New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | 51234 = | 112 (1.140) | 5 (0.060) | 5/144 | NT | 5.1% | intergenic (‑32/‑107) | USA300HOU_RS00210/USA300HOU_RS00215 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 51274 = | 85 (0.960) | intergenic (‑72/‑67) | USA300HOU_RS00210/USA300HOU_RS00215 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GCTTAGATTTCTTATTCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGCATAAATGAAGCATTATGATTAGACGCGGAACAAAAAATGGGGAGGGGGGGTATATATTGATACCTACGCTAGAAGAAATT > USA300TCH1516_ALE/51184‑51364 | gctTAGATTTCTTATTCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGc < 1:4126738/91‑1 (MQ=255) gctTAGATTTCTTATTCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGc < 1:588590/91‑1 (MQ=255) gctTAGATTTCTTATTCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGc < 1:3025619/91‑1 (MQ=255) ttgttccgcgtctaatcataatgcttcatttatgcttattatagCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTataat > 1:396343‑M1/45‑91 (MQ=255) aTTTCTTATTCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTataat < 1:3986180/91‑1 (MQ=255) tttCTTATTCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTataata < 1:850163/91‑1 (MQ=255) tttCTTATTCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTataata > 1:779498/1‑91 (MQ=255) tttCTTATTCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTataata > 1:2717086/1‑91 (MQ=255) cTTATTCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGc < 1:1307029/91‑1 (MQ=255) cTTATTCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGc > 1:4107717/1‑91 (MQ=255) ttATTCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGCa > 1:2331778/1‑91 (MQ=255) tCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGCATaaa > 1:620694/1‑91 (MQ=255) tCATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGCATaaa < 1:527063/91‑1 (MQ=255) cATTTTAAAATTCCTCCAATAATTTTTAAGGAGTCAATCAATATCATATAGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGCATAAAt < 1:610904/91‑1 (MQ=255) 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tataGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGCATAAATGAAGCATTATGATTAGACGCGGAACAAAAAATGGGGAGGGGGGGta < 1:1346247/91‑1 (MQ=255) gaGGTTAAACTAACTTCAATTGATTGCTATAATAAGCATAAATGAAGCATTATAATAAGAAGAAAAAAAAAAAATGGGGAGGGGGGGtata < 1:2252145/90‑1 (MQ=255) aGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGCATAAATGAAGCATTATGATTAGACGCGGAACAAAAAATGGGGAGGGGGGGtatat < 1:166645/91‑1 (MQ=255) aGGTTAAACTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGCATAAATGAAGCATTATGATTAGACGCGGAACAAAAAATGGGGAGGGGGGGtatat < 1:4095595/91‑1 (MQ=255) ttAAACTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGCATAAATGAAGCATTATGATTAGACGCGGAACAAAAAATGGGGAGGGGGGGTATATAtt > 1:97694/1‑91 (MQ=255) aatcTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGCATAAATGAAGCATTATGATTAGACGCGGAACAAAAAATGGGGAGGGGGGGTATATATTGa < 1:1019916/88‑1 (MQ=255) aaaCTATCTTCAAGTGATTGCTATAATAAGCATAAATGAAGCATTATGATTAGACGCGGAACAAAAAATGGGGAGGGGGGGTATATATTGa < 1:705828/91‑1 (MQ=255) cTATCTTCAATTGATTGCTATAATAAGCATAAATGAAGCATTATGATTAGACGCGGAACAAAAAATGGGGAGGGGGGGTATATATTGATAc > 1:1364075/1‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |