New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1710808 = | 104 (1.060) | 9 (0.100) | 8/144 | NT | 8.9% | coding (336/1221 nt) | fic | Adenosine monophosphate‑protein transferase SoFic |
? | USA300TCH1516_ALE | 1710841 = | 91 (1.030) | coding (303/1221 nt) | fic | Adenosine monophosphate‑protein transferase SoFic |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TCTGAACTTAAGAAATTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCAATTTTTCTACTATTA > USA300TCH1516_ALE/1710751‑1710931 | tctGAACTTAAGAAATTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACtt < 1:1651457/91‑1 (MQ=255) tctGAACTTAAGAAATTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACtt < 1:1503285/91‑1 (MQ=255) taccatatgcagctagagaacaatattttaatgatttattaatcgatgaattacaaAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACttt > 1:2958039‑M1/57‑91 (MQ=255) ctGAACTTAAGAAATTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACttt < 1:245026/91‑1 (MQ=255) ctGAACTTAAGAAATTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACttt > 1:664242/1‑91 (MQ=255) ctGAACTTAAGAAATTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACttt > 1:664321/1‑91 (MQ=255) accatatgcagctagagaacaatattttaatgatttattaatcgatgaattacaaAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTg > 1:3488249‑M1/56‑91 (MQ=255) catatgcagctagagaacaatattttaatgatttattaatcgatgaattacaaAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTa > 1:3113295‑M1/54‑91 (MQ=255) aCTTAAGAAATTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTaa < 1:3001314/91‑1 (MQ=255) aaGAAATTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCa < 1:1060212/91‑1 (MQ=255) gAAATTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATc < 1:1026209/91‑1 (MQ=255) aaaTTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCg < 1:425298/91‑1 (MQ=255) aTTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGAt < 1:987412/91‑1 (MQ=255) aTTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGAt < 1:1567181/91‑1 (MQ=255) aTTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGAt < 1:357154/91‑1 (MQ=255) aTTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGAt < 1:357137/91‑1 (MQ=255) ttCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGAtt < 1:110843/91‑1 (MQ=255) tCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATta > 1:1019201/1‑91 (MQ=255) tCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATta > 1:2669737/1‑91 (MQ=255) gATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATtaata > 1:2256766/1‑91 (MQ=255) gATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATtaata > 1:2480201/1‑91 (MQ=255) gATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGT‑ATTCATCGATtaataa < 1:1292461/91‑1 (MQ=255) acaatattttaatgatttattaatccatgaattacaaAGTACTAAATACATTTCCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATtaataa > 1:3866679‑M1/38‑91 (MQ=255) tGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATaaa > 1:1290127/1‑91 (MQ=255) tGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATaaa > 1:2647618/1‑91 (MQ=255) tGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCAt < 1:1509569/91‑1 (MQ=255) tGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCAt < 1:4046412/91‑1 (MQ=255) ggTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCAtt < 1:952729/91‑1 (MQ=255) ggTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCAtt < 1:952771/91‑1 (MQ=255) ggTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCAtt < 1:4127013/91‑1 (MQ=255) gTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTa < 1:866202/91‑1 (MQ=255) gTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTa > 1:535157/1‑91 (MQ=255) ttATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTaa < 1:2239339/91‑1 (MQ=255) ttATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTaa < 1:3249672/91‑1 (MQ=255) tATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTaaa > 1:503613/1‑91 (MQ=255) tttAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAat < 1:2243159/91‑1 (MQ=255) tttAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAat > 1:539602/1‑91 (MQ=255) tttAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAat > 1:2664126/1‑91 (MQ=255) tttAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAat < 1:3050784/91‑1 (MQ=255) tttAACGCATGCGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAat < 1:3756359/91‑1 (MQ=255) tAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAatat < 1:2874956/91‑1 (MQ=255) tAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAatat > 1:3011879/1‑91 (MQ=255) aaCGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATAtt < 1:582060/91‑1 (MQ=255) aaCGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATAtt < 1:1968241/91‑1 (MQ=255) cGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCAATAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGt > 1:3301227/1‑91 (MQ=255) cATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTtc < 1:3632844/91‑1 (MQ=255) cATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTtc < 1:3632157/91‑1 (MQ=255) cATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTtc > 1:879879/1‑91 (MQ=255) cATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTtc < 1:1010901/91‑1 (MQ=255) tgtgCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTtctc > 1:1411109/1‑91 (MQ=255) gtgCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTctct < 1:2221991/91‑1 (MQ=255) tgCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTa > 1:60909/1‑91 (MQ=255) tgCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTa > 1:752014/1‑91 (MQ=255) cAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTCCTCTAGc > 1:2073678/1‑91 (MQ=255) aTCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTg > 1:3186272/1‑91 (MQ=255) ctctTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCa < 1:2621806/91‑1 (MQ=255) tctTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCat < 1:1114563/91‑1 (MQ=255) ctTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCata > 1:1545139/1‑91 (MQ=255) ctTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGCTCTCTAGCTGtata > 1:3739126/1‑91 (MQ=255) ctTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGCTCTCTAGCTGCata > 1:3739008/1‑91 (MQ=255) tacaaagtactaatgaaattgaaaatgtatttagtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATg > 1:3113295‑M2/39‑91 (MQ=255) tacaaagtactaatgaaattgaaaatgtatttagtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATg > 1:1055011‑M2/39‑91 (MQ=255) tGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACCTTGTAATTCATCGCTTAATAAATCATTCAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATg > 1:3855839/1‑91 (MQ=255) gTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATgg > 1:3553252/1‑91 (MQ=255) caaagtactaatgaaattgaaaatgtatttagtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGt > 1:3488249‑M2/37‑91 (MQ=255) ttAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTa > 1:3974228/1‑91 (MQ=255) ttAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTa < 1:307048/91‑1 (MQ=255) ttAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTa < 1:3146411/91‑1 (MQ=255) ttAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTa < 1:307077/91‑1 (MQ=255) tAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTaa > 1:1017498/1‑91 (MQ=255) aagtactaatgaaattgaaaatgtatttagtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTaa > 1:3702591‑M2/35‑91 (MQ=255) agtactaatgaaattgaaaatgtatttagtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTaaa > 1:84097‑M2/34‑91 (MQ=255) AGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTaaa < 1:2469747‑M1/91‑1 (MQ=255) GTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAg > 1:1083909‑M1/1‑91 (MQ=255) GTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAg > 1:571701‑M1/1‑91 (MQ=255) ACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGaa < 1:3609321‑M1/91‑1 (MQ=255) ACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGaa > 1:687963‑M1/1‑91 (MQ=255) ctaatgaaattgaaaatgtatttagtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAAt > 1:3016210‑M2/30‑91 (MQ=255) AAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTa < 1:4071273‑M1/91‑1 (MQ=255) atgaaattgaaaatgtatttagtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTaa > 1:843286‑M2/27‑91 (MQ=255) cATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGc > 1:1347309/1‑91 (MQ=255) cATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGc > 1:1347640/1‑91 (MQ=255) ttttCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGctc > 1:1837010/1‑91 (MQ=255) tttCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATCAAGTGctct > 1:3967830/1‑91 (MQ=255) tttCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATCAAGTGctct > 1:3967864/1‑91 (MQ=255) tCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTAt > 1:1953000/1‑91 (MQ=255) cAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATc > 1:1972824/1‑91 (MQ=255) aaTTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCa < 1:3386368/91‑1 (MQ=255) aaTTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCa < 1:1249045/91‑1 (MQ=255) aaTTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCa > 1:1995988/1‑91 (MQ=255) aTTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCaa > 1:86317/1‑91 (MQ=255) aTTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCaa < 1:1120812/91‑1 (MQ=255) tttCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCAAt > 1:2408106/1‑91 (MQ=255) aTTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCAAttttt > 1:2235887/1‑91 (MQ=255) tagtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCAATTTTTct > 1:2785530‑M2/8‑91 (MQ=255) tagtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCAATTTTTct < 1:2186253‑M2/84‑1 (MQ=255) tagtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCAATTTTTct < 1:48391‑M2/84‑1 (MQ=255) tagtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCAATTTTTct < 1:48132‑M2/84‑1 (MQ=255) agtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCAATTTTTcta > 1:2591800‑M2/7‑91 (MQ=255) agtactTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCAATTTTTcta > 1:2590333‑M2/7‑91 (MQ=255) | TCTGAACTTAAGAAATTCTGATGCTTGGTTATTTAACGCATGTGCAATCTCTTGTTTAGTACTAAATACATTTTCAATTTCATTAGTACTTTGTAATTCATCGATTAATAAATCATTAAAATATTGTTCTCTAGCTGCATATGGTAAAGAATTAAGTGCTCTATCAATTTTTCTACTATTA > USA300TCH1516_ALE/1710751‑1710931 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |