New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1766678 = | 73 (0.740) | 8 (0.090) | 5/140 | NT | 12.2% | intergenic (+22/+201) | tag/USA300HOU_RS08820 | DNA‑3‑methyladenine glycosylase 1/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 1766721 = | 51 (0.590) | intergenic (+65/+158) | tag/USA300HOU_RS08820 | DNA‑3‑methyladenine glycosylase 1/hypothetical protein |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TCCATCAAAGCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAATCTAAAAATAGATGTAC > USA300TCH1516_ALE/1766632‑1766810 | tCCATCAAAGCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGttttt > 1:12776/1‑91 (MQ=255) ccATCAAAGCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGtttttt > 1:1040516/1‑91 (MQ=255) ccATCAAAGCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGtttttt < 1:1223026/91‑1 (MQ=255) cATCAAAGCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTa > 1:1091336/1‑91 (MQ=255) cATCAAAGCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTa < 1:3167120/91‑1 (MQ=255) cATCAAAGCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTa < 1:3167183/91‑1 (MQ=255) cATCAAAGCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTa < 1:3167450/91‑1 (MQ=255) aTCAAAGCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTaa < 1:3924578/91‑1 (MQ=255) aTCAAAGCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTaa < 1:3924196/91‑1 (MQ=255) cAAAGCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAAtg < 1:3620038/91‑1 (MQ=255) aaaGCCTAAACACAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAAtgt < 1:409370/91‑1 (MQ=255) aactttaacttatgatttgaataaattttcacattaaaAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGa > 1:3750040‑M1/39‑91 (MQ=255) gCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGaa > 1:2486292/1‑91 (MQ=255) cTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGaaaa > 1:721066/1‑91 (MQ=255) tAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAAt < 1:688924/91‑1 (MQ=255) tAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAAt > 1:209582/1‑91 (MQ=255) tAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAAt > 1:3514311/1‑91 (MQ=255) ttaattTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCaaa < 1:3061837/91‑1 (MQ=255) taattTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAAt > 1:2908589/1‑91 (MQ=255) attTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCa < 1:4046319/91‑1 (MQ=255) attTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCATTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCa > 1:3324783/1‑91 (MQ=255) tttGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCAt > 1:2664983/1‑91 (MQ=255) tttGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCAt > 1:2663783/1‑91 (MQ=255) ttGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATGATCTATTTTTAAGTAATAGACGGTCGCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATa < 1:3315016/91‑1 (MQ=255) gCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAg > 1:2449841/1‑91 (MQ=255) gCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAg > 1:1181470/1‑91 (MQ=255) cTATAGCATCATTAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGt > 1:3198336/1‑91 (MQ=255) tcacattaaaaaacgagacagtctattagttaaaaatagatgatgtctcgtttTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGtt > 1:3750040‑M2/54‑91 (MQ=255) atcatAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGtt < 1:1386859/91‑1 (MQ=255) tcatAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTc > 1:2496953/1‑91 (MQ=255) tAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCaa > 1:3181095/1‑91 (MQ=255) tAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCaa < 1:2302798/91‑1 (MQ=255) tAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCaa > 1:2012073/1‑91 (MQ=255) tAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCaa < 1:1971106/91‑1 (MQ=255) aaaGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAg < 1:2725616/91‑1 (MQ=255) aaGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGt < 1:1669870/91‑1 (MQ=255) aaGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGt < 1:1667782/91‑1 (MQ=255) aGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGtt < 1:3570827/91‑1 (MQ=255) aGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGtt < 1:3570686/91‑1 (MQ=255) aGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGtt > 1:775132/1‑91 (MQ=255) gTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTa > 1:1411071/1‑91 (MQ=255) AAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAAt < 1:2658882‑M1/91‑1 (MQ=255) AACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATg < 1:1310298‑M1/91‑1 (MQ=255) AACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATg < 1:1310334‑M1/91‑1 (MQ=255) AACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATg < 1:2662497‑M1/91‑1 (MQ=255) ACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGc < 1:761115‑M1/91‑1 (MQ=255) cgagacagtctattagttaaaaatagatgatgtctcgtttTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGct > 1:1215230‑M2/41‑91 (MQ=255) CGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGct > 1:2207745‑M1/1‑91 (MQ=255) CGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGct > 1:3375078‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGctc < 1:1125733‑M1/91‑1 (MQ=255) agacagtctattagttaaaaatagatgatgtctcgtttTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGctct > 1:4060439‑M2/39‑91 (MQ=255) AGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGctct < 1:2905508‑M1/91‑1 (MQ=255) AGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGctct < 1:2905678‑M1/91‑1 (MQ=255) AGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGctct < 1:1541793‑M1/91‑1 (MQ=255) AGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGctct > 1:885760‑M1/1‑91 (MQ=255) AGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGctct < 1:63963‑M1/91‑1 (MQ=255) AGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGctct > 1:357056‑M1/1‑91 (MQ=255) acagtctattagttaaaaatagatgatgtctcgtttTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGc > 1:1620780‑M2/37‑91 (MQ=255) acagtctattagttaaaaatagatgatgtctcgtttTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGc > 1:1620737‑M2/37‑91 (MQ=255) ACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGc < 1:1059213‑M1/91‑1 (MQ=255) ACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGc > 1:728914‑M1/1‑91 (MQ=255) CATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCt < 1:805204‑M1/91‑1 (MQ=255) CATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCt < 1:805173‑M1/91‑1 (MQ=255) CATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCt < 1:3691429‑M1/91‑1 (MQ=255) CATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCt > 1:730712‑M1/1‑91 (MQ=255) CATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCt > 1:951052‑M1/1‑91 (MQ=255) CATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCt > 1:3520264‑M1/1‑91 (MQ=255) CATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCt > 1:1660240‑M1/1‑91 (MQ=255) CATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCt > 1:2095877‑M1/1‑91 (MQ=255) CATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCt > 1:2561691‑M1/1‑91 (MQ=255) CATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCt > 1:2765076‑M1/1‑91 (MQ=255) agtctattagttaaaaatagatgatgtctcgtttTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTa > 1:3130860‑M2/35‑91 (MQ=255) agtctattagttaaaaatagatgatgtctcgtttTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTa > 1:3130803‑M2/35‑91 (MQ=255) catcTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAat > 1:1622440/1‑91 (MQ=255) catcTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAat > 1:198338/1‑91 (MQ=255) catcTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAat > 1:2109037/1‑91 (MQ=255) atcTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAata < 1:2172339/91‑1 (MQ=255) tATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTa < 1:1643874/91‑1 (MQ=255) tATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTa < 1:1736006/91‑1 (MQ=255) aTTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAg < 1:3896478/91‑1 (MQ=255) aTTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAg < 1:3896183/91‑1 (MQ=255) tttttAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGa < 1:1463991/91‑1 (MQ=255) tAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATc > 1:3935772/1‑91 (MQ=255) aaCTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAACATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCt < 1:3542530/91‑1 (MQ=255) aaCTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCt < 1:3469540/91‑1 (MQ=255) aaCTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTCAATGCTCTGCTAATATTAGATATCt > 1:3851008/1‑91 (MQ=255) cTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTa < 1:1045846/91‑1 (MQ=255) cTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTa < 1:1045871/91‑1 (MQ=255) cTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTa < 1:2752591/91‑1 (MQ=255) aaTAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAAt > 1:73743/1‑91 (MQ=255) aCTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAATCTaaa > 1:2872067/1‑91 (MQ=255) aCTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAATCTaaa < 1:829788/91‑1 (MQ=255) aCTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAATCTaaa > 1:3970255/1‑91 (MQ=255) aCTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAATCTaaa > 1:902202/1‑91 (MQ=255) cTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAATCTaaaa < 1:3129937/91‑1 (MQ=255) cTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAATCTaaaa < 1:3130008/91‑1 (MQ=255) tctcgtttTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAATCTAAAAATa > 1:2818652‑M2/9‑91 (MQ=255) ttTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAATCTAAAAATAGATGTa < 1:609493‑M2/89‑1 (MQ=255) ttTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAATCTAAAAATAGATGTa < 1:1296834‑M2/89‑1 (MQ=255) tTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAATCTAAAAATAGATGTAc < 1:695185‑M2/90‑1 (MQ=255) | TCCATCAAAGCCTAAACATAATTAATTTGCTATAGCATCATAAAGTAAACGAGACATCATCTATTTTTAACTAATAGACTGTCTCGTTTTTTAATGTGAAAATTTATTCAAATCATAAGTTAAAGTTCCAAGTTAATGCTCTGCTAATATTAGATATCTTAATCTAAAAATAGATGTAC > USA300TCH1516_ALE/1766632‑1766810 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |