New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 329202 = | 116 (1.180) | 11 (0.130) | 8/140 | NT | 11.3% | intergenic (+70/+73) | USA300HOU_RS01475/ssaA2_1 | hypothetical protein/Staphylococcal secretory antigen ssaA2 |
? | USA300TCH1516_ALE | 329255 = | 71 (0.830) | intergenic (+123/+20) | USA300HOU_RS01475/ssaA2_1 | hypothetical protein/Staphylococcal secretory antigen ssaA2 |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
TTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTCACC > USA300TCH1516_ALE/329165‑329343 | tttCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCtttt < 1:4061075/91‑1 (MQ=255) tCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTa > 1:3938783/1‑91 (MQ=255) cTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTAt < 1:918761/91‑1 (MQ=255) cTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTAt > 1:3444869/1‑91 (MQ=255) aaTTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGt < 1:422480/91‑1 (MQ=255) aTTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTc > 1:1836618/1‑91 (MQ=255) aTTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTc > 1:1836804/1‑91 (MQ=255) aTTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTc > 1:1694498/1‑91 (MQ=255) aTTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTc > 1:4059990/1‑91 (MQ=255) aTTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTc < 1:904339/91‑1 (MQ=255) aTTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTc < 1:3661585/91‑1 (MQ=255) aTTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTc < 1:3661285/91‑1 (MQ=255) ttttATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCa > 1:4131031/1‑91 (MQ=255) ttttATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCa < 1:3570446/91‑1 (MQ=255) ataATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGAt < 1:1579963/91‑1 (MQ=255) taATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGAtt > 1:3697897/1‑91 (MQ=255) taATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGAtt < 1:3802423/91‑1 (MQ=255) aaTCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGAtta > 1:3320093/1‑91 (MQ=255) aTCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGAttaa > 1:2609689/1‑91 (MQ=255) cGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGAttaatt > 1:3303955/1‑91 (MQ=255) gAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGAttaattt < 1:633505/91‑1 (MQ=255) aaTAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGAttaattta < 1:3477237/91‑1 (MQ=255) aTAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGAttaatttaa > 1:894332/1‑91 (MQ=255) tAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGAttaatttaat < 1:3777316/91‑1 (MQ=255) aCATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATgg > 1:1177203/1‑91 (MQ=255) cATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGa < 1:878263/91‑1 (MQ=255) cATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGa < 1:876044/91‑1 (MQ=255) aTACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGAt > 1:3356831/1‑91 (MQ=255) aTACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGAt > 1:3031931/1‑91 (MQ=255) tACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATg < 1:2621991/91‑1 (MQ=255) caataaaaagcgaccagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttATTTTGTATGTCATGATTAATTTAATGGATGt > 1:3216745‑M2/60‑91 (MQ=255) ataaaaagcgaccagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAAt > 1:1557295‑M2/58‑91 (MQ=255) aaaTAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAAt < 1:3484349/91‑1 (MQ=255) tAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATtat > 1:1696769/1‑91 (MQ=255) AAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATtata > 1:2710756‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTatat < 1:2167667‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTatat < 1:557665‑M1/91‑1 (MQ=255) GCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatga > 1:3578621‑M1/1‑91 (MQ=255) GCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatga < 1:2764887‑M1/91‑1 (MQ=255) GCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatga > 1:722806‑M1/1‑91 (MQ=255) cgaccagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaatttggtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatgat > 1:3691777‑M2/50‑91 (MQ=255) cgaccagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaatttggtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatgat > 1:3692390‑M2/50‑91 (MQ=255) CGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatgat < 1:3028457‑M1/91‑1 (MQ=255) accagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATAtgatga > 1:55168‑M2/48‑91 (MQ=255) accagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATAtgatga > 1:1034349‑M2/48‑91 (MQ=255) ACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATAtgatga < 1:2631805‑M1/91‑1 (MQ=255) cagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGaaa > 1:3429672‑M2/46‑91 (MQ=255) CAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGaaa < 1:1731002‑M1/91‑1 (MQ=255) aTTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACt > 1:1525924/1‑91 (MQ=255) aTTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACt > 1:1526038/1‑91 (MQ=255) ttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACtt < 1:3360403‑M2/49‑1 (MQ=255) tttGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTc < 1:3814348/91‑1 (MQ=255) tttGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTc > 1:3422903/1‑91 (MQ=255) tcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTc > 1:1559737‑M2/42‑91 (MQ=255) tGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTg < 1:1457924/91‑1 (MQ=255) gCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGa > 1:532039/1‑91 (MQ=255) gCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGa < 1:3551929/91‑1 (MQ=255) gCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGa > 1:2657423/1‑91 (MQ=255) aGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAg < 1:3046122/91‑1 (MQ=255) aGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAg > 1:2678760/1‑91 (MQ=255) gtgtTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGc > 1:3760333/1‑91 (MQ=255) ttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCa > 1:2028114‑M2/35‑91 (MQ=255) tgtTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCa < 1:3459783/91‑1 (MQ=255) tgtTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCa > 1:4152886/1‑91 (MQ=255) tgtTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCa < 1:579994/91‑1 (MQ=255) gtTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCAGAAGCag > 1:2078871/1‑91 (MQ=255) ttACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCaga > 1:2750060/1‑91 (MQ=255) tacaattcgtaacactgcgaactggtcgctttTTATTC‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCaga > 1:3516559‑M2/33‑91 (MQ=255) tACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCagag < 1:3800150/91‑1 (MQ=255) aCGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAgaga < 1:2834774/91‑1 (MQ=255) aCGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATATAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAgaga < 1:3690659/91‑1 (MQ=255) cGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGAt < 1:2713277/91‑1 (MQ=255) gTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCt > 1:1702844/1‑91 (MQ=255) gTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCt > 1:1563870/1‑91 (MQ=255) gTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCt > 1:761807/1‑91 (MQ=255) aaaCTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtg < 1:3087887/91‑1 (MQ=255) aaaCTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtg < 1:1952208/91‑1 (MQ=255) aaCTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtga < 1:3997227/91‑1 (MQ=255) aaCTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtga > 1:1179417/1‑91 (MQ=255) cTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtgatg > 1:2031865/1‑91 (MQ=255) aaCTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACg > 1:132854/1‑91 (MQ=255) aCTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTATTTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGa < 1:3283580/91‑1 (MQ=255) aCTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGa < 1:2012752/91‑1 (MQ=255) aCTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGa < 1:2867080/91‑1 (MQ=255) aCTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGa < 1:3159557/91‑1 (MQ=255) cTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGat > 1:445666/1‑91 (MQ=255) ggtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGatat > 1:2363902‑M2/10‑91 (MQ=255) ggtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGatat > 1:2363967‑M2/10‑91 (MQ=255) ggtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGatat > 1:2364921‑M2/10‑91 (MQ=255) gtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGatata > 1:351171‑M2/9‑91 (MQ=255) gtcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGatata < 1:3088751‑M2/83‑1 (MQ=255) tcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGatatat > 1:1084276‑M2/8‑91 (MQ=255) tcgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGatatat > 1:1085166‑M2/8‑91 (MQ=255) cgctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATAtt > 1:2270504‑M2/7‑91 (MQ=255) gctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTc < 1:3167051‑M2/86‑1 (MQ=255) gctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTc < 1:1728786‑M2/86‑1 (MQ=255) ctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTCa < 1:1368995‑M2/87‑1 (MQ=255) ctttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTCa > 1:968715‑M2/5‑91 (MQ=255) tttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTCAc < 1:982180‑M2/88‑1 (MQ=255) ttTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTCAcc < 1:1790956‑M2/89‑1 (MQ=255) | TTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTG‑ATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTCACC > USA300TCH1516_ALE/329165‑329343 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |