New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 347535 | 94 (0.960) | 6 (0.080) +TAGACAATCTTAATGT |
5/128 | NT | 7.5% | coding (489/501 nt) | yezG_3 | putative antitoxin YezG |
? | USA300TCH1516_ALE | = 348599 | 92 (0.940) | intergenic (+44/‑166) | yezG_5/USA300HOU_RS01580 | putative antitoxin YezG/hypothetical protein |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
AGGAGGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATAAAGTTGTCATCAAATAATAATATAAAGATAATTTTAGGCTTTTATACTTTTAATCG > USA300TCH1516_ALE/348509‑348689 | aggaggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCtt < 1:3007480/91‑1 (MQ=255) aggaggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCtt < 1:3783408/91‑1 (MQ=255) ggaggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCttt > 1:2023179/1‑91 (MQ=255) ggaggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCttt > 1:2969150/1‑91 (MQ=255) gaggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCtttt < 1:564224/91‑1 (MQ=255) gaggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCtttt > 1:2075629/1‑91 (MQ=255) gaggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCtttt > 1:610687/1‑91 (MQ=255) aggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGGAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCttttt < 1:1677284/91‑1 (MQ=255) aggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCttttt < 1:804288/91‑1 (MQ=255) aggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCttttt > 1:795800/1‑91 (MQ=255) aggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCttttt > 1:795930/1‑91 (MQ=255) aggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCttttt < 1:2063583/91‑1 (MQ=255) aggTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCttttt < 1:2651484/91‑1 (MQ=255) ttAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGc > 1:2513250/1‑91 (MQ=255) 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aaTATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAAc > 1:383882/1‑91 (MQ=255) aaTATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCCTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAAc < 1:2393076/91‑1 (MQ=255) atatatTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACa > 1:2997884/1‑91 (MQ=255) tatatTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACaa < 1:216100/91‑1 (MQ=255) atTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATag > 1:2138897/1‑91 (MQ=255) atTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAATCTTacattaagattgtctattcttcttgc < 1:831237‑M2/91‑27 (MQ=255) ttAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATaga > 1:1423820/1‑91 (MQ=255) tAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATagag > 1:2336249/1‑91 (MQ=255) tAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATagag < 1:2263869/91‑1 (MQ=255) tAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATagag > 1:2335013/1‑91 (MQ=255) tAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATagag > 1:2336196/1‑91 (MQ=255) aaaGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAgaga > 1:3057843/1‑91 (MQ=255) aaGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGAc > 1:3900221/1‑91 (MQ=255) aaGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGAc > 1:2942361/1‑91 (MQ=255) gagCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCa > 1:2425728/1‑91 (MQ=255) agCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCAt < 1:2182950/91‑1 (MQ=255) cAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATaa > 1:1345648/1‑91 (MQ=255) aagaagAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATaaa < 1:2771300/91‑1 (MQ=255) aagaagAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATaaa < 1:1895434/91‑1 (MQ=255) aagaagAATAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATaaa > 1:3136793/1‑91 (MQ=255) gaagaaTAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATAAAGt > 1:859154/1‑91 (MQ=255) agaaTAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATAAAGTTg > 1:3094763/1‑91 (MQ=255) aTAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATAAAGTTGtca < 1:396673/91‑1 (MQ=255) aTAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATAAAGTTGtca < 1:1357936/91‑1 (MQ=255) tAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATAAAGTTGtcat > 1:3650648/1‑91 (MQ=255) tAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATAAAGTTGtcat > 1:3650442/1‑91 (MQ=255) tAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATAAAGTTGtcat < 1:3635676/91‑1 (MQ=255) tAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATAAAGTTGtcat > 1:3650433/1‑91 (MQ=255) tAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATAAAGTTGtcat > 1:493627/1‑91 (MQ=255) tAGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGT‑AAAAACAATAGAGACCATAAAGTTGtcatc > 1:4113820/1‑91 (MQ=255) aGACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATAAAGTTGtcatc > 1:1022976/1‑91 (MQ=255) gACAATCTTAATGTAAGATTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAACAATAGAGACCATAAAGTTGtcatca > 1:3953537/1‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |