New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 68692 = | 106 (1.080) | 7 (0.080) | 5/144 | NT | 7.1% | coding (808/852 nt) | USA300TCH1516_00061 | hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 68737 = | 89 (1.010) | intergenic (+1/+99) | USA300TCH1516_00061/arcC1_1 | hypothetical protein/Carbamate kinase 1 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
ATTAAAAACAATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGAACTAAAGTA > USA300TCH1516_ALE/68647‑68827 | ttAAAAACAATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGaa > 1:3351327/1‑91 (MQ=255) tAAAAACAATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAAc < 1:195528/91‑1 (MQ=255) aaaaaCAATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACa < 1:3093699/91‑1 (MQ=255) aaaaCAATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACAt < 1:2288690/91‑1 (MQ=255) aaaaCAATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACAt < 1:2288941/91‑1 (MQ=255) aaaCAATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATg > 1:2891285/1‑91 (MQ=255) aaaCAATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATg > 1:4116965/1‑91 (MQ=255) aCAATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGgt > 1:1546869/1‑91 (MQ=255) cAATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGgtg > 1:1922177/1‑91 (MQ=255) aataataataataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGgtgt > 1:3475102/1‑91 (MQ=255) aataataataataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGgtgt < 1:2888756/91‑1 (MQ=255) ataataataataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGtt > 1:2559071/1‑91 (MQ=255) ataataataataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGtt > 1:2559070/1‑91 (MQ=255) ataataataataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGtt > 1:2656483/1‑91 (MQ=255) taataataataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAACTACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGttt > 1:3405117/1‑91 (MQ=255) taataataataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGttt > 1:2528122/1‑91 (MQ=255) taataataataacaataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGttt > 1:3205510/1‑91 (MQ=255) aataataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTttat < 1:119560/91‑1 (MQ=255) aataataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTttat < 1:1550972/91‑1 (MQ=255) taataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTttatta < 1:869779/91‑1 (MQ=255) taataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTttatta < 1:872399/91‑1 (MQ=255) aataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTaa > 1:2194489/1‑91 (MQ=255) ataataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAg < 1:1275750/91‑1 (MQ=255) aataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGtt > 1:679749/1‑91 (MQ=255) aataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGtt < 1:1885918/91‑1 (MQ=255) aataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGtt > 1:2310546/1‑91 (MQ=255) aataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGtt < 1:1783437/91‑1 (MQ=255) atagtaatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTc < 1:3736751/91‑1 (MQ=255) ataataatCGAATTCAACAAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGtt < 1:727836/91‑1 (MQ=255) ataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTc < 1:1736797/91‑1 (MQ=255) ataataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTc < 1:1736707/91‑1 (MQ=255) taataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGCTcc < 1:3804412/91‑1 (MQ=255) aataatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTccc < 1:1805769/91‑1 (MQ=255) taatCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGt < 1:1902937/91‑1 (MQ=255) tCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGtttt > 1:4094269/1‑91 (MQ=255) aTTGAAC‑AAGAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAgg < 1:3731665/91‑1 (MQ=255) aTTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAgg > 1:3881730/1‑91 (MQ=255) ttCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAggg < 1:2948217/91‑1 (MQ=255) aac‑aaAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTc > 1:2725961/1‑91 (MQ=255) aac‑aaAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTc < 1:1852796/91‑1 (MQ=255) aac‑aaAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTc < 1:1851550/91‑1 (MQ=255) aac‑aaAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTc < 1:754951/91‑1 (MQ=255) aac‑aaAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTc > 1:2723241/1‑91 (MQ=255) ac‑aaAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCa > 1:3010150/1‑91 (MQ=255) ac‑aaAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCa < 1:1355317/91‑1 (MQ=255) ac‑aaAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCa > 1:2112142/1‑91 (MQ=255) ac‑aaAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCa > 1:864664/1‑91 (MQ=255) ac‑aaAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCa > 1:842974/1‑91 (MQ=255) ac‑aaAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGCTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCa > 1:2244644/1‑91 (MQ=255) aaaaaCTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGt > 1:1290439/1‑91 (MQ=255) aaaaaCTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGt < 1:2570237/91‑1 (MQ=255) aaaaaCTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGt > 1:3904798/1‑91 (MQ=255) aCTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGccc < 1:1038811/91‑1 (MQ=255) CTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCt > 1:1254605‑M1/1‑91 (MQ=255) CTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCt > 1:780943‑M1/1‑91 (MQ=255) CTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCt > 1:1958678‑M1/1‑91 (MQ=255) ggctattaattctctgtattttacaggggataagtagcctagAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTCCAGTGCCCTAgg > 1:3631955‑M2/43‑91 (MQ=255) gctattaattctctgtattttacaggggataagtagcctagAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGa > 1:1044211‑M2/42‑91 (MQ=255) gctattaattctctgtattttacaggggataagtagcctagAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGa > 1:3374044‑M2/42‑91 (MQ=255) CTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGAt < 1:3489615‑M1/91‑1 (MQ=255) tattaattctctgtattttacaggggataagtagcctagAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGAtt > 1:2028040‑M2/40‑91 (MQ=255) cTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATtat < 1:1312205/91‑1 (MQ=255) ttATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATtata < 1:3363287/91‑1 (MQ=255) tATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAg < 1:1585897/91‑1 (MQ=255) tCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGc > 1:2795598/1‑91 (MQ=255) ccccTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGct < 1:1170459/91‑1 (MQ=255) ccTGTAAAATACAGAGAATCAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGATTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGctct > 1:4122930/1‑91 (MQ=255) tGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCttt < 1:3795788/91‑1 (MQ=255) tGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCttt < 1:1771377/91‑1 (MQ=255) gTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATTGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGTATTATAGGCTCtttt < 1:3536035/91‑1 (MQ=255) tAAAATACATAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTg < 1:3964972/91‑1 (MQ=255) aaaaTACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTGAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGt > 1:3192352/1‑91 (MQ=255) tACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTtat > 1:489117/1‑91 (MQ=255) aCAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTtata < 1:3084731/91‑1 (MQ=255) cAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATaa > 1:883357/1‑91 (MQ=255) gagaATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAg < 1:3613768/91‑1 (MQ=255) gagaATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAg > 1:2556411/1‑91 (MQ=255) gagaATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAg > 1:2556441/1‑91 (MQ=255) agaATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAgg < 1:1556554/91‑1 (MQ=255) agaATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAgg > 1:3873567/1‑91 (MQ=255) gaATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGt > 1:3170125/1‑91 (MQ=255) gaATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGt > 1:1170798/1‑91 (MQ=255) aaTTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTa < 1:1182425/91‑1 (MQ=255) aTTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTaa < 1:1794218/91‑1 (MQ=255) ttAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAAt > 1:550770/1‑91 (MQ=255) ttAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAAt < 1:1654995/91‑1 (MQ=255) aaTAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTg < 1:3252404/91‑1 (MQ=255) aaTAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTg < 1:334593/91‑1 (MQ=255) aTAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGa > 1:3940188/1‑91 (MQ=255) aTAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGa < 1:269175/91‑1 (MQ=255) aTAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGa > 1:1406659/1‑91 (MQ=255) agcctagAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGAAc > 1:821673‑M2/8‑91 (MQ=255) agcctagAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGAAc > 1:1134194‑M2/8‑91 (MQ=255) gcctagAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGAACt < 1:2103212‑M2/85‑1 (MQ=255) cctagAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGAACTa > 1:271381‑M2/6‑91 (MQ=255) ctagAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGAACTaa > 1:2486531‑M2/5‑91 (MQ=255) ctagAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGAACTaa > 1:2487096‑M2/5‑91 (MQ=255) agAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGAACTAAAg < 1:2545032‑M2/89‑1 (MQ=255) aaCATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGAACTAAAGta < 1:188310/91‑1 (MQ=255) aaCATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGAACTAAAGta < 1:4089383/91‑1 (MQ=255) | ATTAAAAACAATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAAC‑AAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCTTTTGTTTATAAAGGTAATTGAACTAAAGTA > USA300TCH1516_ALE/68647‑68827 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |