New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1645378 = | 118 (1.200) | 17 (0.190) | 8/148 | NT | 13.8% | coding (188/558 nt) | efp | Elongation factor P |
? | USA300TCH1516_ALE | 1645401 = | 103 (1.130) | coding (165/558 nt) | efp | Elongation factor P |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
ATTATCCATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAGGCTTTACATGTTG > USA300TCH1516_ALE/1645311‑1645490 | aTTATCCATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGct > 1:2987440/1‑91 (MQ=255) aTTATCCATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGct > 1:1149127/1‑91 (MQ=255) aTTATCCATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGct > 1:2093994/1‑91 (MQ=255) aTTATCCATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGct > 1:1338126/1‑91 (MQ=255) tATCCATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGctct > 1:82094/1‑91 (MQ=255) tATCCATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGctct > 1:82093/1‑91 (MQ=255) aTCCATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTa < 1:1269471/91‑1 (MQ=255) aTCCATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTa < 1:1269565/91‑1 (MQ=255) ccATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTaaa > 1:2555482/1‑91 (MQ=255) ccATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTaaa > 1:1739299/1‑91 (MQ=255) ccATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTaaa > 1:1738442/1‑91 (MQ=255) aTAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACg < 1:2195044/91‑1 (MQ=255) aTAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACg < 1:2196861/91‑1 (MQ=255) aCATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTtct > 1:1316989/1‑91 (MQ=255) aCATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTtct > 1:3934207/1‑91 (MQ=255) aCATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTtct > 1:1571193/1‑91 (MQ=255) cATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTtctc > 1:496755/1‑91 (MQ=255) cATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTtctc > 1:1026842/1‑91 (MQ=255) aTGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTctct > 1:3424355/1‑91 (MQ=255) tGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCtt > 1:493516/1‑91 (MQ=255) gATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTg > 1:951810/1‑91 (MQ=255) aaattacgtaatttaagaactggtgcaattcaagagaaaacgtttagagctggttcaactttttcaccagcTCTAAACGTTTTCTCTTGaa < 1:2175989‑M2/20‑1 (MQ=255) aaattacgtaatttaagaactggtgcaattcaagagaaaacgtttagaGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGaa > 1:2176508‑M1/49‑91 (MQ=255) aattacgtaatttaagaactggtgcaattcaagagaaaacgtttagagctggttcaactttttcaccagcTCTAAACGTTTTCTCTTGAAt < 1:1095054‑M2/21‑1 (MQ=255) aTCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAAtt > 1:2931842/1‑91 (MQ=255) aTCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTCCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAAtt > 1:3496975/1‑91 (MQ=255) aTCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGACTTACAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAAtt > 1:3496968/1‑91 (MQ=255) tcCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCa > 1:664684/1‑91 (MQ=255) ccGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCAc > 1:2358230/1‑91 (MQ=255) ccGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCAc < 1:977317/91‑1 (MQ=255) ccGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCAc < 1:1173293/91‑1 (MQ=255) gtaatttaagagctggtgcaattcaagagaaaacgtttagaGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCAcc > 1:598547‑M1/42‑91 (MQ=255) cGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCAcc < 1:4041954/91‑1 (MQ=255) tCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAg < 1:71040/91‑1 (MQ=255) cAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGt < 1:523816/91‑1 (MQ=255) aGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGtt < 1:1638590/91‑1 (MQ=255) gCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTc > 1:2430316/1‑91 (MQ=255) gCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTc < 1:145328/91‑1 (MQ=255) cATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCt > 1:1150138/1‑91 (MQ=255) cATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCt > 1:785817/1‑91 (MQ=255) atatAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCtt > 1:321062/1‑91 (MQ=255) atatAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCtt > 1:2217344/1‑91 (MQ=255) taAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTaaa < 1:749814/91‑1 (MQ=255) taAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTaaa > 1:1816760/1‑91 (MQ=255) ttGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGt < 1:1835369/91‑1 (MQ=255) ttGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGt < 1:1530877/91‑1 (MQ=255) gCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTaa > 1:596496/1‑91 (MQ=255) attcaagagaaaacgtttagaGCTGGTGAAAAAGTTGAACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAAtt < 1:1095054‑M1/70‑1 (MQ=255) aTGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAAtt > 1:4129422/1‑91 (MQ=255) cgacgaTTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTg > 1:1425837/1‑91 (MQ=255) cgacgaTTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTg < 1:1912597/91‑1 (MQ=255) gacgaTTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTga < 1:1197766/91‑1 (MQ=255) acgaTTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaa < 1:2728790/91‑1 (MQ=255) gaTTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaacg < 1:474074/91‑1 (MQ=255) gaTTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaacg < 1:3599399/91‑1 (MQ=255) gaTTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTAGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaacg < 1:3303315/91‑1 (MQ=255) aTTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaacga > 1:435789/1‑91 (MQ=255) aTTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaacga > 1:3421697/1‑91 (MQ=255) aTTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaacga > 1:3958195/1‑91 (MQ=255) ttttCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaacgaa > 1:941423/1‑91 (MQ=255) ttttCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaacgaa > 1:941194/1‑91 (MQ=255) ttttCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaacgaa > 1:2267943/1‑91 (MQ=255) ttttCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaacgaa > 1:2684300/1‑91 (MQ=255) tttCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaacgaac > 1:2859041/1‑91 (MQ=255) tttCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTgaacgaac < 1:1841891/91‑1 (MQ=255) ttCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGaacgaacg > 1:1021975/1‑91 (MQ=255) tCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAacgaacga < 1:954535/91‑1 (MQ=255) aTCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTGTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATg < 1:4152079/91‑1 (MQ=255) tCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGc < 1:669316/91‑1 (MQ=255) agagctggtgaaaaagttgaaccagcTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTg > 1:1391853‑M2/27‑91 (MQ=255) aTTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAATGAACGAATGCTg < 1:3172621/91‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTg < 1:928126/91‑1 (MQ=255) tGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGaa < 1:2940297/91‑1 (MQ=255) GCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAAc < 1:865688‑M1/91‑1 (MQ=255) TGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCt > 1:4010456‑M1/1‑91 (MQ=255) ggtgaaaaagttgaaccagcTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCtt > 1:3985982‑M2/21‑91 (MQ=255) GGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCtt > 1:1388478‑M1/1‑91 (MQ=255) GTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCttt > 1:446948‑M1/1‑91 (MQ=255) TTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTa > 1:200085‑M1/1‑91 (MQ=255) tCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTAc > 1:606142/1‑91 (MQ=255) tCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTAc > 1:606600/1‑91 (MQ=255) cAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTAcc < 1:4127207/91‑1 (MQ=255) cAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTAcc < 1:2347760/91‑1 (MQ=255) aaaaagttgaaccagcTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTAcc > 1:1807275‑M2/17‑91 (MQ=255) aaaaagttgaaccagcTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTAcc > 1:3799098‑M2/17‑91 (MQ=255) aaaaagttgaaccagcTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTAcc > 1:2416668‑M2/17‑91 (MQ=255) aaaagttgaaccagcTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCa > 1:2829499‑M2/16‑91 (MQ=255) aaaagttgaaccagcTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCa > 1:2829603‑M2/16‑91 (MQ=255) aaCTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCa < 1:3205224/91‑1 (MQ=255) aCTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAg > 1:2500373/1‑91 (MQ=255) aCTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAg < 1:3560801/91‑1 (MQ=255) cTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAgg < 1:2842056/91‑1 (MQ=255) tttttCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAGGc > 1:3697099/1‑91 (MQ=255) tCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAGGCTTTa > 1:565170/1‑91 (MQ=255) tCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAGGCTTTa > 1:3065377/1‑91 (MQ=255) cACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAGGCTTTAc < 1:488888/91‑1 (MQ=255) cACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAGGCTTTAc < 1:4055791/91‑1 (MQ=255) cagcTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAGGCTTTACATg > 1:3792758‑M2/5‑91 (MQ=255) cagcTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAGGCTTTACATg < 1:2533353‑M2/87‑1 (MQ=255) cTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAGGCTTTACATGTTg > 1:3060085‑M2/2‑91 (MQ=255) | ATTATCCATAAATACATGATTATCTCCGTCAGCATATAAATATTGCATGCGACGATTTTCAATCATTGCTGGTTCAACTTTTTCACCAGCTCTAAACGTTTTCTCTTGAATTGCACCAGTTCTTAAATTACGTAATTTTGAACGAACGAATGCTGAACCTTTACCAGGCTTTACATGTTG > USA300TCH1516_ALE/1645311‑1645490 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |