New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2264711 | 113 (1.150) | 6 (0.070) | 4/138 | NT | 5.1% | coding (666/1092 nt) | USA300HOU_RS11590 | hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2264731 | 125 (1.470) | coding (686/1092 nt) | USA300HOU_RS11590 | hypothetical protein |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CTAGTTTCGTTGAATCAACTAACGATAAAGTAAAAACACACTTAGCTAATGGATTTAAAGCAATGAAAAATGGTCAAAAAACATTTTTCAAATTTTTCATTGGAATACTATTATTAAACTTAATTATTATTTTATTTAAAACACCTGTTGGTTACTTGATTTCATTTAATACGCAATCAC > USA300TCH1516_ALE/2264641‑2264820 | cTAGTTTCGTTGAATCAACTAACGATAAAGTAAAAACACACTTAGCTAATGGATTTAAAGCAATGAAAAATGGTCAAAAAACATTTTTCaa < 1:1185777/91‑1 (MQ=255) aGTTTCGTTGAATCAACTAACGATAAAGTAAAAACACACTTAGCTAATGGATTTAAAGCAATGAAAAATGGTCAAAAAACATTTTTCAAat > 1:1802080‑M2/1‑89 (MQ=255) cGTTGAATCAACTAACGATAAAGTAAAAACACACTTAGCTAATGGATTTAAAGCAATGAAAAATGGTCAAAAAACATTTTTCAAatttttc < 1:3102131‑M2/91‑8 (MQ=255) cGTTGAATCAACTAACGATAAAGTAAAAACACACTTAGCTAATGGATTTAAAGCAATGAAAAATGGTCAAAAAACATTTTTCAAatttttc < 1:3101895‑M2/91‑8 (MQ=255) cGTTGAATCAACTAACGATAAAGTAAAAACACACTTAGCTAATGGATTTAAAGCAATGAAAAATGGTCAAAAAACATTTTTCAAatttttc < 1:2001034‑M2/91‑8 (MQ=255) ttGAATCAACTAACGATAAAGTAAAAACACACTTAGCTAATGGATTTAAAGCAATGAAAAATGGTCAAAAAACATTTTTCAAatttttcat < 1:206214‑M2/91‑10 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |