New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2833267 = | 81 (0.820) | 8 (0.090) | 5/148 | NT | 9.5% | intergenic (‑603/+487) | lipA_2/hisI | Lipase 1/Phosphoribosyl‑AMP cyclohydrolase |
? | USA300TCH1516_ALE | 2833307 = | 78 (0.860) | intergenic (‑643/+447) | lipA_2/hisI | Lipase 1/Phosphoribosyl‑AMP cyclohydrolase |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
TGAACTACCTTTAACTTAATCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATAGTATAAATACA > USA300TCH1516_ALE/2833217‑2833397 | tGAACTACCTTTAACTTAATCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGc < 1:3020447/91‑1 (MQ=255) tGAACTACCTTTAACTTAATCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGc > 1:1628014/1‑91 (MQ=255) gaaatgtcatagcctatttaaaagacaatctccattagaactaagatatgCATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGc > 1:2027516‑M1/51‑91 (MQ=255) gaaatgtcatagcctatttaaaagacaatctccattagaactaagatataCATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGc > 1:3329149‑M1/51‑91 (MQ=255) aaCTACCTTTAACTTAATCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCat < 1:908880/91‑1 (MQ=255) aaCTACCTTTAACTTAATCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCat < 1:3884355/91‑1 (MQ=255) aCCTTTAACTTAATCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCt < 1:1748649/91‑1 (MQ=255) ccTTTAACTTAATCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCtt < 1:395901/91‑1 (MQ=255) cTTTAACTTAATCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTa > 1:3348235/1‑91 (MQ=255) ttAACTTAATCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGt > 1:494054/1‑91 (MQ=255) tAACTTAATCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGtt > 1:663955/1‑91 (MQ=255) aCTTAATCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCt > 1:3380763/1‑91 (MQ=255) aTCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATgg < 1:978493/91‑1 (MQ=255) aTCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATgg > 1:2505015/1‑91 (MQ=255) aTCTCGAATGTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATgg < 1:3965426/91‑1 (MQ=255) tctcGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGga < 1:2615155/91‑1 (MQ=255) ctcGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGgag > 1:1772838/1‑91 (MQ=255) cGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGAt > 1:964481/1‑91 (MQ=255) gAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGAtt > 1:147557/1‑91 (MQ=255) aaTTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTg < 1:283918/91‑1 (MQ=255) atgatgATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCttt > 1:1526108/1‑91 (MQ=255) atgatgATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCttt > 1:1526248/1‑91 (MQ=255) tgatgaTTAGCATGAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCtttt < 1:4152366/91‑1 (MQ=255) tgatgaTTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCtttt > 1:3291043/1‑91 (MQ=255) gatTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAAt < 1:2563094/91‑1 (MQ=255) atTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATa < 1:843053/91‑1 (MQ=255) tAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAgg < 1:2906831/91‑1 (MQ=255) tAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAgg < 1:2461749/91‑1 (MQ=255) tAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAgg < 1:1205194/91‑1 (MQ=255) gCATAAATATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCt < 1:2080598/91‑1 (MQ=255) gCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCt > 1:674924/1‑91 (MQ=255) gCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCt < 1:1020034/91‑1 (MQ=255) gCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCt < 1:2377054/91‑1 (MQ=255) gCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCt < 1:21828/91‑1 (MQ=255) gCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCt < 1:232050/91‑1 (MQ=255) cATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTa > 1:914461/1‑91 (MQ=255) cATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTa > 1:438926/1‑91 (MQ=255) aTAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTAt < 1:2864929/91‑1 (MQ=255) tAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATg < 1:2370998/91‑1 (MQ=255) aaTACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACAt < 1:1003369/91‑1 (MQ=255) tACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACAttt < 1:3585826/91‑1 (MQ=255) tACATCCCATAAAGTTAGTGTTTTAGTCGAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACAttt < 1:335316/91‑1 (MQ=255) gcatcccgaaagttagactaaaaaactaactttatgggatgTATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTc > 1:3329149‑M2/42‑91 (MQ=255) gcatcccgaaagttagactaaaaaactaactttatgggatgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTc > 1:2027516‑M2/42‑91 (MQ=255) aCATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTc < 1:1592171/91‑1 (MQ=255) aCATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTc < 1:1926477/91‑1 (MQ=255) aCATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTc < 1:1926340/91‑1 (MQ=255) CATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCt > 1:2003374‑M1/1‑91 (MQ=255) TCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTAt > 1:1662996‑M1/1‑91 (MQ=255) CCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTAtt > 1:3669210‑M1/1‑91 (MQ=255) CCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTAtt < 1:3238349‑M1/91‑1 (MQ=255) CCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTAtt < 1:3238334‑M1/91‑1 (MQ=255) CCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTAttt > 1:1100435‑M1/1‑91 (MQ=255) CCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTAttt > 1:2123296‑M1/1‑91 (MQ=255) CCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTAttt > 1:1095792‑M1/1‑91 (MQ=255) cgaaagttagactaaaaaactaactttatgggatgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTc > 1:552963‑M2/36‑91 (MQ=255) cgaaagttagactaaaaaactaactttatgggatgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTc > 1:2828556‑M2/36‑91 (MQ=255) CATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTc > 1:628355‑M1/1‑91 (MQ=255) gaaagttagactaaaaaactaactttatgggatgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCa > 1:1114078‑M2/35‑91 (MQ=255) gaaagttagactaaaaaactaactttatgggatgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCa > 1:1113919‑M2/35‑91 (MQ=255) aaagttagactaaaaaactaactttatgggatgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAg > 1:240880‑M2/34‑91 (MQ=255) agttagactaaaaaactaactttatgggatgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGc > 1:1023542‑M2/32‑91 (MQ=255) agttagttTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCt < 1:1802181/91‑1 (MQ=255) agttagttTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCt < 1:866986/91‑1 (MQ=255) agttagttTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCt < 1:870906/91‑1 (MQ=255) agttTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGat < 1:3427866/91‑1 (MQ=255) agttTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGat > 1:1346215/1‑91 (MQ=255) gttTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGata < 1:278363/91‑1 (MQ=255) gttTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGata > 1:1048409/1‑91 (MQ=255) gttTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGata > 1:2854087/1‑91 (MQ=255) gttTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGata > 1:1879815/1‑91 (MQ=255) gttTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGata < 1:3318894/91‑1 (MQ=255) gttTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGata < 1:3318614/91‑1 (MQ=255) gttTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGata < 1:4107488/91‑1 (MQ=255) tttttAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGatata > 1:585858/1‑91 (MQ=255) tttAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATAtt < 1:3435194/91‑1 (MQ=255) tttAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATAtt > 1:2313384/1‑91 (MQ=255) tAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTg > 1:1601900/1‑91 (MQ=255) aGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGt < 1:1706098/91‑1 (MQ=255) aGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGt < 1:1705442/91‑1 (MQ=255) cTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTAtt > 1:2432799/1‑91 (MQ=255) cTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTAtt > 1:1955760/1‑91 (MQ=255) cTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTAtt > 1:1001895/1‑91 (MQ=255) tAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTAttt < 1:2128225/91‑1 (MQ=255) aCTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTtat < 1:718764/91‑1 (MQ=255) cGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATAGtat > 1:3947497/1‑91 (MQ=255) cGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATAGtat > 1:3078703/1‑91 (MQ=255) cGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATACtat < 1:1193652/91‑1 (MQ=255) cGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATACtat < 1:694153/91‑1 (MQ=255) cGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATACtat < 1:1603164/91‑1 (MQ=255) ggatgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATAGTATaa > 1:413113‑M2/6‑91 (MQ=255) ggatgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATAGTATaa < 1:4121938‑M2/86‑1 (MQ=255) ggatgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATAGTATaa > 1:3680529‑M2/6‑91 (MQ=255) gatgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATACTATaaa < 1:1601057‑M2/87‑1 (MQ=255) atgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATAGTATAAAt < 1:1079872‑M2/88‑1 (MQ=255) atgCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATACTATAAAt < 1:685773‑M2/88‑1 (MQ=255) gCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATAGTATAAATAc > 1:1297589‑M2/2‑91 (MQ=255) gCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATAGTATAAATAc > 1:730576‑M2/2‑91 (MQ=255) cATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATAGTATAAATACa < 1:556130/91‑1 (MQ=255) cATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATAGTATAAATACa < 1:3653189/91‑1 (MQ=255) | TGAACTACCTTTAACTTAATCTCGAATTTATGATGATTAGCATAAAAATACATCCCATAAAGTTAGTTTTTTAGTCTAACTTTCGGGATGCATATCTTAGTTCTAATGGAGATTGTCTTTTAAATAGGCTATGACATTTCTATTTCAGGCTAGATATATTTGTATTTATAGTATAAATACA > USA300TCH1516_ALE/2833217‑2833397 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |