New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1841984 = | 61 (0.620) | 8 (0.100) | 6/134 | NT | 12.6% | intergenic (+24/+70) | htrA/tyrS | Serine protease Do‑like HtrA/Tyrosine‑‑tRNA ligase |
? | USA300TCH1516_ALE | 1842029 = | 60 (0.730) | intergenic (+69/+25) | htrA/tyrS | Serine protease Do‑like HtrA/Tyrosine‑‑tRNA ligase |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCATCAAT > USA300TCH1516_ALE/1841940‑1842119 | gATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTaa < 1:3664839/91‑1 (MQ=255) gATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTaa < 1:3663063/91‑1 (MQ=255) agagATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAattt > 1:2145555/1‑91 (MQ=255) gagaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAattta < 1:3873385/91‑1 (MQ=255) agaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttat > 1:932918/1‑91 (MQ=255) agaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttat < 1:509406/91‑1 (MQ=255) agaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttat < 1:1494488/91‑1 (MQ=255) gaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttatt < 1:102881/91‑1 (MQ=255) gaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttatt > 1:1597521/1‑91 (MQ=255) gaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttatt < 1:168578/91‑1 (MQ=255) gaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttatt < 1:168764/91‑1 (MQ=255) tCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGc > 1:2011997/1‑91 (MQ=255) tttAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTa < 1:712799/91‑1 (MQ=255) tAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATg > 1:2907843/1‑91 (MQ=255) aGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGc < 1:3014296/91‑1 (MQ=255) gATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCa > 1:1360666/1‑91 (MQ=255) aaTTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAtt < 1:2057640/91‑1 (MQ=255) aaTTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAtt < 1:2057478/91‑1 (MQ=255) aaTTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAtt < 1:989164/91‑1 (MQ=255) aaTTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAtt < 1:1577230/91‑1 (MQ=255) aaTTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAtt < 1:1576919/91‑1 (MQ=255) tACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTatat > 1:975986/1‑91 (MQ=255) tACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTatat > 1:641665/1‑91 (MQ=255) acagacagAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtatt > 1:1608059/1‑91 (MQ=255) agacagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtattta > 1:3259800/1‑91 (MQ=255) agacagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtattta > 1:3126516/1‑91 (MQ=255) agacagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtattta > 1:1390647/1‑91 (MQ=255) agacagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtattta < 1:1928760/91‑1 (MQ=255) gacagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtatttat < 1:3898800/91‑1 (MQ=255) acagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtatttatt > 1:2504840/1‑91 (MQ=255) aaaaGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATa > 1:3243296/1‑91 (MQ=255) aaaGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAg < 1:2472157/91‑1 (MQ=255) aaGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGt > 1:3421665/1‑91 (MQ=255) aGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGtt > 1:1512877/1‑91 (MQ=255) gTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTa > 1:2816241/1‑91 (MQ=255) tACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTaa > 1:3712715/1‑91 (MQ=255) cATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAcc > 1:2792712/1‑91 (MQ=255) cATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAcc > 1:708847/1‑91 (MQ=255) cATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAcc > 1:707370/1‑91 (MQ=255) cATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAcc > 1:2721031/1‑91 (MQ=255) ttAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCAt < 1:1039443/91‑1 (MQ=255) ttAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCAt > 1:972826/1‑91 (MQ=255) ttAAGAGCCTACGCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAATCAt > 1:3206613/1‑91 (MQ=255) ttAAGAGCCTACGCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAGCAt > 1:3206649/1‑91 (MQ=255) GAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAg > 1:3563758‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAg > 1:3911569‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAg > 1:3911413‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGt < 1:129146‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGt > 1:506969‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGt > 1:506845‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAt < 1:3926725‑M1/91‑1 (MQ=255) CTACTCATATTCATTCCTAAGAATGTA‑ATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtt < 1:1687775‑M1/91‑1 (MQ=255) CTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtt < 1:3347931‑M1/91‑1 (MQ=255) ACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttt < 1:1372573‑M1/91‑1 (MQ=255) ACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttt < 1:1372845‑M1/91‑1 (MQ=255) ACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttt < 1:3752114‑M1/91‑1 (MQ=255) ACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttt > 1:1100726‑M1/1‑91 (MQ=255) TCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttttt < 1:3391373‑M1/91‑1 (MQ=255) TCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttttt < 1:3684857‑M1/91‑1 (MQ=255) TCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttttt < 1:1492907‑M1/91‑1 (MQ=255) CAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTc < 1:1922050‑M1/91‑1 (MQ=255) CAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTc > 1:1344068‑M1/1‑91 (MQ=255) CAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTc < 1:1922115‑M1/91‑1 (MQ=255) CAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTc < 1:1922726‑M1/91‑1 (MQ=255) CAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTc > 1:944542‑M1/1‑91 (MQ=255) AT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCt > 1:80417‑M1/1‑91 (MQ=255) atattcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCt > 1:705999‑M2/35‑91 (MQ=255) atattcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCt > 1:1919270‑M2/35‑91 (MQ=255) tattcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTCATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCtt > 1:3500892‑M2/34‑91 (MQ=255) tACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAttttttaagt > 1:1384046/1‑87 (MQ=255) tACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTa > 1:3399042/1‑91 (MQ=255) tACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTa < 1:2994934/91‑1 (MQ=255) tACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTa > 1:4091148/1‑91 (MQ=255) attcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAGCCATGAAGCATTTTTTCTTa > 1:3758050‑M2/33‑91 (MQ=255) attcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTa > 1:3059851‑M2/33‑91 (MQ=255) ttcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTAc > 1:1418068‑M2/32‑91 (MQ=255) aCATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTAc > 1:2580294/1‑91 (MQ=255) aTTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACcg > 1:680202/1‑91 (MQ=255) ttCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACcgc < 1:2201919/91‑1 (MQ=255) cTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGcga < 1:2200524/91‑1 (MQ=255) cTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGcga < 1:2200627/91‑1 (MQ=255) ttAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGcgac > 1:3717679/1‑91 (MQ=255) aGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGcgacga > 1:1413075/1‑91 (MQ=255) aatgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGaata > 1:1489399/1‑91 (MQ=255) aatgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGaata > 1:2827281/1‑91 (MQ=255) atgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGaataa > 1:519754/1‑91 (MQ=255) atgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGaataa < 1:2456176/91‑1 (MQ=255) aatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCg > 1:1583818/1‑91 (MQ=255) aatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCg < 1:3623686/91‑1 (MQ=255) tgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTaaa > 1:2518189‑M2/13‑91 (MQ=255) tgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTaaa > 1:2200611‑M2/13‑91 (MQ=255) aggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGc > 1:525098‑M2/8‑91 (MQ=255) ggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGcc > 1:2758963‑M2/7‑91 (MQ=255) ggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGcc < 1:114457‑M2/85‑1 (MQ=255) gctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCa < 1:1863423‑M2/86‑1 (MQ=255) gctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCa > 1:373407‑M2/6‑91 (MQ=255) ctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCAt > 1:2962301‑M2/5‑91 (MQ=255) ctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCAt > 1:2962559‑M2/5‑91 (MQ=255) aaTTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCATCAAt < 1:2822942/91‑1 (MQ=255) aaTTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCATCAAt > 1:3896688/1‑91 (MQ=255) | GATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCATCAAT > USA300TCH1516_ALE/1841940‑1842119 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |