > 1:726523‑M2/11‑91 (MQ=255) ctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAaaataaa > 1:1426106‑M2/10‑91 (MQ=255) tgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAaaataaat > 1:343649‑M2/9‑91 (MQ=255) tttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACa > 1:222507‑M2/6‑91 (MQ=255) ttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACaa > 1:2203615‑M2/5‑91 (MQ=255) tATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAg < 1:223820‑M2/90‑1 (MQ=255) tATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAg > 1:1491820‑M2/2‑91 (MQ=255) tATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAg < 1:1459667‑M2/90‑1 (MQ=255) tATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAg > 1:353523‑M2/2‑91 (MQ=255) attattatGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGa > 1:2031001/1‑91 (MQ=255) attattatGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGa > 1:2456951/1‑91 (MQ=255) | CGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGA > USA300TCH1516_ALE/1555286‑1555466 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |