New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2761242 = | 78 (0.790) | 5 (0.060) | 4/144 | NT | 7.3% | intergenic (‑244/+249) | citN/sirC | Citrate transporter/Precorrin‑2 dehydrogenase |
? | USA300TCH1516_ALE | 2761289 = | 57 (0.640) | intergenic (‑291/+202) | citN/sirC | Citrate transporter/Precorrin‑2 dehydrogenase |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTA > USA300TCH1516_ALE/2761199‑2761378 | aaagatacgtagaacaaacttaataaaataggtggataaattgAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTc > 1:1374768‑M1/44‑91 (MQ=255) aTTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCa < 1:1233591/91‑1 (MQ=255) ttttGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCaa < 1:649261/91‑1 (MQ=255) tGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAAttt < 1:3802620/91‑1 (MQ=255) gATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTa > 1:1465444/1‑91 (MQ=255) cTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATcc < 1:2585915/91‑1 (MQ=255) tATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCa > 1:3513842/1‑91 (MQ=255) tATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCa > 1:3513939/1‑91 (MQ=255) tATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCa > 1:1137665/1‑91 (MQ=255) tATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCa > 1:636030/1‑91 (MQ=255) aTCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCAc < 1:3601897/91‑1 (MQ=255) aTCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCAc < 1:2431366/91‑1 (MQ=255) aTCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCAc > 1:169584/1‑91 (MQ=255) aTTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTa > 1:1409181/1‑91 (MQ=255) ttttATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTAtt < 1:3816166/91‑1 (MQ=255) ttttATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTAtt < 1:344526/91‑1 (MQ=255) ttattaTTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTAtttt < 1:1314601/91‑1 (MQ=255) tattatTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTtta > 1:3935978/1‑91 (MQ=255) tattatTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTtta > 1:1845677/1‑91 (MQ=255) attattGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTttat > 1:54650/1‑91 (MQ=255) attattGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTttat > 1:3354370/1‑91 (MQ=255) ttattGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTttatt > 1:3435587/1‑91 (MQ=255) tattGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTttatta < 1:2878649/91‑1 (MQ=255) tattGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTttatta < 1:3372330/91‑1 (MQ=255) attGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTaa < 1:3716211/91‑1 (MQ=255) ttGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAg < 1:151896/91‑1 (MQ=255) tGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGt < 1:1206327/91‑1 (MQ=255) ttCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGt < 1:523306/91‑1 (MQ=255) ttCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGt < 1:1946556/91‑1 (MQ=255) ttCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGt < 1:1946769/91‑1 (MQ=255) aTTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTa < 1:1641332/91‑1 (MQ=255) aTTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTa < 1:535045/91‑1 (MQ=255) ttGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTAc < 1:1069490/91‑1 (MQ=255) tGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACg < 1:1118940/91‑1 (MQ=255) gCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTTTCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGt < 1:379136/91‑1 (MQ=255) gCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGt > 1:830458/1‑91 (MQ=255) gCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGt < 1:379195/91‑1 (MQ=255) gCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGt < 1:379147/91‑1 (MQ=255) cacaAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTa < 1:1835564/91‑1 (MQ=255) cacaAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTa > 1:2610965/1‑91 (MQ=255) cacaAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTa > 1:2610829/1‑91 (MQ=255) acaAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTAt > 1:794776/1‑91 (MQ=255) gaaatctggttgaagtcgttactatcatagcgacctttagccagatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCttt > 1:1374768‑M2/49‑91 (MQ=255) aaaaTCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCttt > 1:2793771/1‑91 (MQ=255) aaaaTCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCttt > 1:2798179/1‑91 (MQ=255) AAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCtttt < 1:1071581‑M1/91‑1 (MQ=255) AAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCtttt > 1:3061379‑M1/1‑91 (MQ=255) TCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTtct < 1:2430633‑M1/91‑1 (MQ=255) TCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTtct < 1:4100232‑M1/91‑1 (MQ=255) TCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTtct > 1:2913280‑M1/1‑91 (MQ=255) ctggttgaagtcgttactatcatagcgacctttagccagatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTtctc > 1:728333‑M2/44‑91 (MQ=255) tggttgaagtcgttactatcatagcgacctttagccagatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTctct > 1:1808625‑M2/43‑91 (MQ=255) TGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTctct < 1:1588124‑M1/91‑1 (MQ=255) TGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTctct < 1:387934‑M1/91‑1 (MQ=255) GGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTa < 1:312203‑M1/91‑1 (MQ=255) GGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTa < 1:2934006‑M1/91‑1 (MQ=255) GGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTa < 1:1028936‑M1/91‑1 (MQ=255) GGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTa < 1:146694‑M1/91‑1 (MQ=255) GGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTa < 1:146795‑M1/91‑1 (MQ=255) GGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTa < 1:2410562‑M1/91‑1 (MQ=255) GCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTAt < 1:2966695‑M1/91‑1 (MQ=255) GCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTAt < 1:3437380‑M1/91‑1 (MQ=255) tAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTg < 1:3938615/91‑1 (MQ=255) aaaGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGt > 1:2607955/1‑91 (MQ=255) cGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATAtt > 1:1724445/1‑91 (MQ=255) cGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATAtt > 1:2037540/1‑91 (MQ=255) tactatcatagcgacctttagccagatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCa < 1:2840038‑M2/62‑1 (MQ=255) tATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCat < 1:1017768/91‑1 (MQ=255) tATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCat < 1:3588273/91‑1 (MQ=255) tGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCatat < 1:3396857/91‑1 (MQ=255) tGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCatat < 1:3397001/91‑1 (MQ=255) gATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATAtt < 1:963883/91‑1 (MQ=255) aGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTaa > 1:1455163/1‑91 (MQ=255) aGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTaa < 1:1918896/91‑1 (MQ=255) cGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGc > 1:286990/1‑91 (MQ=255) gACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCa < 1:1410888/91‑1 (MQ=255) aCTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCat < 1:657717/91‑1 (MQ=255) cTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCata > 1:2868148/1‑91 (MQ=255) ttCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCatat < 1:1275932/91‑1 (MQ=255) tCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATc > 1:3100043/1‑91 (MQ=255) cAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCa > 1:1620704/1‑91 (MQ=255) cAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCa < 1:198643/91‑1 (MQ=255) cAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCa < 1:199198/91‑1 (MQ=255) aaCCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCAt < 1:1783801/91‑1 (MQ=255) aaCCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCAt > 1:362446/1‑91 (MQ=255) aaCCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCAt < 1:1074520/91‑1 (MQ=255) aCCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTTTCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCAtt > 1:3315962/1‑91 (MQ=255) cagatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTAt < 1:2593884‑M2/84‑1 (MQ=255) agatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATc < 1:1724597‑M2/85‑1 (MQ=255) agatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATc < 1:796966‑M2/85‑1 (MQ=255) gatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCg < 1:2150283‑M2/86‑1 (MQ=255) gatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCg > 1:1846718‑M2/6‑91 (MQ=255) gatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCg < 1:134036‑M2/86‑1 (MQ=255) atttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGc > 1:906785‑M2/5‑91 (MQ=255) atttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGc < 1:3660982‑M2/87‑1 (MQ=255) tttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCt < 1:4031261‑M2/88‑1 (MQ=255) tttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCt > 1:2541577‑M2/4‑91 (MQ=255) tttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCt < 1:2037046‑M2/88‑1 (MQ=255) tCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTa < 1:1124619‑M2/90‑1 (MQ=255) tCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTa > 1:3834921‑M2/2‑91 (MQ=255) | CATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTA > USA300TCH1516_ALE/2761199‑2761378 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |