| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2140331 = | 73 (0.740) | 4 (0.040) | 4/150 | NT | 5.7% | intergenic (‑771/+140) | USA300HOU_RS10910/groL | hypothetical protein/60 kDa chaperonin |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2140372 = | 65 (0.710) | intergenic (‑812/+99) | USA300HOU_RS10910/groL | hypothetical protein/60 kDa chaperonin | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TCAATACCACTATGAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCTAGTTAGTCAAAACTA > USA300TCH1516_ALE/2140282‑2140461 | tCAATACCACTATGAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGtctc < 1:1258814/91‑1 (MQ=255)tCAATACCACTATGAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGtctc < 1:1258670/91‑1 (MQ=255) cAATACCACTATGAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCg < 1:1035308/91‑1 (MQ=255) cAATACCACTATGAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCg < 1:3412745/91‑1 (MQ=255) aaTACCACTATGAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGt > 1:4092903/1‑91 (MQ=255) aCCACTATGAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAAt > 1:4027432/1‑91 (MQ=255) cTATGAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTaaa > 1:2581897/1‑91 (MQ=255) cTATGAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTaaa > 1:402388/1‑91 (MQ=255) tGAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAata < 1:1875338/91‑1 (MQ=255) gAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAatat > 1:2385030/1‑91 (MQ=255) gAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAatat > 1:3139722/1‑91 (MQ=255) gAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAatat > 1:3139837/1‑91 (MQ=255) atatCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAatatat > 1:1742376/1‑91 (MQ=255) tatCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATAtt > 1:640299/1‑91 (MQ=255) aTGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGt < 1:562594/91‑1 (MQ=255) tGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTg > 1:424205/1‑91 (MQ=255) gCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGc < 1:2979858/91‑1 (MQ=255) aaaaTCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCAtt < 1:1554003/91‑1 (MQ=255) aaaaTCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCAtt < 1:693271/91‑1 (MQ=255) aaTCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCt < 1:2092515/91‑1 (MQ=255) cacaAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAAt < 1:430295/91‑1 (MQ=255) cacaAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAAt > 1:2738111/1‑91 (MQ=255) cacaAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAAt > 1:3441548/1‑91 (MQ=255) acaAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAAtt < 1:959583/91‑1 (MQ=255) acaAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAAtt > 1:2151603/1‑91 (MQ=255) caAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAAttt > 1:657011/1‑91 (MQ=255) caAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAAttt > 1:657374/1‑91 (MQ=255) aaaTTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTta > 1:1253913/1‑91 (MQ=255) aTTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATNTGCNTGCATTNTAATTtana > 1:2289196/1‑91 (MQ=255) tACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGCAGACGTCTCGTAATTAACACATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAg > 1:4016943/1‑91 (MQ=255) tACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAg < 1:2700928/91‑1 (MQ=255) tACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAg < 1:2700802/91‑1 (MQ=255) tACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAg > 1:351567/1‑91 (MQ=255) aCAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAga < 1:2505217/91‑1 (MQ=255) aCAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAga > 1:2965913/1‑91 (MQ=255) cAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAgaa < 1:2437790/91‑1 (MQ=255) cAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAgaa < 1:2438147/91‑1 (MQ=255) cAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAgaa < 1:2055459/91‑1 (MQ=255) aaaaGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAgaatga < 1:3783803/91‑1 (MQ=255) aaaaGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAgaatga < 1:136333/91‑1 (MQ=255) aaGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAgaatgaat < 1:356624/91‑1 (MQ=255) aaGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAgaatgaat < 1:368572/91‑1 (MQ=255) aaGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAgaatgaat < 1:1599799/91‑1 (MQ=255) aaGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAgaatgaat < 1:1219118/91‑1 (MQ=255) aaGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAgaatgaat < 1:368661/91‑1 (MQ=255) GACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCa < 1:2298674‑M1/91‑1 (MQ=255) ACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATActtagaatgaaccat < 1:1339502‑M1/91‑5 (MQ=255) ACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCAt < 1:3909376‑M1/91‑1 (MQ=255) ACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCAt < 1:1781763‑M1/91‑1 (MQ=255) ACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCAt > 1:1477954‑M1/1‑91 (MQ=255) cgtcttccatttggtgactaaacttatgggaggcgtctCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATa > 1:1059757‑M2/39‑91 (MQ=255) CGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATa > 1:712801‑M1/1‑91 (MQ=255) gtcttccatttggtgactaaacttatgggaggcgtctCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATAc > 1:1559924‑M2/38‑91 (MQ=255) GCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATAc < 1:1140517‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATAc < 1:1621837‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATAc < 1:1230920‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATAc < 1:328432‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATAc < 1:269306‑M1/91‑1 (MQ=255) tCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCg < 1:2004972/91‑1 (MQ=255) tCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCg < 1:1576636/91‑1 (MQ=255) tCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCg > 1:1447576/1‑91 (MQ=255) tccatttggtgactaaacttatgggaggcgtctCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGt > 1:4045359‑M2/34‑91 (MQ=255) ccatttggtgactaaacttatgggaggcgtctCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTg > 1:1474433‑M2/33‑91 (MQ=255) cATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGc < 1:3409075/91‑1 (MQ=255) aTAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCa > 1:24077/1‑91 (MQ=255) aGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATaa > 1:89808/1‑91 (MQ=255) gTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAAt > 1:613194/1‑91 (MQ=255) gTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAAt < 1:3283379/91‑1 (MQ=255) gTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAAt > 1:2762217/1‑91 (MQ=255) ttAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGt < 1:494055/91‑1 (MQ=255) tAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTa > 1:614361/1‑91 (MQ=255) aGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTaa < 1:2964834/91‑1 (MQ=255) aGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTaa < 1:2964097/91‑1 (MQ=255) aGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTaa > 1:2989974/1‑91 (MQ=255) aGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTaa < 1:2573737/91‑1 (MQ=255) gTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAAt > 1:862012/1‑91 (MQ=255) gTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAAt > 1:2808369/1‑91 (MQ=255) gTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAAt > 1:862112/1‑91 (MQ=255) tCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAAtt < 1:2930163/91‑1 (MQ=255) tCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAAtt < 1:1918991/91‑1 (MQ=255) aCCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAAtttt < 1:1788181/91‑1 (MQ=255) aTGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCtagt < 1:323370/91‑1 (MQ=255) aTGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCtagt < 1:322738/91‑1 (MQ=255) gAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCtagttag > 1:235590/1‑91 (MQ=255) gAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCtagttag > 1:901702/1‑91 (MQ=255) gAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCtagttag < 1:926140/91‑1 (MQ=255) gAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCtagttag < 1:2983423/91‑1 (MQ=255) aaGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCtagttagt > 1:3126161/1‑91 (MQ=255) aaGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCtagttagt > 1:739094/1‑91 (MQ=255) aaGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCtagttagt > 1:1180793/1‑91 (MQ=255) aaGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCtagttagt > 1:3616025/1‑91 (MQ=255) aaGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCtagttagt > 1:2037170/1‑91 (MQ=255) aGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCTAGTTAGTc > 1:2410937/1‑91 (MQ=255) aGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCTAGTTAGTc > 1:41915/1‑91 (MQ=255) gACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCTAGTTAGTCa > 1:1206678/1‑91 (MQ=255) aCGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCTAGTTAGTCaa < 1:1904586/91‑1 (MQ=255) aCGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCTAGTTAGTCaa > 1:1960871/1‑91 (MQ=255) tctCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCTAGTTAGTCAAAAc < 1:2654752‑M2/88‑1 (MQ=255) tCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCTAGTTAGTCAAAACTa > 1:3722739‑M2/2‑91 (MQ=255) tCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCTAGTTAGTCAAAACTa < 1:768616‑M2/90‑1 (MQ=255) | TCAATACCACTATGAATATCTATGCTAAAATCACAAATTCATACAAAAAAGACGCCTCCCATAAGTTTAGTCACCAAATGGAAGACGTCTCGTAATTAAAATATATTTGCGTGCATTCTAATTTATACTTAGAATGAATCATACTCGTGCATAATGTAATTTTCTAGTTAGTCAAAACTA > USA300TCH1516_ALE/2140282‑2140461 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |