New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2331225 | 76 (0.770) | 7 (0.080) | 4/148 | NT | 8.1% | coding (694/933 nt) | lacC_2 | Tagatose‑6‑phosphate kinase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2331255 | 88 (0.970) | coding (664/933 nt) | lacC_2 | Tagatose‑6‑phosphate kinase |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
ACCAACCGGATTTAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGTTAAGCAA > USA300TCH1516_ALE/2331166‑2331345 | accaaccGGATTTAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGAc > 1:504523‑M2/1‑90 (MQ=255) caaccGGATTTAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGAcac > 1:3670513‑M2/1‑88 (MQ=255) caaccGGATTTAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGAcac > 1:1215639‑M2/1‑88 (MQ=255) accGGATTTAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGAcacaa < 1:3055957‑M2/91‑6 (MQ=255) ccGGATTTAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGAcacaat < 1:1563276‑M2/91‑7 (MQ=255) cGGATTTAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACaata > 1:542797/1‑91 (MQ=255) ggATTTAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACaataa > 1:2370386/1‑91 (MQ=255) aTTTAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATc > 1:3883109/1‑91 (MQ=255) tAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCAc > 1:124945/1‑91 (MQ=255) tAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCAc > 1:1277410/1‑91 (MQ=255) tAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCAc > 1:3761758/1‑91 (MQ=255) tAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCAc > 1:4087674/1‑91 (MQ=255) tAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCAc > 1:4087735/1‑91 (MQ=255) tAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCAc > 1:1738685/1‑91 (MQ=255) tAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATACACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCAc > 1:2706024/1‑91 (MQ=255) aaTACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACt > 1:307165/1‑91 (MQ=255) cacTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAAt < 1:677242/91‑1 (MQ=255) acTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATc < 1:139431/91‑1 (MQ=255) ttATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATccc < 1:2998082/91‑1 (MQ=255) ttATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATccc < 1:323916/91‑1 (MQ=255) ttGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTc > 1:310779/1‑91 (MQ=255) ttGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTc > 1:1415200/1‑91 (MQ=255) gTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGa < 1:74816/91‑1 (MQ=255) tCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGaa < 1:3557189/91‑1 (MQ=255) cGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAAt > 1:2150138/1‑91 (MQ=255) cGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAAt < 1:2975756/91‑1 (MQ=255) cGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTACCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAAt > 1:3496233/1‑91 (MQ=255) gAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATaa > 1:581258/1‑91 (MQ=255) gAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATaa > 1:581257/1‑91 (MQ=255) tCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTtg < 1:2184966/91‑1 (MQ=255) tCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTtg < 1:1748158/91‑1 (MQ=255) tCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTtg > 1:1685116/1‑91 (MQ=255) cACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTtgt > 1:235316/1‑91 (MQ=255) tataGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGacac < 1:3013830/91‑1 (MQ=255) aGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGc > 1:4137308/1‑91 (MQ=255) gAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGcc < 1:800189/91‑1 (MQ=255) gAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGcc > 1:2456114/1‑91 (MQ=255) gTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGtt < 1:3201140/91‑1 (MQ=255) gTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGtt < 1:4077404/91‑1 (MQ=255) gTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGtt < 1:3231858/91‑1 (MQ=255) gTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGtt > 1:1733470/1‑91 (MQ=255) gTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGtt > 1:3235868/1‑91 (MQ=255) gTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGtt < 1:2221869/91‑1 (MQ=255) tATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGAcacaatcatacattctatagagtgaatattccgacaataagtgtattaaat < 1:1108984‑M2/91‑52 (MQ=255) tATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGAcacaatcatacattctatagagtgaatattccgacaataagtgtattaaat < 1:1109175‑M2/91‑52 (MQ=255) tATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGttt > 1:3967887/1‑91 (MQ=255) tATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGttt < 1:219918/91‑1 (MQ=255) aTGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTc < 1:1732687/91‑1 (MQ=255) aTGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTc > 1:4037240/1‑91 (MQ=255) aTGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTc < 1:2878789/91‑1 (MQ=255) tGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCa > 1:2138773/1‑91 (MQ=255) aTTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCaaa > 1:3266452/1‑91 (MQ=255) ttGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGAcacaatcatacattctatagagtgaatattccgacaataagtgtattaaatccggt < 1:2119464‑M2/91‑57 (MQ=255) gtgCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGAcacaatcatacattctatagagtgaatattccgacaataagtgtattaaatccggttg < 1:2834458‑M2/91‑59 (MQ=255) gtgCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGAcacaatcatacattctatagagtgaatattccgacaataagtgtattaaatccggttg < 1:2834370‑M2/91‑59 (MQ=255) gtgCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGAGACAATAATCCACTCAATCCCTTCGACTAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACtt < 1:3683011/91‑1 (MQ=255) gCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGGCACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTc < 1:1471019/91‑1 (MQ=255) gCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTc < 1:1824469/91‑1 (MQ=255) cTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCt < 1:1214931/91‑1 (MQ=255) ttAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTa < 1:3722956/91‑1 (MQ=255) ttAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTa < 1:3229300/91‑1 (MQ=255) ttAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCCAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTa < 1:3496548/91‑1 (MQ=255) aGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTaaa > 1:2224964/1‑91 (MQ=255) aGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTaaa > 1:2994136/1‑91 (MQ=255) cGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACt < 1:3714576/91‑1 (MQ=255) cGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACt > 1:2966404/1‑91 (MQ=255) gAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACtt < 1:2458137/91‑1 (MQ=255) gCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTtcat > 1:2977160/1‑91 (MQ=255) aCCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTtcatca < 1:546210/91‑1 (MQ=255) aCCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTtcatca < 1:546131/91‑1 (MQ=255) ccTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCaa > 1:809930/1‑91 (MQ=255) ccTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCaa > 1:2383048/1‑91 (MQ=255) ccTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCaa < 1:3856308/91‑1 (MQ=255) ccTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCACTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCaa > 1:776381/1‑91 (MQ=255) caaggtgCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCaa > 1:1089369/5‑91 (MQ=255) cTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAg > 1:3523813/1‑91 (MQ=255) cTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAg < 1:2936735/91‑1 (MQ=255) ttGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGCCACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGt > 1:3933451/1‑91 (MQ=255) tgtgCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTg < 1:2555635/91‑1 (MQ=255) tgtgCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTg > 1:2640910/1‑91 (MQ=255) gtgCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTgg < 1:1164211/91‑1 (MQ=255) gtgCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTgg > 1:1378551/1‑91 (MQ=255) gtgCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTgg > 1:814038/1‑91 (MQ=255) gtgCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTgg < 1:1164339/91‑1 (MQ=255) tgCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGc > 1:701703/1‑91 (MQ=255) cACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTg > 1:3441523/1‑91 (MQ=255) aCCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTgg < 1:383470/91‑1 (MQ=255) aCCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTgg > 1:313070/1‑91 (MQ=255) ccTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCGTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGt < 1:3507932/91‑1 (MQ=255) ccTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGt < 1:1848830/91‑1 (MQ=255) ccTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGt > 1:1610321/1‑91 (MQ=255) cTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGtt > 1:1772229/1‑91 (MQ=255) cTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGtt < 1:305064/91‑1 (MQ=255) cTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGtt < 1:305317/91‑1 (MQ=255) cTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGtt > 1:2356966/1‑91 (MQ=255) aaGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGTTAAg < 1:3911922/91‑1 (MQ=255) aaGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGTTAAg < 1:957609/91‑1 (MQ=255) acacAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGTTAAGCaa < 1:1828285/91‑1 (MQ=255) acacAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGTTAAGCaa > 1:2428936/1‑91 (MQ=255) acacAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGTTAAGCaa > 1:3523990/1‑91 (MQ=255) | ACCAACCGGATTTAATACACTTATTGTCGGAATATTCACTCTATAGAATGTATGATTGTGCTTAGCGAATGCACCTTGTGCACCTAAAGACACAATAATCCACTCAATCCCTTCGAATAAGGGTTGTGACACTGCCTGTTTCAAACTTTCTAAACTTTCATCAAGTGGCTGGTTAAGCAA > USA300TCH1516_ALE/2331166‑2331345 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |