| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1619603 = | 95 (0.970) | 12 (0.130) | 6/148 | NT | 11.5% | intergenic (+6/+99) | proC/rnz | Pyrroline‑5‑carboxylate reductase/Ribonuclease Z |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1619653 = | 96 (1.060) | intergenic (+56/+49) | proC/rnz | Pyrroline‑5‑carboxylate reductase/Ribonuclease Z | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATT > USA300TCH1516_ALE/1619563‑1619743 | tagtaTTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTAt > 1:3912508/1‑91 (MQ=255) aataaacaatgcttgccaaataacaataaattataaaaatAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTa > 1:2188151‑M1/41‑91 (MQ=255) taTTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTAtttt > 1:773110/1‑91 (MQ=255) aTTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTAttttt > 1:2786375/1‑91 (MQ=255) caatgcttgccaaataacaataaattataaaaatAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTta > 1:3443327‑M1/35‑91 (MQ=255) gAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTtata > 1:277735/1‑91 (MQ=255) atgcttgccaaataacaataaattataaaaacAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTtat > 1:1547800‑M1/33‑91 (MQ=255) aCTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAAt > 1:425925/1‑91 (MQ=255) cTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAAtt > 1:1311176/1‑91 (MQ=255) tttCTAATATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAAttt < 1:746551/91‑1 (MQ=255) ttCTAATATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTa > 1:2097544/1‑91 (MQ=255) ttCTAATATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTa > 1:2276520/1‑91 (MQ=255) cTAATATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTAtt > 1:2254658/1‑91 (MQ=255) aaTATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGt > 1:2917724/1‑91 (MQ=255) atatAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGtt < 1:1193969/91‑1 (MQ=255) tataGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTa < 1:1723605/91‑1 (MQ=255) tataGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTa < 1:1133801/91‑1 (MQ=255) tataGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTa > 1:1557644/1‑91 (MQ=255) taGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTAtt > 1:421269/1‑91 (MQ=255) taGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTAtt > 1:2974333/1‑91 (MQ=255) taGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTAtt > 1:573960/1‑91 (MQ=255) agaCCAATAAAAAC‑ACA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGc > 1:3539587/1‑91 (MQ=255) agaCCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGc > 1:424498/1‑91 (MQ=255) agaCCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGc < 1:149068/91‑1 (MQ=255) gaCCAATAAAAACAAAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCACAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGc > 1:712725/1‑91 (MQ=255) gaCCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCa < 1:1650791/91‑1 (MQ=255) gaCCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCa > 1:2338832/1‑91 (MQ=255) gaCCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCa > 1:3810539/1‑91 (MQ=255) gaCCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCa < 1:3379056/91‑1 (MQ=255) aCCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCaa > 1:2650881/1‑91 (MQ=255) aCCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCaa < 1:3241024/91‑1 (MQ=255) aCCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCaa < 1:2029828/91‑1 (MQ=255) aCCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCaa < 1:3240524/91‑1 (MQ=255) aaTAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCa > 1:1305728/1‑91 (MQ=255) aTAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCAt > 1:3959292/1‑91 (MQ=255) taaaaataacccgtcaaacacagtgcttgcgatgatgcatacatgtgttggcgggttATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTg > 1:3443327‑M2/58‑91 (MQ=255) ac‑aaa‑cCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTtta < 1:2782195/91‑1 (MQ=255) ac‑aaa‑cCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTtta > 1:2404554/1‑91 (MQ=255) ac‑aaa‑cCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTtta > 1:2404574/1‑91 (MQ=255) c‑aaa‑cCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTttat > 1:155586/1‑91 (MQ=255) c‑aaa‑cCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTttat > 1:2614878/1‑91 (MQ=255) taacccgtcaaacacagtgcttgcgatgatgcatacatgtgttggcgggtttGTTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTttat > 1:2850817‑M2/53‑91 (MQ=255) aaa‑cCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTttatt < 1:1409537/91‑1 (MQ=255) taacccgtcaaacacagtgcttgcgatgatgcatacatgtgttggcgggttATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTttatt > 1:2188151‑M2/52‑91 (MQ=255) AA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTttatta < 1:2871235‑M1/91‑1 (MQ=255) A‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTAc < 1:2722083‑M1/91‑1 (MQ=255) A‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTAc > 1:309855‑M1/1‑91 (MQ=255) A‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTAc < 1:1736718‑M1/91‑1 (MQ=255) A‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTAc < 1:1736651‑M1/91‑1 (MQ=255) A‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTAc < 1:143400‑M1/91‑1 (MQ=255) CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACt < 1:3142008‑M1/91‑1 (MQ=255) CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACAGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACt < 1:1130515‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTg < 1:2352558‑M1/91‑1 (MQ=255) aaacacagtgcttgcgatgatgcatacatgtgttggcgggttATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCa > 1:3341760‑M2/43‑91 (MQ=255) aaacacagtgcttgcgatgatgcatacatgtgttggcgggttATTTTTATAATCTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATCACTTTGTCa > 1:4054081‑M2/43‑91 (MQ=255) acacATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCAt > 1:1728308/1‑91 (MQ=255) cacagtgcttgcgatgatgcatacatgtgttggcgggttATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTa > 1:3718942‑M2/40‑91 (MQ=255) cacagtgcttgcgatgatgcatacatgtgttggcgggttATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTa > 1:1697485‑M2/40‑91 (MQ=255) caTGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAg < 1:4095747/91‑1 (MQ=255) caTGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAg > 1:1264803/1‑91 (MQ=255) caTGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAg > 1:987814/1‑91 (MQ=255) tGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGAt > 1:840605/1‑91 (MQ=255) tGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGAt < 1:1096157/91‑1 (MQ=255) tGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGAt < 1:3067141/91‑1 (MQ=255) tGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGAt < 1:1096158/91‑1 (MQ=255) tGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGAt > 1:2525511/1‑91 (MQ=255) tGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGAt < 1:2468372/91‑1 (MQ=255) tATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGAttt < 1:1904109/91‑1 (MQ=255) tGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTa > 1:2704917/1‑91 (MQ=255) gCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTaa < 1:1541128/91‑1 (MQ=255) tcatcGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAAc < 1:751050/91‑1 (MQ=255) catcGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACt > 1:59530/1‑91 (MQ=255) tcGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTAt < 1:246300/91‑1 (MQ=255) tcGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTAt < 1:1608389/91‑1 (MQ=255) cGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATc < 1:915425/91‑1 (MQ=255) cAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCaa < 1:2687667/91‑1 (MQ=255) aaGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCaaa > 1:584618/1‑91 (MQ=255) aaGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCaaa > 1:3783797/1‑91 (MQ=255) aaGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCaaa > 1:1006337/1‑91 (MQ=255) aGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCaaaa > 1:1461892/1‑91 (MQ=255) aGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCaaaa > 1:1633604/1‑91 (MQ=255) cTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCtt > 1:3549204/1‑91 (MQ=255) tgtgTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCttt > 1:1416852/1‑91 (MQ=255) tgtgTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCttt < 1:3997753/91‑1 (MQ=255) tgtTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTa > 1:2788111/1‑91 (MQ=255) tgtTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTa > 1:2836211/1‑91 (MQ=255) tgtTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTa > 1:814280/1‑91 (MQ=255) gtTTGACGGGTTATTTTGATAATTTATTGTTAGTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTAc < 1:3547310/91‑1 (MQ=255) gtTTGACGGGTTATTTTCATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACGATCAAAATCTTTTAc < 1:3545321/91‑1 (MQ=255) tttGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACa < 1:2335029/91‑1 (MQ=255) tttGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACa < 1:685155/91‑1 (MQ=255) aCGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaaaat < 1:1189920/91‑1 (MQ=255) aCGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaaaat < 1:1658761/91‑1 (MQ=255) aCGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaaaat < 1:1267926/91‑1 (MQ=255) cgggttATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaaaatt > 1:2512280‑M2/7‑91 (MQ=255) gggttATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaaaatta < 1:726435‑M2/86‑1 (MQ=255) ggttATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaaaattaa > 1:2822646‑M2/5‑91 (MQ=255) tATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaaaattaaaat > 1:997695‑M2/2‑91 (MQ=255) aTTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaaaattaaaatt > 1:591950/1‑91 (MQ=255) aTTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaaaattaaaatt > 1:1894590/1‑91 (MQ=255) | GTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAAC‑AAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATT > USA300TCH1516_ALE/1619563‑1619743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |