New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1841996 | 64 (0.650) | 12 (0.150) | 7/134 | NT | 17.4% | intergenic (+36/+58) | htrA/tyrS | Serine protease Do‑like HtrA/Tyrosine‑‑tRNA ligase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1842015 | 60 (0.730) | intergenic (+55/+39) | htrA/tyrS | Serine protease Do‑like HtrA/Tyrosine‑‑tRNA ligase |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
TCACCTGGCCAAGGCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGT > USA300TCH1516_ALE/1841925‑1842104 | taagaaaaaatgcttcatggctaactatcaataaatataattgcatagctaaataaattAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGgaatgaat > 1:3758050‑M1/60‑91 (MQ=255) tCACCTGGCCAAGGCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGgaatgaat > 1:2570952/1‑91 (MQ=255) tCACCTGGCCAAGGCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGgaatgaat < 1:861736/91‑1 (MQ=255) gccttggccA‑GGTGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATat < 1:2845606‑M2/87‑3 (MQ=255) gccttggccA‑GGTGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATat < 1:2845583‑M2/87‑3 (MQ=255) cACCTGGCCAAGGCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATa < 1:2845010‑M2/91‑2 (MQ=255) cACCTGGCCAAGGCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATa < 1:736717‑M2/91‑2 (MQ=255) aagaaaaaatacttcatggttaactatcaataaatataattgcatagctaaatgaattAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAata > 1:3500892‑M1/59‑91 (MQ=255) agaaaaaatacttcatggttaactatcaataaatataattgcatagctaaataaattAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAatat > 1:705999‑M1/58‑91 (MQ=255) agaaaaaatacttcatggttaactatcaataaatataattgcatagctaaataaattAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAatat > 1:1919270‑M1/58‑91 (MQ=255) aCCTGGCCAAGGCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATat > 1:221677‑M2/1‑89 (MQ=255) aCCTGGCCAAGGCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATat > 1:897918‑M2/1‑89 (MQ=255) ccTGGCCAAGGCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATatg > 1:2309187‑M2/1‑88 (MQ=255) ccTGGCCAAGGCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATatg < 1:180207‑M2/91‑4 (MQ=255) cTGGCCAAGGCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATatga < 1:2238410‑M2/91‑5 (MQ=255) ggCCAAGGCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATatgagt > 1:1054368‑M2/1‑85 (MQ=255) ggCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATatgagtaggctc > 1:3632174‑M2/1‑79 (MQ=255) ggCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATatgagtaggctc < 1:3084760‑M2/91‑13 (MQ=255) ggCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATatgagtaggctc > 1:3632016‑M2/1‑79 (MQ=255) ggCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATatgagtaggctc < 1:1514211‑M2/91‑13 (MQ=255) gCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATatgagtaggctct < 1:3059804‑M2/91‑14 (MQ=255) gCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATatgagtaggctct < 1:3059564‑M2/91‑14 (MQ=255) gCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATaagagtaggctct < 1:144134‑M2/91‑14 (MQ=255) gATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTaa < 1:3663118/91‑1 (MQ=255) gATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTaa < 1:3664839/91‑1 (MQ=255) agagATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAattt > 1:2145555/1‑91 (MQ=255) gagaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAattta < 1:3873385/91‑1 (MQ=255) agaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttat > 1:932918/1‑91 (MQ=255) agaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttat < 1:1494488/91‑1 (MQ=255) agaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttat < 1:509406/91‑1 (MQ=255) gaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttatt < 1:102881/91‑1 (MQ=255) gaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttatt > 1:1597521/1‑91 (MQ=255) gaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttatt < 1:756899/91‑1 (MQ=255) gaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttatt < 1:168764/91‑1 (MQ=255) gaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttatt < 1:168578/91‑1 (MQ=255) tCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGc > 1:2011997/1‑91 (MQ=255) tttAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTa < 1:712799/91‑1 (MQ=255) tAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATg > 1:2907843/1‑91 (MQ=255) aGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGc < 1:3014296/91‑1 (MQ=255) gATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCa > 1:1360666/1‑91 (MQ=255) aaTTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAtt < 1:989164/91‑1 (MQ=255) aaTTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAtt < 1:1577230/91‑1 (MQ=255) aaTTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAtt < 1:1576919/91‑1 (MQ=255) aaTTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAtt < 1:2057478/91‑1 (MQ=255) aaTTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAtt < 1:2057640/91‑1 (MQ=255) tACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTatat > 1:975986/1‑91 (MQ=255) tACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTatat > 1:641665/1‑91 (MQ=255) agacagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtattta > 1:3126516/1‑91 (MQ=255) agacagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtattta > 1:1390647/1‑91 (MQ=255) agacagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtattta < 1:1928760/91‑1 (MQ=255) gacagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtatttat < 1:3898800/91‑1 (MQ=255) acagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtatttatt > 1:2504840/1‑91 (MQ=255) cagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTg > 1:2641499/1‑91 (MQ=255) aaaaGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATa > 1:3243296/1‑91 (MQ=255) aaGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGt > 1:3421665/1‑91 (MQ=255) aGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGtt > 1:1512877/1‑91 (MQ=255) gTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTa > 1:2816241/1‑91 (MQ=255) tACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTaa > 1:3712715/1‑91 (MQ=255) cATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAcc > 1:2792712/1‑91 (MQ=255) cATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAcc > 1:708847/1‑91 (MQ=255) ttAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCAt < 1:1039443/91‑1 (MQ=255) ttAAGAGCCTACGCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAATCAt > 1:3206613/1‑91 (MQ=255) ttAAGAGCCTACGCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAGCAt > 1:3206649/1‑91 (MQ=255) GAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAg > 1:3911569‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAg > 1:3911413‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGt < 1:129146‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGt > 1:506845‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTACGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGt < 1:3396645‑M1/91‑1 (MQ=255) CTACTCATATTCATTCCTAAGAATGTA‑ATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtt < 1:1687775‑M1/91‑1 (MQ=255) CTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtt < 1:3347931‑M1/91‑1 (MQ=255) ACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttt < 1:1372573‑M1/91‑1 (MQ=255) ACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttt < 1:1372845‑M1/91‑1 (MQ=255) ACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttt < 1:3752114‑M1/91‑1 (MQ=255) TCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttttt < 1:3391373‑M1/91‑1 (MQ=255) CAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTc < 1:1922726‑M1/91‑1 (MQ=255) CAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTc > 1:1344068‑M1/1‑91 (MQ=255) CAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTc > 1:944542‑M1/1‑91 (MQ=255) CAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTc < 1:1922115‑M1/91‑1 (MQ=255) aT‑TACATTCTTAGGAATGAATatgagtaggctcttaatgtacttttctgtctgtaaattatctaaagaaatctctatcgccttggccaggt < 1:2037411‑M2/91‑71 (MQ=255) aT‑TACATTCTTAGGAATGAATatgagtaggctcttaatgtacttttctgtctgtaaattatctaaagaaatctctatcgccttggccaggt < 1:1598754‑M2/91‑71 (MQ=255) AT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCt > 1:80417‑M1/1‑91 (MQ=255) AT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCt > 1:2052028‑M1/1‑91 (MQ=255) t‑tACATTCTTAGGAATGAATatgagtaggctcttaatgtacttttctgtctgtaaattatctaaagaaatctctatcgccttggccaggtg < 1:253513‑M2/91‑72 (MQ=255) tACATTCTTAGGAATGAATatgagtaggctcttaatgtacttttctgtctgtaaattatctaaagaaatctctatcgccttggccaggtga < 1:1466131‑M2/91‑73 (MQ=255) tACATTCTTAGGAATGAATatgagtaggctctaatgtacttttctgtctgtaaattatctaaagaaatctctatcgccttggccaggtgat < 1:829814‑M2/91‑73 (MQ=255) tACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTa > 1:4091148/1‑91 (MQ=255) tACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTa < 1:2994934/91‑1 (MQ=255) aCATTCTTAGGCATGAATatgagtaggctcttaatgtacttttctgtctgtaaattatctaaagaaatctctatcgccttggccaggtgat < 1:2385433‑M2/91‑74 (MQ=255) aCATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTAc > 1:2580294/1‑91 (MQ=255) aTTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACcg > 1:680202/1‑91 (MQ=255) ttCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACcgc < 1:2201919/91‑1 (MQ=255) cTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGcga < 1:2200524/91‑1 (MQ=255) ttAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGcgac > 1:3717679/1‑91 (MQ=255) aGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGcgacga > 1:1413075/1‑91 (MQ=255) aatgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGaata > 1:1489399/1‑91 (MQ=255) atgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGaataa < 1:2456176/91‑1 (MQ=255) atgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGaataa > 1:519754/1‑91 (MQ=255) atgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGaataa > 1:398014/1‑91 (MQ=255) aatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCg > 1:1583818/1‑91 (MQ=255) aatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCg < 1:3623686/91‑1 (MQ=255) | TCACCTGGCCAAGGCGATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCAT‑TACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGT > USA300TCH1516_ALE/1841925‑1842104 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |