New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2778362 = | 78 (0.790) | 6 (0.070) | 5/142 | NT | 7.5% | coding (918/942 nt) | arcC2 | Carbamate kinase 2 |
? | USA300TCH1516_ALE | 2778404 = | 79 (0.910) | coding (876/942 nt) | arcC2 | Carbamate kinase 2 |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
ATGTTTTGTCGCGTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTACCTTGTGC > USA300TCH1516_ALE/2778315‑2778493 | aTGTTTTGTCGCGTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGa > 1:153713/1‑91 (MQ=255) aTGTTTTGTCGCGTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGa > 1:1914961/1‑91 (MQ=255) tGTTTTGTCGCGTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGAt < 1:263099/91‑1 (MQ=255) tGTTTTGTCGCGTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGAt < 1:608600/91‑1 (MQ=255) agctgcgatacgatttgttgaaagtggggaaaacaaaaaagttatcATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGAt > 1:3415052‑M1/47‑91 (MQ=255) ttGTCGCGTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACt > 1:372456/1‑91 (MQ=255) tGTCGCGTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACtt > 1:196596/1‑91 (MQ=255) gTCGCGTGATAGAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACttt < 1:1629410/91‑1 (MQ=255) gTCGCGTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTAGCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACttt < 1:3292431/91‑1 (MQ=255) tCGCGTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACtttt < 1:453623/91‑1 (MQ=255) tCGCGTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACtttt < 1:211321/91‑1 (MQ=255) cgcgTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACttttt < 1:2782981/91‑1 (MQ=255) cgcgTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTATATTACCAATCATGGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACttttt < 1:1717574/91‑1 (MQ=255) cgTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTg < 1:3921196/91‑1 (MQ=255) gTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGt < 1:3257997/91‑1 (MQ=255) gTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGt > 1:4088933/1‑91 (MQ=255) tGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGtt > 1:1661789/1‑91 (MQ=255) tGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGtt > 1:144049/1‑91 (MQ=255) aaaGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTcc < 1:2179479/91‑1 (MQ=255) aaGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTccc < 1:1004098/91‑1 (MQ=255) aGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTcccc < 1:1654869/91‑1 (MQ=255) aGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTcccc > 1:3653533/1‑91 (MQ=255) gCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCACTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACt < 1:3490407/91‑1 (MQ=255) tACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACttt < 1:3139620/91‑1 (MQ=255) cATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTca > 1:3630625/1‑91 (MQ=255) aTGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTcaa < 1:2818009/91‑1 (MQ=255) tgAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTcaacaa < 1:501151/91‑1 (MQ=255) tgtgtgTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCg < 1:594542/91‑1 (MQ=255) tgtgtgTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCg < 1:2802804/91‑1 (MQ=255) tgtgtgTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCg > 1:2609995/1‑91 (MQ=255) tgtgtgTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCg > 1:2462927/1‑91 (MQ=255) tgtgtgTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCg < 1:594689/91‑1 (MQ=255) tgtACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATc > 1:92277/1‑91 (MQ=255) tgtACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATc > 1:1417774/1‑91 (MQ=255) tACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGc > 1:3089212/1‑91 (MQ=255) ccTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAg < 1:112357/91‑1 (MQ=255) tttATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCt < 1:150643/91‑1 (MQ=255) tttATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCt < 1:3830257/91‑1 (MQ=255) atcattaccaatttagagcgggcatacgaagctttgattggtaatGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCt > 1:3414971‑M2/46‑91 (MQ=255) atcattaccaatttagagcaggcatacgaagctttgattggtaatGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCt > 1:3415052‑M2/46‑91 (MQ=255) ttattaCCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCtt < 1:1131741/91‑1 (MQ=255) ttattaCCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCtt < 1:1888711/91‑1 (MQ=255) ttattaCCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCtt < 1:2711781/91‑1 (MQ=255) ttattaCCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCtt < 1:2711818/91‑1 (MQ=255) ttattaCCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCtt < 1:1434394/91‑1 (MQ=255) ttattaCCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCtt > 1:243436/1‑91 (MQ=255) tattaCCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTc < 1:3380152/91‑1 (MQ=255) tattaCCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTc > 1:749027/1‑91 (MQ=255) ATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCt > 1:4114875‑M1/1‑91 (MQ=255) taccaatttagagcaggcatacgaagctttgattggtaatGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTAt > 1:875300‑M2/41‑91 (MQ=255) TACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTAt < 1:154852‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTAtt < 1:3615911‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTAtt > 1:1677271‑M1/1‑91 (MQ=255) CCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTAttt < 1:4024788‑M1/91‑1 (MQ=255) CCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTAttt < 1:2026759‑M1/91‑1 (MQ=255) caatttagagcaggcatacgaagctttgattggtaatGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTAtttt > 1:2990283‑M2/38‑91 (MQ=255) CAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTAtttt > 1:2008258‑M1/1‑91 (MQ=255) aatttagagcaggcatacgaagctttgattggtaatGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTAttttt > 1:3114466‑M2/37‑91 (MQ=255) AATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTGTAttttt < 1:2075805‑M1/91‑1 (MQ=255) AATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTAttttt > 1:1372188‑M1/1‑91 (MQ=255) AATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTAttttt > 1:1369339‑M1/1‑91 (MQ=255) AATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTAttttt > 1:1369315‑M1/1‑91 (MQ=255) TCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTgg < 1:2456981‑M1/91‑1 (MQ=255) cAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGc < 1:3837929/91‑1 (MQ=255) cAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGc < 1:2502634/91‑1 (MQ=255) aaaGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCa > 1:2746132/1‑91 (MQ=255) aaGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCaa < 1:1381691/91‑1 (MQ=255) aGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAAc > 1:2903219/1‑91 (MQ=255) aGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAAc > 1:412770/1‑91 (MQ=255) gCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACa < 1:3717708/91‑1 (MQ=255) cTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACAt > 1:3814663/1‑91 (MQ=255) cTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACAt < 1:706932/91‑1 (MQ=255) ttCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATc > 1:1287730/1‑91 (MQ=255) ttCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATc > 1:1407188/1‑91 (MQ=255) tCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCg > 1:2858274/1‑91 (MQ=255) aTGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATcc > 1:3569788/1‑91 (MQ=255) aTGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATcc < 1:864292/91‑1 (MQ=255) aTGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATcc < 1:2235996/91‑1 (MQ=255) tGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCt < 1:3366332/91‑1 (MQ=255) tGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCt < 1:3366137/91‑1 (MQ=255) ccTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTc > 1:688176/1‑91 (MQ=255) ccTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTc > 1:1787950/1‑91 (MQ=255) cTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTcc > 1:1295364/1‑91 (MQ=255) cTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTcc > 1:1533840/1‑91 (MQ=255) tGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCca < 1:434387/91‑1 (MQ=255) tGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCca > 1:795911/1‑91 (MQ=255) ctctAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCcaca < 1:4045874/91‑1 (MQ=255) ctAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACaaa > 1:2765599/1‑91 (MQ=255) aaTTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACtt > 1:740946/1‑91 (MQ=255) aaTTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACtt > 1:1077195/1‑91 (MQ=255) aaTTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACtt > 1:1395307/1‑91 (MQ=255) attggtaatGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTa > 1:729279‑M2/10‑91 (MQ=255) tggtaatGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTAcc < 1:706430‑M2/84‑1 (MQ=255) ggtaatGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTACCt > 1:2320346‑M2/7‑91 (MQ=255) ggtaatGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTACCt > 1:2771280‑M2/7‑91 (MQ=255) taatGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTACcttt > 1:566218‑M2/5‑90 (MQ=255) aatGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTACCTtgt > 1:3249030‑M2/4‑91 (MQ=255) atGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTACCTtgtg > 1:3687734‑M2/3‑91 (MQ=255) atGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTACCTtgtg > 1:3687423‑M2/3‑91 (MQ=255) atGACAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTACCTtgtg > 1:3281653‑M2/3‑91 (MQ=255) | ATGTTTTGTCGCGTGATAAAGTGCTACATGTGAATGTGTGTACCTTTATTACCAATCAAAGCTTCGTATGCCTGCTCTAAATTGGTAATGATAACTTTTTTGTTTTCCCCACTTTCAACAAATCGTATCGCAGCTTCTATTTTTGGCAACATCGATCCTTCCACAAACTTACCTTGTGC > USA300TCH1516_ALE/2778315‑2778493 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |