New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 153874 | 111 (1.130) | 6 (0.070) | 5/150 | NT | 5.4% | intergenic (+46/‑222) | rfbX/sodM | Putative O‑antigen transporter/Superoxide dismutase [Mn/Fe] 2 |
? | USA300TCH1516_ALE | = 153903 | 106 (1.150) | intergenic (+75/‑193) | rfbX/sodM | Putative O‑antigen transporter/Superoxide dismutase [Mn/Fe] 2 |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
ACATAAAACAATTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGAATATTT > USA300TCH1516_ALE/153813‑153993 | aCATAAAACAATTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGt > 1:3145121/1‑91 (MQ=255) aaaCAATTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTctttt < 1:529435‑M2/91‑6 (MQ=255) aaaCAATTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTctttt > 1:1156650‑M2/1‑86 (MQ=255) aaaCAATTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTctttt < 1:1171005‑M2/91‑6 (MQ=255) aaCAATTTAAGTACCCGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCCATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCttttt > 1:3536146/1‑91 (MQ=255) aCAATTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCtttttt > 1:4135130/1‑91 (MQ=255) aCAATTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCtttttt < 1:2143248/91‑1 (MQ=255) cAATTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTa > 1:1009795/1‑91 (MQ=255) cAATTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTa > 1:2453057/1‑91 (MQ=255) cAATTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTa > 1:2088755/1‑91 (MQ=255) cAATTTAAGCACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTa > 1:2088567/1‑91 (MQ=255) aaTTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTaa > 1:1804084/1‑91 (MQ=255) aaTTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTaa > 1:2259898/1‑91 (MQ=255) aTTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAAt > 1:1206163/1‑91 (MQ=255) aTTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAAt < 1:2385763/91‑1 (MQ=255) tttAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAAtt < 1:805288/91‑1 (MQ=255) tAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATtct > 1:3177734/1‑91 (MQ=255) aaGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATtctc > 1:2865890/1‑91 (MQ=255) aaGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATtctc > 1:440520/1‑91 (MQ=255) aGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTctct > 1:1992783/1‑91 (MQ=255) aGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTctct < 1:1769644/91‑1 (MQ=255) gTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCtt > 1:2159153/1‑91 (MQ=255) gTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCtt > 1:2158838/1‑91 (MQ=255) aCCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTa > 1:1978110/1‑91 (MQ=255) aCCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTa < 1:220487/91‑1 (MQ=255) aCCGGTAATGCTATACTTTAGAAAAGTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTa < 1:1540739/91‑1 (MQ=255) ccGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTaa > 1:2845801/1‑91 (MQ=255) ggTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTaaaa > 1:3956145/1‑91 (MQ=255) aaTGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCg < 1:2699447/91‑1 (MQ=255) aTGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCgg < 1:129704/91‑1 (MQ=255) tGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCggg < 1:3259866/91‑1 (MQ=255) tGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCggg > 1:1006000/1‑91 (MQ=255) cTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGaa > 1:1411965/1‑91 (MQ=255) taCTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACa < 1:1600402/91‑1 (MQ=255) taCTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACa < 1:1589183/91‑1 (MQ=255) taCTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACa < 1:3929883/91‑1 (MQ=255) cTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGATAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACaaa < 1:3858856/91‑1 (MQ=255) tttAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACaaaa < 1:1117925/91‑1 (MQ=255) tttAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACaaaa > 1:379540/1‑91 (MQ=255) ttAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAg < 1:2915583/91‑1 (MQ=255) ttAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAg < 1:4083718/91‑1 (MQ=255) tAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGc > 1:2658515/1‑91 (MQ=255) aGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCa < 1:36244/91‑1 (MQ=255) aGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCa > 1:1015540/1‑91 (MQ=255) aGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCa < 1:1756462/91‑1 (MQ=255) aGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCa > 1:1287805/1‑91 (MQ=255) aaTTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTa < 1:2001185/91‑1 (MQ=255) ttatgattaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTaaa < 1:3265951/91‑1 (MQ=255) ttaagattaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTaaa > 1:886052/1‑91 (MQ=255) ttaagattaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTaaa > 1:4029701/1‑91 (MQ=255) taagattaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAAt < 1:3910654/91‑1 (MQ=255) taagattaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAAt < 1:1897084/91‑1 (MQ=255) aagattaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATg > 1:757311/1‑91 (MQ=255) aagattaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATg > 1:1983766/1‑91 (MQ=255) agattaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGc < 1:2808086/91‑1 (MQ=255) gattaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTcttttcttcttaatcttaattttctaaagtatagcattaccggtact < 1:1973197‑M2/91‑48 (MQ=255) gattaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGcc > 1:248611/1‑91 (MQ=255) attaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCt > 1:3597473/1‑91 (MQ=255) attaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCt < 1:3749399/91‑1 (MQ=255) attaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCt < 1:3090342/91‑1 (MQ=255) attaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCt > 1:2904898/1‑91 (MQ=255) attaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCt > 1:254315/1‑91 (MQ=255) ttaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCtt < 1:1853540/91‑1 (MQ=255) ttaagaAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCtt < 1:1644539/91‑1 (MQ=255) agaagaAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTcttttcttcttaatcttaattttctaaagtatagcattaccggtacttaaat < 1:1196284‑M2/91‑53 (MQ=255) agaagaAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCttttt < 1:1743430/91‑1 (MQ=255) agaagaAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCttttt < 1:1950580/91‑1 (MQ=255) gaagaaAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTg < 1:3696283/91‑1 (MQ=255) gaaAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTcttttcttcttaatcttaattttctaaagtatagcattaccggtacttaaattgtt < 1:1012801‑M2/91‑57 (MQ=255) gaaAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCAt < 1:2585789/91‑1 (MQ=255) aaaGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTc < 1:4092453/91‑1 (MQ=255) aGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCaa > 1:345154/1‑91 (MQ=255) gCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTcttttcttcttaatcttaattttctaaagtatagcattaccggtacttaaattgttttatgt < 1:2438908‑M2/91‑63 (MQ=255) gCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTcttttcttcttaatcttaattttctaaagtatagcattaccggtacttaaattgttttatgt < 1:2443621‑M2/91‑63 (MQ=255) gCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCaata < 1:538464/91‑1 (MQ=255) gCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCaata > 1:350956/1‑91 (MQ=255) aTTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCaatatta > 1:4017877/1‑91 (MQ=255) ttCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCaatattaaa < 1:1675200/91‑1 (MQ=255) tCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCaatattaaat < 1:1071661/91‑1 (MQ=255) aTTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCaatattaaatatta > 1:30479/1‑91 (MQ=255) ttGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCaatattaaatattaa > 1:1559822/1‑90 (MQ=255) ttGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAAtattat > 1:1585053/1‑91 (MQ=255) gAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTatat < 1:3666789/91‑1 (MQ=255) aaaaTGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCa > 1:1948273/1‑91 (MQ=255) aaaTGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCaa < 1:2597357/91‑1 (MQ=255) aTGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAAtt > 1:273043/1‑91 (MQ=255) ggAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTc < 1:1314095/91‑1 (MQ=255) ggAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTc > 1:3621851/1‑91 (MQ=255) aaGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGa > 1:3519921/1‑91 (MQ=255) aGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGaa > 1:1454402/1‑91 (MQ=255) aGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGaa > 1:1453880/1‑91 (MQ=255) aGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGaa > 1:1436816/1‑91 (MQ=255) ttGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGAata > 1:3766624/1‑91 (MQ=255) ttGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGAata < 1:2262771/91‑1 (MQ=255) ttGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGAata > 1:1476925/1‑91 (MQ=255) tGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATGAATTTCGAatat < 1:3205867/91‑1 (MQ=255) gTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGAATAtt < 1:726796/91‑1 (MQ=255) gTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGAATAtt < 1:727314/91‑1 (MQ=255) gTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGAATAtt < 1:2208949/91‑1 (MQ=255) gTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGAATAtt < 1:3405345/91‑1 (MQ=255) | ACATAAAACAATTTAAGTACCGGTAATGCTATACTTTAGAAAATTAAGATTAAGAAGAAAAGGCAATTTCTTATTGAAAAATGGAAGTTGTCTTTTTTAATTCTCTTTAAAAGCGGGAAACAAAAGCAGTTAAATGCCTTTTTGCATTCAATATTAAATATTATATCAATTTCGAATATTT > USA300TCH1516_ALE/153813‑153993 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |