New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2255601 | 95 (0.970) | 7 (0.080) | 5/142 | NT | 7.5% | intergenic (‑279/‑36) | deoC2/deoD1 | Deoxyribose‑phosphate aldolase 2/Purine nucleoside phosphorylase DeoD‑type 1 |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2255626 | 89 (1.020) | intergenic (‑304/‑11) | deoC2/deoD1 | Deoxyribose‑phosphate aldolase 2/Purine nucleoside phosphorylase DeoD‑type 1 |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
ATATTTTTATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGCCTGGCGATCCGCTACG > USA300TCH1516_ALE/2255536‑2255716 | atatTTTTATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGgag > 1:1687996/1‑91 (MQ=255) atatTTTTATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGgag > 1:3347187/1‑91 (MQ=255) atatTTTTATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATACTAAGgag > 1:2075086/1‑91 (MQ=255) tatTTTTATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGa < 1:3950068‑M2/91‑2 (MQ=255) atTTTTATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaa > 1:1198537‑M2/1‑89 (MQ=255) tttttATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaag > 1:3968891‑M2/1‑88 (MQ=255) tttttATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaag > 1:1854925‑M2/1‑88 (MQ=255) tttttATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaag > 1:3522995‑M2/1‑88 (MQ=255) tttttATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCGTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaag < 1:2308045‑M2/91‑4 (MQ=255) tttATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaagat > 1:164247‑M2/1‑86 (MQ=255) tttATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaagat > 1:1645876‑M2/1‑86 (MQ=255) tttATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaagat > 1:164809‑M2/1‑86 (MQ=255) tttATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaagat < 1:2048764‑M2/91‑6 (MQ=255) tttATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaagat < 1:2133116‑M2/91‑6 (MQ=255) tttATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaagat < 1:3905674‑M2/91‑6 (MQ=255) taATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaagataaca > 1:1115735‑M2/1‑82 (MQ=255) aaTTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACaa < 1:1031159/91‑1 (MQ=255) ttCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAAt < 1:3784141/91‑1 (MQ=255) cTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGa > 1:2582400/1‑91 (MQ=255) tttAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGAc < 1:2755222/91‑1 (MQ=255) tttAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGAc > 1:1014003/1‑91 (MQ=255) tttAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGAc < 1:1824936/91‑1 (MQ=255) tAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACaa < 1:50810/91‑1 (MQ=255) tAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACaa < 1:581416/91‑1 (MQ=255) tAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACaa < 1:3442124/91‑1 (MQ=255) aaTTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACaaa < 1:1391989/91‑1 (MQ=255) aaTTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACaaa < 1:1982722/91‑1 (MQ=255) aaTTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACaaa < 1:1391550/91‑1 (MQ=255) aaTTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATCATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACaaa < 1:3498648/91‑1 (MQ=255) aTTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACaaaa > 1:1946707/1‑91 (MQ=255) tCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAgg < 1:431117/91‑1 (MQ=255) ataGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTac < 1:3835516/91‑1 (MQ=255) ataGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTac > 1:249512/1‑91 (MQ=255) taGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTaca < 1:1575280/91‑1 (MQ=255) gTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaagataacatttgtttcccttttttgc < 1:40018‑M2/91‑28 (MQ=255) tACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTAcacca < 1:1415955/91‑1 (MQ=255) tACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTAcacca < 1:2913023/91‑1 (MQ=255) aCAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTAcaccac > 1:3092027/1‑91 (MQ=255) aCAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTAcaccac > 1:3062044/1‑91 (MQ=255) aaaaaTTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACat > 1:2027025/1‑91 (MQ=255) aaaaTTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACata > 1:902738/1‑91 (MQ=255) aaaTTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACatat < 1:2851715/91‑1 (MQ=255) aaaTTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACatat < 1:2780419/91‑1 (MQ=255) aaaTTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACatat < 1:2780511/91‑1 (MQ=255) aTTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTc > 1:121909/1‑91 (MQ=255) tCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCaa < 1:3231710/91‑1 (MQ=255) cGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAAc > 1:2147234/1‑91 (MQ=255) cGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAAc > 1:2146750/1‑91 (MQ=255) gCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAAcc > 1:1109385/1‑91 (MQ=255) gCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAAcc > 1:2805419/1‑91 (MQ=255) cAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCa > 1:1403176/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCaa < 1:3912718/91‑1 (MQ=255) aaaaaGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCaaa > 1:3562327/1‑91 (MQ=255) aaaaaGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCaaa > 1:4071806/1‑91 (MQ=255) aaaaaGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCaaa < 1:1567627/91‑1 (MQ=255) gggAAACTAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAAGCAAATGGAg < 1:2082633/91‑1 (MQ=255) gggAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAg < 1:2289549/91‑1 (MQ=255) ggAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGt < 1:3675547/91‑1 (MQ=255) ggAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGt < 1:1719039/91‑1 (MQ=255) ggAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGt < 1:3675606/91‑1 (MQ=255) aaaCAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTaa > 1:2783653/1‑91 (MQ=255) aaaCAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTaa > 1:939184/1‑91 (MQ=255) aCAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTaaaa > 1:493187/1‑91 (MQ=255) cAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTaaaaa > 1:63558/1‑91 (MQ=255) aaTGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAAtt < 1:727105/91‑1 (MQ=255) aTGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaagataacatttgtttcccttttttgcgaatttttgtactatagaattaaagaatt < 1:1398242‑M2/91‑57 (MQ=255) tGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGc < 1:690876/91‑1 (MQ=255) gTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaagataacatttgtttcccttttttgcgaatttttgtactatagaattaaagaattat < 1:823347‑M2/91‑59 (MQ=255) ttATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTa < 1:1527298/91‑1 (MQ=255) ttATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTa > 1:1906053/1‑91 (MQ=255) aTCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTaaa > 1:3058679/1‑91 (MQ=255) tCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTaaaa < 1:2856172/91‑1 (MQ=255) ttAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGaagataacatttgtttcccttttttgcgaatttttgtactatagaattaaagaatataaaaata < 1:2030741‑M2/91‑65 (MQ=255) tAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAg < 1:1160130/91‑1 (MQ=255) aaaaTTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGt < 1:4018521/91‑1 (MQ=255) aaaaTTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGt < 1:4017889/91‑1 (MQ=255) aaaTTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTa > 1:1235943/1‑91 (MQ=255) aaTTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTAt < 1:1398312/91‑1 (MQ=255) aaTTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTAt < 1:2843291/91‑1 (MQ=255) attattAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTAtt < 1:1287177/91‑1 (MQ=255) attattAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTAtt < 1:2199822/91‑1 (MQ=255) attattAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGGACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTAtt < 1:4139703/91‑1 (MQ=255) ttattaATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTa < 1:1487508/91‑1 (MQ=255) ttattaATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTa < 1:1487365/91‑1 (MQ=255) ttaATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACGTATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAGAACAGTATTAATg > 1:4148183/1‑91 (MQ=255) ttaATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATg > 1:2669926/1‑91 (MQ=255) ttaATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATg > 1:1720915/1‑91 (MQ=255) taATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGc > 1:327304/1‑91 (MQ=255) taATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGc > 1:1590280/1‑91 (MQ=255) taATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGc > 1:2118652/1‑91 (MQ=255) aaTGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGcc > 1:487512/1‑91 (MQ=255) aTGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGCCt < 1:1753299/91‑1 (MQ=255) tGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGCCTg > 1:3146294/1‑91 (MQ=255) atTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGCCTGGCGAt < 1:360696/91‑1 (MQ=255) ttAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGCCTGGCGATc < 1:67569/91‑1 (MQ=255) aaGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGCCTGGCGATCCg > 1:197997/1‑91 (MQ=255) aaGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGCCTGGCGATCCg > 1:398124/1‑91 (MQ=255) gagaAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGCCTGGCGATCCGCTa > 1:1839525/1‑91 (MQ=255) gaagaTAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGCCTGGCGATCCGCTACg > 1:2230224/1‑91 (MQ=255) gaagaTAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGCCTGGCGATCCGCTACg > 1:2230256/1‑91 (MQ=255) | ATATTTTTATAATTCTTTAATTCTATAGTACAAAAATTCGCAAAAAAGGGAAACAAATGTTATCTTAAAATTATTAATGAATATTAAGGAGAAGATAACAAATGACAAAAGGTACACCACATATTCAACCAAATGGAGTAAAAATTGCTAAAACAGTATTAATGCCTGGCGATCCGCTACG > USA300TCH1516_ALE/2255536‑2255716 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |