New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1876716 | 98 (1.000) | 6 (0.070) | 4/148 | NT | 6.0% | coding (151/1662 nt) | murJ_2 | Lipid II flippase MurJ |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1876739 | 98 (1.080) | coding (128/1662 nt) | murJ_2 | Lipid II flippase MurJ |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TTCGCAACATATTTCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTAATGGTAATTA > USA300TCH1516_ALE/1876649‑1876829 | ttCGCAACATATTTCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGgcg < 1:2391758/91‑1 (MQ=255) tCGCAACATATTTCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGc < 1:1633722‑M2/91‑2 (MQ=255) cGCAACATATTTCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGcc < 1:2877114‑M2/91‑3 (MQ=255) gCAACATATTTGGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGcca > 1:3766967‑M2/1‑88 (MQ=255) gCAACATATTTCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGcca < 1:2580248‑M2/91‑4 (MQ=255) gCAACATATTTCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGcca > 1:3719015‑M2/1‑88 (MQ=255) gCAACATATTTCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGcca > 1:436201‑M2/1‑88 (MQ=255) gCAACATATTTAGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGcca > 1:3765795‑M2/1‑88 (MQ=255) atatTTCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATAttt > 1:1604819/1‑91 (MQ=255) atTTCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTc < 1:918003/91‑1 (MQ=255) ttCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCtt > 1:1085138/1‑91 (MQ=255) ttCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCtt > 1:1085120/1‑91 (MQ=255) tCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACCGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTg > 1:3881870/1‑91 (MQ=255) cGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGt < 1:1297253/91‑1 (MQ=255) aaGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTcc < 1:2876236/91‑1 (MQ=255) aGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTcca < 1:474765/91‑1 (MQ=255) aGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTcca < 1:474764/91‑1 (MQ=255) aGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTcca > 1:883430/1‑91 (MQ=255) ctgctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTccacc < 1:1997464/91‑1 (MQ=255) ctgctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTccacc < 1:201338/91‑1 (MQ=255) ctgctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTccacc < 1:725037/91‑1 (MQ=255) ctgctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTccacc < 1:724762/91‑1 (MQ=255) tgctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTccacca < 1:1357613/91‑1 (MQ=255) tgctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTccacca < 1:1357576/91‑1 (MQ=255) tgctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTccacca < 1:1357445/91‑1 (MQ=255) tgctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTccacca > 1:1356937/1‑91 (MQ=255) tgctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTccacca < 1:1357664/91‑1 (MQ=255) gctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCaa > 1:2774080/1‑91 (MQ=255) gctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCaa > 1:2012038/1‑91 (MQ=255) gctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCaa > 1:2773972/1‑91 (MQ=255) ctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAAt < 1:43536/91‑1 (MQ=255) ctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAAt < 1:1406624/91‑1 (MQ=255) ctAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAAt < 1:2157579/91‑1 (MQ=255) aaTGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTa < 1:1468506/91‑1 (MQ=255) aaTGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTa < 1:1470787/91‑1 (MQ=255) aaTGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTa > 1:2687840/1‑91 (MQ=255) aaTGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAAGATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAAtga > 1:1800187/1‑89 (MQ=255) ggTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAAt < 1:516943/91‑1 (MQ=255) tACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAg > 1:2706987/1‑91 (MQ=255) acacCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGTATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGt < 1:2973254/91‑1 (MQ=255) acacCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGt < 1:1858885/91‑1 (MQ=255) acacCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGt > 1:2911172/1‑91 (MQ=255) acacCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGt < 1:1479486/91‑1 (MQ=255) cacCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGtt < 1:1441526/91‑1 (MQ=255) cacCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGtt > 1:1589303/1‑91 (MQ=255) cacCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGtt < 1:2704964/91‑1 (MQ=255) cacCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGtt < 1:2705169/91‑1 (MQ=255) cacCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGtt < 1:2705673/91‑1 (MQ=255) ccTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTga > 1:3097952/1‑91 (MQ=255) gctgTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTgaatg > 1:3264837/1‑91 (MQ=255) ctgTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTgaatgg > 1:2633571/1‑91 (MQ=255) ctgTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTgaatgg > 1:138214/1‑91 (MQ=255) tgTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTgaatgga < 1:1930694/91‑1 (MQ=255) tgTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTgaatgga < 1:1177760/91‑1 (MQ=255) gTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTgaatggaa < 1:2144714/91‑1 (MQ=255) tCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTgaatggaat < 1:1472188/91‑1 (MQ=255) tCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTgaatggaat < 1:1472154/91‑1 (MQ=255) gCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGa > 1:1991334/1‑91 (MQ=255) cTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATaaa > 1:2038254/1‑91 (MQ=255) tgcaattgcaatATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATaaaa < 1:714992/91‑1 (MQ=255) gcaattgcaatATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATaaaaa > 1:4086178/1‑91 (MQ=255) attgcaatATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTa > 1:3721734/1‑91 (MQ=255) tgcaatATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACg > 1:1547290/1‑91 (MQ=255) caatATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGcc < 1:681606/91‑1 (MQ=255) caatATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGcc < 1:3673480/91‑1 (MQ=255) aatATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGccc > 1:1096787/1‑91 (MQ=255) aatATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGccc < 1:1557873/91‑1 (MQ=255) aatATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGccc < 1:195315/91‑1 (MQ=255) ttatATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATa < 1:630634/91‑1 (MQ=255) tataTGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGccatataatattgcaattgcagttgcgacagcaggtgtaccattagcagcttcgaaatatg < 1:3806486‑M2/91‑62 (MQ=255) tataTGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATAc < 1:2497442/91‑1 (MQ=255) atatGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATAcc > 1:2811755/1‑91 (MQ=255) tatGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCt < 1:2183916/91‑1 (MQ=255) atGGTGCATAGGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCtt < 1:2665979/91‑1 (MQ=255) tGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGccatataatattgcaattgcagttgcgacagcaggtgtaccattagcagcttcgaaatatgttgc < 1:360763‑M2/91‑66 (MQ=255) gCATAAGCGTATGTGAACGGCGccatataatattgcaattgcagttgcgacagcaggtgtaccattagcagcttcgaaatatgttgcgaaa < 1:3526546‑M2/91‑70 (MQ=255) gCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGtaa > 1:2553774/1‑91 (MQ=255) gCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGtaa > 1:3698225/1‑91 (MQ=255) gCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGtaa > 1:1418195/1‑91 (MQ=255) aTAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGtaatt > 1:555294/1‑91 (MQ=255) aGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGtaattaat > 1:186655/1‑91 (MQ=255) aGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGtaattaat < 1:3472457/91‑1 (MQ=255) aGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGtaattaat < 1:3472484/91‑1 (MQ=255) cGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAatat > 1:610242/1‑91 (MQ=255) cGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAatat > 1:144480/1‑91 (MQ=255) tATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATAc < 1:525233/91‑1 (MQ=255) tgtgAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTa < 1:454140/91‑1 (MQ=255) tgtgAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTa > 1:3224090/1‑91 (MQ=255) tgtgAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTa > 1:708524/1‑91 (MQ=255) tgtgAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTa < 1:241461/91‑1 (MQ=255) tgtgAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTa > 1:3845900/1‑91 (MQ=255) gAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTAATg < 1:3829232/91‑1 (MQ=255) aaCGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTAATgg < 1:2864616/91‑1 (MQ=255) aaCGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAAGAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTAATgg < 1:814488/91‑1 (MQ=255) aCGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTAATGGt < 1:2799401/91‑1 (MQ=255) cGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTAATGGTa > 1:689646/1‑91 (MQ=255) gcgcCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTAATGGTAAt > 1:937543/1‑91 (MQ=255) gcgcCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTAATGGTAAt > 1:937515/1‑91 (MQ=255) gcgcCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTAATGGTAAt < 1:881656/91‑1 (MQ=255) gcCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTAATGGTAATTa > 1:3897212/1‑91 (MQ=255) | TTCGCAACATATTTCGAAGCTGCTAATGGTACACCTGCTGTCGCAACTGCAATTGCAATATTATATGGTGCATAAGCGTATGTGAACGGCGCCATATTTTCTTGTCCACCAATTAAATAGTTGAATGGAATGATAAAAAGTACGCCCAATACCTTGGTAATTAATATACTAATGGTAATTA > USA300TCH1516_ALE/1876649‑1876829 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |