| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | 25306 = | 167 (0.480) | 29 (0.100) | 11/138 | NT | 17.5% | intergenic (+204/‑42) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0030/USA300HOU_pUSA300HOUMR0031 | Sin recombinase/hypothetical protein |
| ? | CP000731 | 25340 = | 130 (0.430) | intergenic (+238/‑8) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0030/USA300HOU_pUSA300HOUMR0031 | Sin recombinase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 435 total aligned reads displayed.
TTTAAAATATATTATAATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCTTCAGAAAC > CP000731/25250‑25430 | tttAAAATATATTATAATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAgg > 1:2801447/1‑91 (MQ=255) aaaaTATATTATAATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGgtgt < 1:3498150/91‑1 (MQ=255) aaaaTATATTATAATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGgtgt < 1:2276728/91‑1 (MQ=255) aaTATATTATAATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTta > 1:3677506/1‑91 (MQ=255) tatatTATAATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTtata < 1:3761991/91‑1 (MQ=255) atatTATAATGTAAAGAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGACAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATaa > 1:3534881/1‑91 (MQ=255) atatTATAATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATaa > 1:2991603/1‑91 (MQ=255) atatTATAATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATaa < 1:3954856/91‑1 (MQ=255) tattatAATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAAt > 1:1089251/1‑91 (MQ=255) attatAATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATg > 1:2440217/1‑91 (MQ=255) attatAATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATg > 1:16784/1‑91 (MQ=255) ataATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAAt > 1:1015909/1‑91 (MQ=255) ataATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAAt > 1:30211/1‑91 (MQ=255) ataATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAAt > 1:3816467/1‑91 (MQ=255) ataATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAAt > 1:173258/1‑91 (MQ=255) taATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAAtt < 1:687324/91‑1 (MQ=255) ATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTa > 1:460464‑M1/1‑91 (MQ=255) ATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTa > 1:3096244‑M1/1‑91 (MQ=255) aaaataataataaaaggaattaaattcattataacacctcataaatgtaaaaagtatttgacatttatgagGTGTTATAATGAATTTAAtt > 1:1620846‑M2/72‑91 (MQ=255) AAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTc < 1:2733199‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCt > 1:3038288‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCtt > 1:363690‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTttat < 1:2806384‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTCATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTttat < 1:2573806‑M1/91‑1 (MQ=255) TTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTttatt < 1:1052019‑M1/91‑1 (MQ=255) TTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTttatt < 1:341768‑M1/91‑1 (MQ=255) TTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTttatt < 1:3791658‑M1/91‑1 (MQ=255) TTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTttatt < 1:3415156‑M1/91‑1 (MQ=255) TTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATATCAAATACCTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTttatt < 1:3307884‑M1/91‑1 (MQ=255) TTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTttatta < 1:1633030‑M1/91‑1 (MQ=255) aaaaggaattaaattcattataacacCTCATAAATGTAAAAAGTATTTG‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTCttattat < 1:702788‑M1/65‑1 (MQ=255) CATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTtattattat > 1:3234674‑M1/1‑91 (MQ=255) TGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTa > 1:727585‑M1/1‑91 (MQ=255) TGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTa > 1:2008755‑M1/1‑91 (MQ=255) gTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTaa < 1:1367835/91‑1 (MQ=255) gTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTaa > 1:2749411/1‑91 (MQ=255) aTCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAAtt < 1:817636/91‑1 (MQ=255) aTCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAAtt > 1:2771920/1‑91 (MQ=255) tCAAAAATAGTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAAttt < 1:3973072/91‑1 (MQ=255) cAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAAtttt < 1:1340430/91‑1 (MQ=255) cAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAAtttt < 1:640910/91‑1 (MQ=255) aaaaaTATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAAttttt > 1:2234722/1‑91 (MQ=255) aaaaaTATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAAttttt > 1:2861780/1‑91 (MQ=255) aaaaTATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAAtttttt < 1:119893/91‑1 (MQ=255) aaaaTATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAAtttttt > 1:2496845/1‑91 (MQ=255) aaaaTATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAAtttttt < 1:3910629/91‑1 (MQ=255) aaaTATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTc > 1:2142438/1‑91 (MQ=255) aaaTATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTc > 1:3361593/1‑91 (MQ=255) aaaTATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTc < 1:2206744/91‑1 (MQ=255) aaaTATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTc > 1:1119271/1‑91 (MQ=255) atatTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCtt > 1:1268636/1‑91 (MQ=255) tatTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTg > 1:3163754/1‑91 (MQ=255) ttACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGttt < 1:4062497/91‑1 (MQ=255) ttACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGttt < 1:3996685/91‑1 (MQ=255) acacCTCATAAATGTAAAA‑AGTATTTGACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTa < 1:3931314‑M1/87‑1 (MQ=255) acacTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTAt > 1:2896304/1‑91 (MQ=255) acacTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTAt > 1:3068792/1‑91 (MQ=255) acacTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTAt > 1:1899752/1‑91 (MQ=255) CTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGa > 1:1396576‑M1/1‑91 (MQ=255) TCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGAc > 1:2470634‑M1/1‑91 (MQ=255) CATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACg > 1:2403845‑M1/1‑91 (MQ=255) CATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACg > 1:1770067‑M1/1‑91 (MQ=255) CATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACg > 1:181656‑M1/1‑91 (MQ=255) TAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGc < 1:1173945‑M1/91‑1 (MQ=255) TAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGc > 1:798111‑M1/1‑91 (MQ=255) TAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGc > 1:4138936‑M1/1‑91 (MQ=255) TAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGc < 1:1965634‑M1/91‑1 (MQ=255) GTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATaa > 1:425453‑M1/1‑91 (MQ=255) gtaaaaagtatttgacatttatgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTAtaa > 1:1580042‑M2/26‑91 (MQ=255) TCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAAc > 1:2961385‑M1/1‑91 (MQ=255) TCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAAc > 1:836699‑M1/1‑91 (MQ=255) TCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAAc < 1:2946451‑M1/91‑1 (MQ=255) taaaaagtatttgacatttatgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTAtaac > 1:3562126‑M2/25‑91 (MQ=255) taaaaagtatttgacatttatgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTAtaac > 1:4106217‑M2/25‑91 (MQ=255) caaatactttttacattTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTAtaact < 1:2519231‑M2/74‑1 (MQ=255) aaatactttttacattTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTAtaacta < 1:482278‑M2/75‑1 (MQ=255) atactttttacattTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTAtaactaac > 1:3122647‑M2/15‑91 (MQ=255) tactttttacattTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACa < 1:1526098‑M2/78‑1 (MQ=255) ctttttacattTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACaaa < 1:3842867‑M2/80‑1 (MQ=255) ctttttacattTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACaaa < 1:1297825‑M2/80‑1 (MQ=255) tttttacattTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAat < 1:936091‑M2/81‑1 (MQ=255) tttttacattTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACGAACAAat > 1:2076159‑M2/11‑91 (MQ=255) ttttacattTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAata < 1:3713346‑M2/82‑1 (MQ=255) tttacattTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAatat > 1:862261‑M2/9‑91 (MQ=255) ttacattTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATAtt > 1:885861‑M2/8‑91 (MQ=255) tgacatttatgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATAtt > 1:1005664‑M2/14‑91 (MQ=255) tacattTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATAttt < 1:1444452‑M2/85‑1 (MQ=255) atttatgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTAcc < 1:237873‑M2/82‑1 (MQ=255) atttatgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTAcc > 1:957816‑M2/10‑91 (MQ=255) tttatgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCt > 1:577058‑M2/9‑91 (MQ=255) ttatgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCtt > 1:2633748‑M2/8‑91 (MQ=255) tatgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCTTc < 1:1412250‑M2/85‑1 (MQ=255) tatgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCTTc < 1:2304219‑M2/85‑1 (MQ=255) tgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCTTCAg > 1:51068‑M2/5‑91 (MQ=255) tgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCTTCAg > 1:2081959‑M2/5‑91 (MQ=255) tgagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCTTCAg < 1:1549841‑M2/87‑1 (MQ=255) gagGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCTTCAGa < 1:4113369‑M2/88‑1 (MQ=255) agGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCTTCAGaa < 1:2663151‑M2/89‑1 (MQ=255) gGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCTTCAGaaa < 1:2352779‑M2/90‑1 (MQ=255) gtgtTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCTTCAGAAAc > 1:1316215/1‑91 (MQ=255) | TTTAAAATATATTATAATGTAAAAAGTATTTGACATTTGTATCAAAAATATTTACACTCATAAATGTCAAATACTTTTT‑ACATTTATGAGGTGTTATAATGAATTTAATTCCTTTTATTATTATTTTAATTTTTTCTTGTTTATGGACGGCTATAACTAACAAATATTTACCTTCAGAAAC > CP000731/25250‑25430 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |