New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2004069 | 94 (0.960) | 11 (0.130) | 6/142 | NT | 11.6% | intergenic (‑2292/+92) | USA300TCH1516_01884/perR | tRNA‑Ile/Peroxide‑responsive repressor PerR |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2004081 | 85 (0.970) | intergenic (‑2304/+80) | USA300TCH1516_01884/perR | tRNA‑Ile/Peroxide‑responsive repressor PerR |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TTAATACCACTTCCGTAGTTAGAATATTCTTTTCTTCAATTTAAATATTTTTCAGAATAAGCAT‑AAAAAAAAGTTAAACAACTTTCATGTCGTTTAACTTCTTAAATATTACGCTTACTT‑ATATGAAGTAAGCTAACGCTTTTTTAATTTGTCATACTACCAAAGTTAAATTATTTATCT > USA300TCH1516_ALE/2003991‑2004170 | ttAATACCACTTCCGTAGTTAGAATATTCTTTTCTTCAATTTAAATATTTTTCAGAATAAGCAT‑AAAAAAAAGTTAAACAACTTTCATGTc > 1:1073659/1‑91 (MQ=255) ttAATACCACTTCCGTAGTTAGAATATTCTTTTCTTCAATTTAAATATTTTTCAGAATAAGCAT‑AAAAAAAAGTTAAACAACTTTCATGTc < 1:2976574/91‑1 (MQ=255) ttAATACCACTTCCGTAGTTAGAATATTCTTTTCTTCAATTTAAATATTTTTCAGAATAAGCAT‑AAAAAAAAGTTAAACAACTTTCATGTc > 1:3544065/1‑91 (MQ=255) tAATACCACTTCCGTAGTTAGAATATTCTTTTCTTCAATTTAAATATTTTTCAGAATAAGCCT‑AAAAAAAAGTTAAACAACTTTCATGTCg < 1:3325024‑M2/91‑2 (MQ=255) tAATACCACTTCCGTAGTTAGAATATTCTTTTCTTCAATTTAAATATTTTTCAGAATAAGCAT‑AAAAAAAAGTTAAACAACTTTCATGTCg < 1:3827986‑M2/91‑2 (MQ=255) caatACCACTTCCGTAGTTAGAATATTCTTTTCTTCAATTTAAATATTTTTCAGAATAAGCCT‑AAAAAAAAGTTAAACAACTTTCATGTCg < 1:3325039‑M2/90‑2 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |