| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 75986 | 68 (0.690) | 21 (0.270) | 11/128 | NT | 26.3% | intergenic (+44/‑229) | USA300HOU_RS00335/USA300HOU_RS00140 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 76003 | 63 (0.800) | intergenic (+61/‑212) | USA300HOU_RS00335/USA300HOU_RS00140 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
AGTTCTGTCCCAGTACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCA > USA300TCH1516_ALE/75913‑76093 | gtgatacaggtgcagcaatattagttatattaaattcattacgtttattaaaaaaataAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCgagag > 1:1262979‑M1/59‑91 (MQ=255)gtgatacaggtgcagcaatattagttatattaaattcattacgtttattaaaaaaataAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCgagag > 1:355304‑M1/59‑91 (MQ=255) tgatacaggtgcagcaatattagttatattaaattcattacgtttattaaaaaaataAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCgagaga > 1:1613100‑M1/58‑91 (MQ=255) gTTCTGTCCCAGTACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGa > 1:333759‑M2/1‑90 (MQ=255) ttCTGTCCCAGTACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGag < 1:1564291‑M2/91‑3 (MQ=255) cTGTCCCAGTACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagta < 1:199941‑M2/91‑5 (MQ=255) cTGTCCCAGTACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagta < 1:3715523‑M2/91‑5 (MQ=255) cTGTCCCAGTACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagta < 1:2382800‑M2/91‑5 (MQ=255) cccAGTACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtattta < 1:1957425‑M2/91‑9 (MQ=255) gtgcagcaatattagttatattaaattcattacgtttattaaaaaaataAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAg > 1:2579778‑M1/50‑91 (MQ=255) ccAGTACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttag < 1:1367361‑M2/91‑10 (MQ=255) tgcagcaatattagttatattaaattcattacgtttattaaaaaaataAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAgg > 1:3692471‑M1/49‑91 (MQ=255) tgcagcaatattagttatattaaattcattacgtttattaaaaaaataAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAgg > 1:1878247‑M1/49‑91 (MQ=255) cAGTACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttagg < 1:474498‑M2/91‑11 (MQ=255) aGTACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggc < 1:1896546‑M2/91‑12 (MQ=255) tACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctt < 1:2716792‑M2/91‑14 (MQ=255) tACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctt > 1:2562818‑M2/1‑78 (MQ=255) tACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctt < 1:276733‑M2/91‑14 (MQ=255) tACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctt < 1:276923‑M2/91‑14 (MQ=255) gcaatattagttatattaaattcattacgtttattaaaaaaataAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCttt > 1:2104114‑M1/45‑91 (MQ=255) aCTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggcttt < 1:3842627‑M2/91‑15 (MQ=255) caatattagttatattaaattcattacgtttattaaaaaaataAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCtttt > 1:1458206‑M1/44‑91 (MQ=255) cTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctttt > 1:2894781‑M2/1‑76 (MQ=255) cTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctttt > 1:4029445‑M2/1‑76 (MQ=255) tAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggcttttt > 1:3634117‑M2/1‑75 (MQ=255) tAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggcttttt > 1:1557520‑M2/1‑75 (MQ=255) aaTTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCtttttt < 1:4120665/91‑1 (MQ=255) ttagttatattaaattcattacgtttattaaaaaaataAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTATGCTTTTTTAtt > 1:3444791‑M1/39‑91 (MQ=255) tGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTAtt > 1:2985368/1‑91 (MQ=255) gTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTCAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTAttt > 1:3296778/1‑91 (MQ=255) gTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTAttt < 1:1874253/91‑1 (MQ=255) ttAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTAtttt < 1:1061282/91‑1 (MQ=255) taaataaaCATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTAttttt < 1:1396317/91‑1 (MQ=255) aataaaCATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTAttttttt > 1:255882/1‑91 (MQ=255) aCATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTtaataa > 1:2262433/1‑91 (MQ=255) aCATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTtaataa > 1:1424624/1‑91 (MQ=255) cATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATaaa > 1:2388082/1‑91 (MQ=255) cATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATaaa > 1:1001947/1‑91 (MQ=255) cATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATaaa < 1:167175/91‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACg > 1:508974/1‑91 (MQ=255) aagaagTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGt > 1:585145/1‑91 (MQ=255) aagaagTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGt > 1:3036852/1‑91 (MQ=255) gaagTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTaa < 1:2025736/91‑1 (MQ=255) aGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAAtt > 1:865273/1‑91 (MQ=255) aaaTTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTa > 1:1025844/1‑91 (MQ=255) aTTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAat < 1:1595562/91‑1 (MQ=255) ttattaATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAatat < 1:1197514/91‑1 (MQ=255) attaATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATaa > 1:3662301/1‑91 (MQ=255) aaaaaataAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATaa > 1:3955701‑M1/9‑91 (MQ=255) ttaATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctttttgaattaataaatttcttacttcttatgtttattta < 1:2480086‑M2/91‑52 (MQ=255) aaTTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTa > 1:583427/1‑91 (MQ=255) ttCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAat > 1:3816089/1‑91 (MQ=255) tCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAata < 1:611353/91‑1 (MQ=255) AAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATAtt > 1:2669449‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATAtt > 1:1205066‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATtgctg > 1:157457‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAACATtgctg < 1:2065347‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATtgctgc > 1:3192554‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCa < 1:2515929‑M1/91‑1 (MQ=255) CTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCAc > 1:1424641‑M1/1‑91 (MQ=255) tAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctttttgaattaataaatttcttacttcttatgtttatttaacaattagtactggg < 1:3647295‑M2/91‑67 (MQ=255) TAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCAcc > 1:3905676‑M1/1‑91 (MQ=255) aaaTACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctttttgaattaataaatttcttacttcttatgtttatttaacaattagtactggga < 1:2999468‑M2/91‑68 (MQ=255) aaaTACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctttttgaattaataaatttcttacttcttatgtttatttaacaattagtactggga < 1:2998257‑M2/91‑68 (MQ=255) AAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCt > 1:2687905‑M1/1‑91 (MQ=255) AAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCt > 1:1254513‑M1/1‑91 (MQ=255) aaTACTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctttttgaattaataaatttcttacttcttatgtttatttaacaattagtactgggac < 1:2613712‑M2/91‑69 (MQ=255) AATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTg > 1:3404103‑M1/1‑91 (MQ=255) AATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTg < 1:2634767‑M1/91‑1 (MQ=255) aCTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctttttgaattaataaatttcttacttcttatgtttatttaacaattagtactgggacaga < 1:3583819‑M2/91‑72 (MQ=255) ACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTAt > 1:441013‑M1/1‑91 (MQ=255) ACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTAt > 1:3357486‑M1/1‑91 (MQ=255) cTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctttttgaattaataaatttcttacttcttatgtttatttaacaattagtactgggacagaa < 1:3202946‑M2/91‑73 (MQ=255) cTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctttttgaattaataaatttcttacttcttatgtttatttaacaattagtactgggacagaa < 1:739607‑M2/91‑73 (MQ=255) cTTTCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctttttgaattaataaatttcttacttcttatgtttatttaacaattagtactgggacagaa < 1:2625683‑M2/91‑73 (MQ=255) CTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATc > 1:1080022‑M1/1‑91 (MQ=255) CTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATc < 1:1121759‑M1/91‑1 (MQ=255) tttCTCACAAATCGAGAGagtatttaggctttttgaattaataaatttcttacttcttatgtttatttaacaattagtactgggacagaac < 1:2411820‑M2/91‑74 (MQ=255) tctcACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACt < 1:3829854/91‑1 (MQ=255) tctcACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACt > 1:198534/1‑91 (MQ=255) ctcACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACtt > 1:1058586/1‑91 (MQ=255) ctcACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACtt < 1:3964661/91‑1 (MQ=255) tcACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTa > 1:3464133/1‑91 (MQ=255) cacaAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAg < 1:30949/91‑1 (MQ=255) cacaAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAg < 1:2438808/91‑1 (MQ=255) cacaAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAg < 1:31703/91‑1 (MQ=255) cacaAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAg < 1:32194/91‑1 (MQ=255) acaAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGa < 1:2014503/91‑1 (MQ=255) aaTCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACa > 1:886089/1‑91 (MQ=255) aTCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAg < 1:2245015/91‑1 (MQ=255) tCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGc > 1:1760934/1‑91 (MQ=255) tCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGc > 1:1468288/1‑91 (MQ=255) tCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAAAGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGTACATGTATCACTTAGAAGAGc > 1:2353226/1‑91 (MQ=255) agagagTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTaa < 1:1771091/91‑1 (MQ=255) agagagTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTaa < 1:1278135/91‑1 (MQ=255) gagagTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAAc > 1:516514/1‑91 (MQ=255) gagagTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAAc > 1:2038888/1‑91 (MQ=255) gagagTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAAc < 1:800251/91‑1 (MQ=255) agagTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAAcc > 1:1962901/1‑91 (MQ=255) gagTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCa > 1:1576743/1‑91 (MQ=255) | AGTTCTGTCCCAGTACTAATTGTTAAATAAACATAAGAAGTAAGAAATTTATTAATTCAAAAAGCCTAAATACTTTCTCACAAATCGAGAGAGTATTTAGGCTTTTTTATTTTTTTAATAAACGTAATGAATTTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCA > USA300TCH1516_ALE/75913‑76093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |